Page 103 - 《广西植物》2025年第1期
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1 期 单筱涵等: 异质生境下山东银莲花的转录组分析及 EST ̄SSR 分子标记开发 9 9
上方条形图的数字代表下方矩阵中对应加黑点的数据库交集的结果ꎬ左侧柱状图代表各数据库全部注释到基因数量ꎮ
The numbers above the top bars represent the results of the intersection of the databases corresponding to the black dots in the matrix belowꎬ and
the bars on the left represent the number of genes annotated to each database.
图 1 各数据库注释韦恩图
Fig. 1 Venn diagram for each database annotation
库(5 481ꎬ29.19%)和 KEGG 库(5 481ꎬ 10.23%)ꎮ 个ꎬ下调基因 4 035 个( 图 2)ꎬ说明不同生长环境
按照 NR 数据库中山东银莲花的 Unigenes 与其他 对山东银莲花基因表达影响较大ꎮ
物种匹 配 可 得ꎬ 相 似 程 度 最 高 的 物 种 为 耧 斗 菜 2.2.2 差异表达 Unigene 富集分析 将山东银莲花
(Aquilegia coeruleaꎬ56.72%)ꎬ其他按匹配度由高 的差异表达 Unigenes 进行 GO( 图 3) 和 KEGG 富
到低依次为博落回( Macleaya cordataꎬ6.08%)、鸦 集分析(图 4)ꎬ结果显示共有 2 460 个差异表达基
片罂粟( Papaver somniferumꎬ4. 06%)、莲( Nelumbo 因被注释到 GO 数据库 2 533 个三级条目中ꎬ共有
nuciferaꎬ3.29%)、葡萄( Vitis viniferaꎬ1.92%)、欧洲 1 051个差异表达基因被注释到 KEGG 数据库的
栓 皮 栎 ( Quercus suberꎬ 0. 94%)、 月 季 花 ( Rosa 113 条代谢通路中ꎮ
chinensisꎬ 0.9% )、 Sphaerulina musiva SO2202 根据 GO 数据库一级条目生物学过程、细胞成
(0.73% )、 中 华 猕 猴 桃 ( Actinidia chinensis var. 分和分子功能的不同ꎬ筛选 3 种分类中对应差异
chinensisꎬ 0. 58%)、 向 日 葵 ( Helianthus annuusꎬ 基因数目大于 2 的 GO 二级条目ꎬ按照每个条目对
0.55%)和其他物种(24.24%)ꎮ 应的 P 值由小到大排序可得前 10 个富集分类ꎬ山
2.2 差异表达 Unigene 分析 东银莲花的差异表达基因主要显著富集在脱落酸
2.2.1 差异表达 Unigene 筛选 对山东银莲花的转 代谢过程、薄荷醇生物合成过程、硫脂生物合成过
录组 数 据 进 行 筛 选ꎬ 共 挖 掘 差 异 表 达 Unigenes 程等生物学过程中ꎬ胞质大核糖体亚基、胞质小核
5 635个ꎬ数量较多ꎬ其中与林下( L) 的山东银莲花 糖体 亚 基、 核 糖 体 等 细 胞 成 分 中ꎬ 芳 醇 脱 氢 酶
相比ꎬ山顶(D)的山东银莲花中有上调基因 1 600 (NADP+) 活性、异戊烯醇脱氢酶活性、卡维醇脱

