Page 100 - 《广西植物》2025年第1期

９ ６ 广 西 植 物 ４５ 卷
Ａｂｓｔｒａｃｔ: Ｉｎ ｏｒｄｅｒ ｔｏ ｅｘｐｌｏｒｅꎬ ｔｈｅ ｅｃｏｌｏｇｉｃａｌ ａｄａｐｔａｔｉｏｎ ｍｅｃｈａｎｉｓｍｓ ｏｆ Ａｎｅｍｏｎｅ ｓｈｉｋｏｋｉａｎａ ｉｎ ｔｗｏ ｄｉｓｔｉｎｃｔ ｈａｂｉｔａｔｓꎬ
ｎａｍｅｌｙ ｆｕｌｌ￣ｌｉｇｈｔ ｈｉｌｌｔｏｐ ｓｃｒｕｂ ａｎｄ ｓｈａｄｙ ｍｉｘｅｄ ｂｒｏａｄｌｅａｖｅｄ￣ｃｏｎｉｆｅｒｏｕｓ ｆｏｒｅｓｔꎬ ａｎｄ ｔｏ ｄｅｖｅｌｏｐ ｉｔｓ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｍａｒｋｅｒｓꎬ
Ｉｌｌｕｍｉｎａ ｈｉｇｈ￣ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ｆｏｒ ｌｅａｖｅｓ ｏｆ Ａ. ｓｈｉｋｏｋｉａｎａ ｃｏｌｌｅｃｔｅｄ ｄｕｒｉｎｇ ｔｈｅ ｆｌｏｗｅｒｉｎｇ ｓｔａｇｅ ｔｏ ｏｂｔａｉｎ
ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ ａｎｎｏｔａｔｉｏｎ ａｎｄ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ ｇｅｎｅｓ (ＤＥＧｓ). Ｔｈｅ ｒｅｓｕｌｔｓ ｗｅｒｅ ａｓ ｆｏｌｌｏｗｓ: (１) Ａ ｔｏｔａｌ ｏｆ ５３ ５３６
Ｕｎｉｇｅｎｅｓ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｗｅｒｅ ｏｂｔａｉｎｅｄꎬ ｏｆ ｗｈｉｃｈ ２７ ４４８ ｗｅｒｅ ｓｕｃｃｅｓｓｆｕｌｌｙ ａｎｎｏｔａｔｅｄ. (２) Ａ ｔｏｔａｌ ｏｆ ５ ６３５ ＤＥＧｓ ｗｅｒｅ
ｏｂｔａｉｎｅｄꎬ １ ６００ ｕｐ￣ｒｅｇｕｌａｔｅｄ ａｎｄ ４ ０３５ ｄｏｗｎ￣ｒｅｇｕｌａｔｅｄ ｇｅｎｅｓ ｃｏｍｐａｒｉｎｇ Ａ. ｓｈｉｋｏｋｉａｎａ ｉｎ ｆｕｌｌ￣ｌｉｇｈｔ ｈｉｌｌｔｏｐ ｓｃｒｕｂ ａｎｄ ｉｎ
ｓｈａｄｙ ｍｉｘｅｄ ｃｏｎｉｆｅｒｏｕｓ ｆｏｒｅｓｔ. Ａ ｔｏｔａｌ ｏｆ ２ ４６０ ＤＥＧｓ ｗｅｒｅ ａｎｎｏｔａｔｅｄ ｔｏ ２ ５３３ ｔｅｒｔｉａｒｙ ｅｎｔｒｉｅｓ ｉｎ ＧＯ ｄａｔａｂａｓｅ. Ｉｎ
ａｄｄｉｔｉｏｎꎬ １ ０５１ ＤＥＧｓ ｗｅｒｅ ｉｎｖｏｌｖｅｄ ｉｎ １１３ ＫＥＧＧ ｐａｔｈｗａｙｓ. (３) Ｔｈｅ ｍｅｔａｂｏｌｉｃ ｐａｔｈｗａｙｓ ａｄａｐｔｅｄ ｔｏ ｈｅｔｅｒｏｇｅｎｅｏｕｓ
ｈａｂｉｔｓ ｉｎ Ａ. ｓｈｉｋｏｋｉａｎａ ｍａｉｎｌｙ ｉｎｖｏｌｖｅｄ ｐｈｏｔｏｓｙｔｈｅｉｓ￣ａｎｔｅｎｎａ ｐｒｏｔｅｉｎ ｐａｔｈｗａｙ ａｎｄ ｆｌａｖｏｎｏｉｄ ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ ｐａｔｈｗａｙ. Ｉｎ ｔｈｅ
ｐｈｏｔｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ￣ａｎｔｅｎｎａ ｐｒｏｔｅｉｎ ｐａｔｈｗａｙꎬ ｔｈｅ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｏｆ ｌｈｃａ５ ｗａｓ ｕｐ￣ｒｅｇｕｌａｔｅｄꎬ ｗｈｉｌｅ ｔｈｅ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｓ ｏｆ ｌｈｃｂ１ꎬ ｌｈｃｂ２
ａｎｄ ｌｈｃｂ３ ｗｅｒｅ ｄｏｗｎ￣ｒｅｇｕｌａｔｅｄ. Ｍｅａｎｗｈｉｌｅꎬ ｉｎ ｔｈｅ ｆｌａｖｏｎｏｉｄ ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ ｐａｔｈｗａｙꎬ ｔｈｅ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｓ ｏｆ ｃｈｓꎬ ｃ４ｈꎬ ｆ３′ｈꎬ
ｆ３ｈꎬ ｆｌｓꎬ ａｎｓꎬ ｃｈｉꎬ ｃｃｏａｏｍｔ ａｎｄ ｈｃｔ ｗｅｒｅ ａｌｌ ｕｐ￣ｒｅｇｕｌａｔｅｄ. (４) Ａ ｔｏｔａｌ ｏｆ ６ ００６ Ｕｎｉｇｅｎｅｓ ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ ７ １４６ ＳＳＲｓ ｗｅｒｅ
ｏｂｔａｉｎｅｄ ｆｒｏｍ ｔｈｅ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ ｄａｔａ ｏｆ Ａ.ｓｈｉｋｏｋｉａｎａ. Ｉｎ ｔｈｅ ｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄ ＳＳＲｓꎬ ｔｈｅ ｄｏｍｉｎａｎｔ ｒｅｐｅａｔ ｍｏｔｉｆｓ ｗｅｒｅ ｓｉｎｇｌｅ
ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｒｅｐｅａｔｓ ｉｎ １０６ ｒｅｐｅｔｉｔｉｖｅ ｍｏｔｉｆ ｔｙｐｅｓ. Ａｍｏｎｇ ｔｈｅ １００ ｐａｉｒｓ ｏｆ ＥＳＴ￣ＳＳＲ ｐｒｉｍｅｒｓꎬ ａ ｔｏｔａｌ ｏｆ ６８ ｐａｉｒｓ ｗｅｒｅ
ｅｆｆｅｃｔｉｖｅ ａｎｄ １１ ｐａｉｒｓ ｗｉｔｈ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍꎬ ａｎｄ ２４ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃ ｆｒａｇｍｅｎｔｓ ｗｅｒｅ ａｍｐｌｉｆｉｅｄ. Ｏｖｅｒａｌｌꎬ ｉｎ ｔｈｉｓ ｐａｐｅｒꎬ ｆｏｒ ｔｈｅ
ｆｉｒｓｔ ｔｉｍｅ ＥＳＴ￣ＳＳＲ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｍａｒｋｅｒｓ ｗｅｒｅ ｄｅｖｅｌｏｐｅｄꎬ ｗｈｉｃｈ ｗｏｕｌｄ ｐｒｏｖｉｄｅ ｉｍｐｏｒｔａｎｔ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｍａｒｋｅｒ ｒｅｓｏｕｒｃｅ ｆｏｒ ｔｈｅ
ｃｏｎｓｅｒｖａｔｉｏｎ ａｎｄ ｕｔｉｌｉｚａｔｉｏｎ ｏｆ Ａ. ｓｈｉｋｏｋｉａｎａ.
