Page 89 - 《广西植物》2024年第7期
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Guihaia Jul. 2024ꎬ 44(7): 1289-1298
DOI: 10.11931/ guihaia.gxzw202309018
马洪宇ꎬ 翟莹ꎬ 张军ꎬ 等ꎬ 2024. 大豆膨胀素基因 GmEXPB5 和 GmEXPB7 生物信息学及表达分析 [J]. 广西植物ꎬ 44(7):
1289-1298.
MA HYꎬ ZHAI Yꎬ ZHANG Jꎬ et al.ꎬ 2024. Bioinformatics and expression analysis of expansin genes GmEXPB5 and GmEXPB7
in soybean [J]. Guihaiaꎬ 44(7): 1289-1298.
大豆膨胀素基因 GmEXPB5 和 GmEXPB7
生物信息学及表达分析
马洪宇 ꎬ 翟 莹 ꎬ 张 军 ꎬ 陈炯辛 ꎬ 张 勇 ꎬ 马天意 ꎬ 李珊珊 1
1
1
2
1
3
1∗
( 1. 齐齐哈尔大学 生命科学与农林学院ꎬ 黑龙江 齐齐哈尔 161006ꎻ 2. 黑龙江省农业科学院畜牧兽医分院ꎬ
黑龙江 齐齐哈尔 161005ꎻ 3. 黑龙江省农业科学院克山分院ꎬ 黑龙江 齐齐哈尔 161606 )
摘 要: 膨胀素(expansinꎬEXP)通过调控细胞壁的松弛在植物应对环境胁迫过程中起着重要作用ꎮ 为研究
EXP 基因在大豆应对非生物胁迫过程中的作用ꎬ该文对大豆中的两个 EXP 基因( GmEXPB5 和 GmEXPB7)
及其蛋白序列进行生物信息学分析ꎬ通过实时荧光定量 PCR(qRT ̄PCR) 检测基因表达量ꎮ 结果表明:(1)
GmEXPB5 和 GmEXPB7 分别位于大豆第 10 号和第 12 号染色体上ꎬ编码的蛋白序列长度分别为 272 和 267
个氨基酸ꎮ GmEXPB5 蛋白分子量为 29.07 kDꎬ理论等电点为 7.51ꎻGmEXPB7 蛋白分子量为 29.09 kDꎬ理论
等电点为 8.66ꎮ GmEXPB5 和 GmEXPB7 均为稳定的亲水蛋白且定位于细胞壁中ꎮ GmEXPB5 和 GmEXPB7
蛋白均含有一段信号肽序列和一个保守的 DPBB_1 结构域ꎮ (2) GmEXPB5 蛋白与鹰嘴豆 CaEXPB15 蛋白
亲缘关系最近ꎬGmEXPB7 蛋白与密花豆、赤豆和豇豆的 EXPB3 蛋白有着较近的亲缘关系ꎮ (3) GmEXPB5
和 GmEXPB7 在大豆根、茎和叶中均有表达且它们在根和叶中的表达量均显著高于茎中的表达量ꎮ (4)
GmEXPB5 和 GmEXPB7 在大豆幼苗中可以响应盐、干旱和低温胁迫ꎮ (5) GmEXPB5 启动子区域含有 2 种
与逆境相关的顺式作用元件(ABRE 和 ARE)ꎻGmEXPB7 启动子区域含有 5 种与逆境相关的顺式作用元件
(ABRE、ARE、CGTCA ̄motif、TC ̄rich repeats 和 MBS)ꎮ 综上所述ꎬGmEXPB5 和 GmEXPB7 能够参与大豆对非
生物胁迫的应答ꎮ
关键词: 大豆ꎬ 膨胀素ꎬ 生物信息学分析ꎬ 非生物胁迫ꎬ 表达分析
中图分类号: Q943 文献标识码: A 文章编号: 1000 ̄3142(2024)07 ̄1289 ̄10
Bioinformatics and expression analysis of expansin
genes GmEXPB5 and GmEXPB7 in soybean
1 1∗ 2 1
MA Hongyu ꎬ ZHAI Ying ꎬ ZHANG Jun ꎬ CHEN Jiongxin ꎬ
3 1 1
ZHANG Yong ꎬ MA Tianyi ꎬ LI Shanshan
收稿日期: 2024-01-26 接受日期: 2024-03-13
基金项目: 国家自然科学基金(32101694)ꎻ 黑龙江省省属高等学校基本科研业务费科研项目(145109506)ꎻ 高教强省科研专项
科技成果产业化攻关项目(GJQSCYH ̄2022003)ꎮ
第一作者: 马洪宇(1999—)ꎬ硕士研究生ꎬ主要从事植物分子遗传育种研究ꎬ(E ̄mail) mhy1903381673@ 163.comꎮ
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通信作者: 翟莹ꎬ博士ꎬ教授ꎬ研究方向为植物分子遗传育种ꎬ(E ̄mail)fairy39809079@ 126.comꎮ