Page 156 - 《广西植物》2025年第10期

１ ８ ８ ６ 广 西 植 物 ４５ 卷

∗∗∗与▲▲▲之间为开放阅读框(ＯＲＦ)ꎻ 黑线标注区域为 ＰｌｓＣ 的保守序列ꎮ
Ｔｈｅ ｏｐｅｎ ｒｅａｄｉｎｇ ｆｒａｍｅ (ＯＲＦ) ｉｓ ｂｅｔｗｅｅｎ ｔｈｅ ∗∗∗ ａｎｄ ｔｈｅ ▲▲▲ꎻ ｔｈｅ ｒｅｇｉｏｎ ｍａｒｋｅｄ ｂｙ ｔｈｅ ｂｌａｃｋ ｌｉｎｅ ｉｓ ｔｈｅ ｃｏｎｓｅｒｖｅｄ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｏｆ ＰｌｓＣ.
图 ２ ＳａＧＰＡＴ１ 基因全长核苷酸序列及编码氨基酸序列
Ｆｉｇ. ２ Ｆｕｌｌ￣ｌｅｎｇｔｈ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ａｎｄ ｃｏｄｉｎｇ ａｍｉｎｏ ａｃｉｄ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｏｆ ＳａＧＰＡＴ１ ｇｅｎｅ

２.２.２ ＳａＧＰＡＴ１ 蛋白结构预测 通过使用 ＳＯＰＭＡ
在线工具ꎬ预测 ＳａＧＰＡＴ１ 基因编码蛋白二级结构ꎬ
结果显示该蛋白的多肽链主要组成成分为无规则
卷 曲 ( ３８. ７２％)、 α 螺 旋 ( ３８. ５８％) 和 延 伸 链
(１８.４２％)ꎬ含有少量 β 转角(４.３２％)(图 ４:ａ)ꎮ 运

用在线软件 ＳＭＡＲＴ 对 ＳａＧＰＡＴ１ 蛋白结构预测结果
表明ꎬ该蛋白含有典型的酰基转移酶(ＰｌｓＣ) 结构域
( 图 ４: ｂ )ꎮ 通 过 在 线 工 具 ＳＷＩＳＳ￣ＭＯＤＥＬ 对
ＳａＧＰＡＴ１ 蛋白进行三级结构预测(图 ４:ｃ)ꎬ结果显
示该蛋白模型构建基于模板 Ａ０Ａ８０３ＬＦ０７.１.Ａ(藜麦
图 ３ ＳａＧＰＡＴ１ 蛋白疏水性分析 ＧＰＡＴ 蛋 白 )ꎬ 对 应 ＧＭＱＥ ( ｇｌｏｂａｌ ｍｏｄｅｌ ｑｕａｌｉｔｙ
Ｆｉｇ. ３ Ｈｙｄｒｏｐｈｏｂｉｃｉｔｙ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ＳａＧＰＡＴ１ ｐｒｏｔｅｉｎ ｅｓｔｉｍａｔｅ)得分 ０.８１ꎬ覆盖率为 ８０.９９％ꎮ