Ｋｅｙ ｗｏｒｄｓ: ｈｅｔｅｒｏｇｅｎｅｏｕｓ ｈａｂｉｔａｔꎬ Ａｎｅｍｏｎｅ ｓｈｉｋｏｋｉａｎａꎬ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅꎬ ＥＳＴ￣ＳＳＲꎬ ｅｃｏｌｏｇｉｃａｌ ａｄａｐｔａｔｉｏｎ ｍｅｃｈａｎｉｓｍｓ

山东银莲花( Ａｎｅｍｏｎｅ ｓｈｉｋｏｋｉａｎａ) 是毛茛科银 调控(张椿雨等ꎬ２００７)ꎮ 转录组作为特定组织或
莲花属(Ａｎｅｍｏｎｅ)的多年生草本植物ꎬ间断分布于 细胞在某一发育阶段或功能状态下所有 ｍＲＮＡ 的
中国胶东半岛和日本四国岛( 王鸷等ꎬ２０１４)ꎮ 在 集合ꎬ是研究基因功能与结构的有效手段( 鲁艳辉
中国被列入« 世界自然保护联盟濒危物种红色名 等ꎬ２０２１)ꎮ 运用 Ｉｌｌｕｍｉｎａ 高通量测序技术对植物
录»(ＩＵＣＮ) 易危( ＶＵ) 等级ꎬ为典型的稀有物种 转录组进行测序分析ꎬ可高效、精准地获得大量特
(陈春利等ꎬ２０１８)ꎮ 其根可入药ꎬ有清热解毒、止 定组织或细胞中表达的基因序列ꎬ实现在无参考
血除湿的功效(刘琼ꎬ２０１４)ꎻ因其株型优美、花大、 基因组的基础上进行分析( 郭连安等ꎬ２０２１)ꎮ 同
花期长ꎬ在园艺上具有潜在的开发价值( 侯元同和 时ꎬ转录组 分 析 应 用 于 两 色 金 鸡 菊 ( 孙 浩 男 等ꎬ
刘冰ꎬ２０１０)ꎮ ２０２４)、直立型扁蓿豆( 乌日娜等ꎬ２０２２) 等多种植
山东银莲花生长在海拔 ６００ ｍ 以上的山顶灌 物ꎬ并且已广泛应用于探究不同生境下植物的适
丛和针阔混交林下两种异质生境中ꎬ山东灌丛常 应性(周春苗等ꎬ２０２２ꎻ韦陈彬等ꎬ２０２２)ꎮ
年全光照ꎬ土壤是以碎石、沙粒为主的砂质性土 分子标记可用于植物的系统进化分析、功能
壤ꎻ而针阔混交林下阴暗潮湿ꎬ土壤为营养丰富且 基因标记和分子辅助育种等ꎬ随着高通量测序技
疏松 的 腐 殖 土 ( Ｐａｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２０)ꎮ 岳 喜 元 等 术的发展ꎬ由转录组测序得到的 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 分子标
(２０２３)研究表明ꎬ黄河三角洲的芦苇通过调整个 记被作为最常用的分子标记技术之一ꎮ 其操作简
体大小与叶性状适应异质生境下水分条件变化ꎬ 单ꎬ具有共显性遗传、稳定性好和准确度高等优于
王妍方等(２０２３)通过木棉表型可塑性探究其适应 其他分子标记的特点(岳远灏等ꎬ２０２２)ꎮ ＥＳＴ￣ＳＳＲ
干热河谷和热带雨林两种极端环境的机制ꎮ 山东 标记开发成本低ꎬ适用于无参考基因组的物种ꎬ可
银莲花则通过改变叶片、根系的形态结构及生理 有效地推动分子标记技术在植物遗传多样性分
等策 略 适 应 完 全 不 同 的 生 长 环 境 ( 于 文 英 等ꎬ 析、指纹图谱构建、种质资源保护、品种鉴定等方
２０１９ꎻＰａｎｇ ｅｒ ａｌ.ꎬ ２０２０ꎻ逄玉娟等ꎬ２０２２)ꎮ 然而ꎬ 面的应用(杨雄等ꎬ２０２１)ꎬ目前已在大麻(边境等ꎬ
至今对该种适应异质生境的分子机制尚不清楚ꎮ ２０２３)、辣 椒 ( 田 怀 志 等ꎬ ２０２３)、 枫 香 ( 李 辉 等ꎬ
植物适应环境的本质是基因特异性表达的结果ꎬ ２０２３)等植物中开发与应用ꎮ 然而ꎬ关于山东银莲
基因的特异性表达在一定程度上由转录水平进行 花分子标记的报道尚不多见ꎬ未见公开报道的可