Page 99 - 《广西植物》2025年第1期
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Ｇｕｉｈａｉａ Ｊａｎ. ２０２５ꎬ ４５(１): ９５－１０７
ＤＯＩ: １０.１１９３１/ ｇｕｉｈａｉａ.ｇｘｚｗ２０２３０４０６７
单筱涵ꎬ 安康ꎬ 周春霞ꎬ 等ꎬ ２０２５. 异质生境下山东银莲花的转录组分析及 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 分子标记开发 [Ｊ]. 广西植物ꎬ
４５(１): ９５－１０７.
ＳＨＡＮ ＸＨꎬ ＡＮ Ｋꎬ ＺＨＯＵ ＣＸꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２５. Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ ａｎａｌｙｓｉｓ ａｎｄ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ｏｆ ＥＳＴ￣ＳＳＲ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｍａｒｋｅｒｓ ｉｎ Ａｎｅｍｏｎｅ
ｓｈｉｋｏｋｉａｎａ ｕｎｄｅｒ ｈｅｔｅｒｏｇｅｎｅｏｕｓ ｈａｂｉｔａｔｓ [Ｊ]. Ｇｕｉｈａｉａꎬ ４５(１): ９５－１０７.
异质生境下山东银莲花的转录组分析
及 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 分子标记开发
单筱涵ꎬ 安 康ꎬ 周春霞ꎬ 张 鑫ꎬ 逄玉娟ꎬ 李丽霞ꎬ 卞福花 ∗
( 烟台大学 生命科学学院ꎬ 山东 烟台 ２６４００５ )
摘 要: 为探究稀有物种山东银莲花在全光照的山顶灌丛和阴暗的针阔混交林下两种不同生境中的生态适
应机制ꎬ并开发其 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 分子标记ꎬ该研究利用 Ｉｌｌｕｍｉｎａ 高通量测序技术对开花期的山东银莲花叶片进行
转录组测序ꎬ获取其功能注释和差异表达基因( ＤＥＧｓ)ꎮ 结果表明:( １) 转录组测序共得到 ５３ ５３６ 条
Ｕｎｉｇｅｎｅｓ 序列ꎬ其中 ２７ ４４８ 条成功获得注释ꎮ (２)差异表达基因 ５ ６３５ 个ꎬ１ ６００ 个在山顶灌丛的山东银莲
花中上调表达ꎬ其余 ４ ０３５ 个下调表达ꎮ 有 ２ ４６０ 个差异表达基因注释到 ＧＯ 数据库 ２ ５３３ 个三级条目中ꎬ
１ ０５１个差异表达基因注释到 ＫＥＧＧ 数据库的 １１３ 条代谢通路中ꎮ (３) 山东银莲花适应于异质生境的代谢
通路主要涉及光合作用－天线蛋白通路和类黄酮生物合成通路ꎬ光合作用－天线蛋白通路中 ｌｈｃａ５ 基因上调
表达ꎬｌｈｃｂ１、ｌｈｃｂ２ 和 ｌｈｃｂ３ 基因下调表达ꎬ类黄酮生物合成通路中 ｃｈｓ、ｃ４ｈ、ｆ３′ｈ、ｆ３ｈ、ｆｌｓ、ａｎｓ、ｃｈｉ、ｃｃｏａｏｍｔ 和 ｈｃｔ
基因均上调表达ꎮ (４)从山东银莲花转录组数据中共获得 ７ １４６ 个 ＳＳＲ 位点分布于 ６ ００６ 条 Ｕｎｉｇｅｎｅｓ 序列
中ꎬ共计 １０６ 种重复基序ꎬ优势重复基序为单核苷酸重复ꎮ 设计合成 １００ 对 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 引物中共有 ６８ 对引物
具有有效性ꎬ其中 １１ 对具有多态性ꎬ共扩增 ２４ 个多态性片段ꎮ 该研究首次开发了山东银莲花 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 分
子标记ꎬ为山东银莲花的保护和利用提供了重要的分子标记资源ꎮ
关键词: 异质生境ꎬ 山东银莲花ꎬ 转录组ꎬ ＥＳＴ￣ＳＳＲꎬ 生态适应机制
中图分类号: Ｑ９４３ 文献标识码: Ａ 文章编号: １０００￣３１４２(２０２５)０１￣００９５￣１３
Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ ａｎａｌｙｓｉｓ ａｎｄ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ｏｆ ＥＳＴ￣ＳＳＲ
ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｍａｒｋｅｒｓ ｉｎ Ａｎｅｍｏｎｅ ｓｈｉｋｏｋｉａｎａ ｕｎｄｅｒ
ｈｅｔｅｒｏｇｅｎｅｏｕｓ ｈａｂｉｔａｔｓ
ＳＨＡＮ Ｘｉａｏｈａｎꎬ ＡＮ Ｋａｎｇꎬ ＺＨＯＵ Ｃｈｕｎｘｉａꎬ ＺＨＡＮＧ Ｘｉｎꎬ
ＰＡＮＧ Ｙｕｊｕａｎꎬ ＬＩ Ｌｉｘｉａꎬ ＢＩＡＮ Ｆｕｈｕａ
( Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓꎬ Ｙａｎｔａｉ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬ Ｙａｎｔａｉ ２６４００５ꎬ Ｓｈａｎｄｏｎｇꎬ Ｃｈｉｎａ )
收稿日期: ２０２３－０９－１２ 接受日期: ２０２３－１２－１８
基金项目: 国家自然科学基金面上项目(３１９７１５４６)ꎮ
第一作者: 单筱涵(１９９８—)ꎬ硕士研究生ꎬ研究方向为植物生物学ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ)ｓｈａｎｘｉａｏｈａｎ０９２０＠１６３.ｃｏｍꎮ
∗
通信作者: 卞福花ꎬ博士ꎬ教授ꎬ研究方向为植物生物学ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ)ｆｈ＿ｂｉａｎ＠１６３.ｃｏｍꎮ
