Page 154 - 《广西植物》2025年第10期
P. 154
1 8 8 4 广 西 植 物 45 卷
隆、生物信息学分析和基因表达模式探讨ꎬ初步阐 6.0 软件确定基因扩增引物ꎬ引物序列如表 1 所
述该基因在蒿叶猪毛菜应对干旱胁迫时的功能 示ꎮ 采用 P515 酶(南京诺唯赞生物科技股份有限
表现ꎮ 公司)ꎬ以 cDNA 为模板进行 PCR 扩增ꎮ PCR 反应
体系如下:2×P515 酶 20 μLꎬ上下游引物各 1 μLꎬ
1 材料与方法 模板 3 μLꎬddH O 补足至 40 μLꎮ PCR 扩增条件
2
设置如下:94 ℃ ꎬ3 minꎻ94 ℃ ꎬ30 sꎻ60 ℃ 30 sꎻ72
1.1 材料 ℃ ꎬ1 min 50 s( 每 kb 1 min)ꎻ32 个循环ꎮ 取 5 μL
2022 年 10 月于青海省德令哈市阿力腾寺院 PCR 产物进行 1%琼脂糖凝胶电泳检测ꎬ使用胶回
(97°21′36″ E、37°22′48″ N) 采摘蒿叶猪毛菜成熟 收试剂盒 [ 生工生物工程( 上海) 股份有限公司]
叶片、茎及新鲜种子ꎮ 将采摘的成熟叶片和茎放 纯化目的片段ꎬ 随后采用克隆试剂盒 [ 生工生物
置液氮速冻后ꎬ-80 ℃ 冰箱保存备用ꎻ采集的种子 工程(上海) 股 份 有 限 公 司] 将 回 收 产 物 连 接 至
于室外进行晾晒干燥处理ꎬ以获得后续实验所需 pMD19 ̄T 载体后ꎬ转化至大肠杆菌 DH5α 感受态
的原始材料ꎮ 细胞ꎬ在 LB 固体培养基( 含氨苄青霉素) 进行培
将晾晒干燥处理后的蒿叶猪毛菜种子置于无 养ꎬ后进行菌落阳性鉴定、质粒提取与测序验证ꎮ
菌水中 4 ℃ 春化 36 hꎬ随后将种子浸泡在 5%的次 1.2. 3 SaGPAT1 基 因 的 生 物 信 息 学 分 析 以
氯酸钠溶液中消毒处理 5 minꎬ并用超纯水冲洗 SaGPAT1 蛋 白 序 列 进 行 BLAST ( https: / / blast.
6 ~ 7 次ꎮ 于超净台无菌环境下ꎬ将处理后的种子 ncbi.nlm.nih. gov / Blast. cgi) 分 析ꎬ从 NCBI 下 载 各
接种到 MS 培养基中ꎬ并于培养室内培养ꎻ昼夜温 已知物种 GPAT 氨基酸序列ꎬ利用 ClustalX 进行多
度保持在 23 ℃ ꎬ湿度维持在 50%ꎬ光照与黑暗的 重序列比对ꎬ利用 MEGA 7 软件以邻接法构建不
时间比为 16 h ∶ 8 hꎬ光照强度为 6 000 lxꎬ以此获 同植物 GPAT 蛋白的系统发育进化树ꎬBootstrap 设
得蒿叶猪毛菜实生苗ꎮ 在生长 1 周后ꎬ选取生长 置 为 1 000ꎻ 通 过 Expasy 网 站 的 在 线 工 具
状况一致的实生苗幼苗ꎬ转移至水培系统中ꎮ 因 ProtParam ( https: / / web. expasy. org / protparam / 、
前期研究发现ꎬ1.5% PEG6000 + 1 / 2 Hoagland 营 https: / / web. expasy. org / protscale / ) 对 SaGPAT1 蛋
养液胁迫 3 d 后ꎬ能直观观察到幼苗在干旱胁迫下 白的理 化 性 质 和 亲 疏 水 性 进 行 预 测ꎻ利 用 Prabi
叶片出现萎蔫卷曲但不致死ꎬ故本次研究将部分 ( https: / / npsa ̄prabi. ibcp. fr / cgi ̄bin / npsa _
幼苗于 1 / 2 Hoagland 营养液中培养( CK)ꎬ其余幼 automat.pl? page = npsa%20_sopma.html) 和 SWISS ̄
苗 移 至 用 1 / 2 Hoagland 营 养 液 配 制 的 处 理 液 MODEL( https: / / swissmodel. expasy. org / interactive)
(1.5% PEG6000)中模拟干旱胁迫(处理组)ꎬ以上 对 SaGPAT1 蛋白进行二级结构和三级结构预测ꎻ
处理均 3 次重复ꎮ 在处理 3 d 后选取株高约 4.5 通 过 在 线 网 站 Plant ̄mPLoc ( http: / / www. csbio.
cm 且具有 2 片真叶的幼苗ꎬ进行取样ꎬ将所取幼苗 sjtu.edu.cn / bioinf/ plant ̄multi/ )对 SaGPAT1 蛋白进
迅速放置液氮速冻后ꎬ-80 ℃ 冰箱保存ꎬ部分幼苗 行亚 细 胞 定 位 预 测ꎻ 通 过 在 线 网 站 SignalP ̄6. 0
用于转录组测序ꎬ部分幼苗与野外采摘的成熟叶 ( https: / / services. healthtech. dtu. dk / services/
片和茎用于后续实时荧光定量 PCR( qRT ̄PCR) SignalP ̄6. 0 / ) 及 TMHMM ̄2. 0 ( https: / / services.
实验ꎮ healthtech. dtu. dk / services/ TMHMM ̄2. 0 / ) 对
1.2 方法 SaGPAT1 蛋白进行跨膜结构及信号肽的预测ꎮ
1.2.1 RNA 提取及 cDNA 的合成 使用 RNAprep 1.2.4 SaGPAT1 基因启动子区顺式作用元件分析
Pure 多糖多酚植物总 RNA 提取试剂盒 [天根生化 基于蒿叶猪毛菜基因组及 GFF 注释文件ꎬ利用
科技(北京) 有限公司] 提取蒿叶猪毛菜总 RNAꎬ TBtools 软件中 Gtf/ Gff3 Sequences Extractor 功能提
用 PrimerScript 1st Strand cDNA 合成试剂盒 [天根 取 SaGPAT1 基因上游 1.5 kb 序列作为启动子区
生化科技( 北 京) 有 限 公 司] 合 成 第 一 链 cDNAꎬ 域ꎬ启 动 子 序 列 的 顺 式 作 用 元 件 由 在 线 工 具
-20 ℃ 保存备用ꎮ PlantCARE ( http: / / bioinformatics. psb. ugent. be /
1.2.2 SaGPAT1 基因的引物设计与克隆 根据蒿 webtools/ plantcare / html/ ) 预测ꎬ预测结果由 GSDS
叶猪毛菜 SaGPAT1 基因序列ꎬ采用 Primer Premier 在线软件绘制ꎮ

