Page 154 - 《广西植物》2025年第10期
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1 8 8 4                                广  西  植  物                                         45 卷
            隆、生物信息学分析和基因表达模式探讨ꎬ初步阐                             6.0 软件确定基因扩增引物ꎬ引物序列如表 1 所
            述该基因在蒿叶猪毛菜应对干旱胁迫时的功能                               示ꎮ 采用 P515 酶(南京诺唯赞生物科技股份有限
            表现ꎮ                                                公司)ꎬ以 cDNA 为模板进行 PCR 扩增ꎮ PCR 反应
                                                               体系如下:2×P515 酶 20 μLꎬ上下游引物各 1 μLꎬ
            1  材料与方法                                           模板 3 μLꎬddH O 补足至 40 μLꎮ PCR 扩增条件
                                                                             2
                                                               设置如下:94 ℃ ꎬ3 minꎻ94 ℃ ꎬ30 sꎻ60 ℃ 30 sꎻ72
            1.1 材料                                             ℃ ꎬ1 min 50 s( 每 kb 1 min)ꎻ32 个循环ꎮ 取 5 μL
                2022 年 10 月于青海省德令哈市阿力腾寺院                       PCR 产物进行 1%琼脂糖凝胶电泳检测ꎬ使用胶回
            (97°21′36″ E、37°22′48″ N) 采摘蒿叶猪毛菜成熟                收试剂盒 [ 生工生物工程( 上海) 股份有限公司]
            叶片、茎及新鲜种子ꎮ 将采摘的成熟叶片和茎放                             纯化目的片段ꎬ 随后采用克隆试剂盒 [ 生工生物
            置液氮速冻后ꎬ-80 ℃ 冰箱保存备用ꎻ采集的种子                          工程(上海) 股 份 有 限 公 司] 将 回 收 产 物 连 接 至
            于室外进行晾晒干燥处理ꎬ以获得后续实验所需                              pMD19 ̄T 载体后ꎬ转化至大肠杆菌 DH5α 感受态
            的原始材料ꎮ                                             细胞ꎬ在 LB 固体培养基( 含氨苄青霉素) 进行培
                 将晾晒干燥处理后的蒿叶猪毛菜种子置于无                           养ꎬ后进行菌落阳性鉴定、质粒提取与测序验证ꎮ
            菌水中 4 ℃ 春化 36 hꎬ随后将种子浸泡在 5%的次                      1.2. 3 SaGPAT1 基 因 的 生 物 信 息 学 分 析          以
            氯酸钠溶液中消毒处理 5 minꎬ并用超纯水冲洗                           SaGPAT1 蛋 白 序 列 进 行 BLAST ( https: / / blast.
            6 ~ 7 次ꎮ 于超净台无菌环境下ꎬ将处理后的种子                         ncbi.nlm.nih. gov / Blast. cgi) 分 析ꎬ从 NCBI 下 载 各
            接种到 MS 培养基中ꎬ并于培养室内培养ꎻ昼夜温                           已知物种 GPAT 氨基酸序列ꎬ利用 ClustalX 进行多
            度保持在 23 ℃ ꎬ湿度维持在 50%ꎬ光照与黑暗的                        重序列比对ꎬ利用 MEGA 7 软件以邻接法构建不
            时间比为 16 h ∶ 8 hꎬ光照强度为 6 000 lxꎬ以此获                 同植物 GPAT 蛋白的系统发育进化树ꎬBootstrap 设
            得蒿叶猪毛菜实生苗ꎮ 在生长 1 周后ꎬ选取生长                           置 为 1 000ꎻ 通 过 Expasy 网 站 的 在 线 工 具
            状况一致的实生苗幼苗ꎬ转移至水培系统中ꎮ 因                             ProtParam ( https: / / web. expasy. org / protparam / 、
            前期研究发现ꎬ1.5% PEG6000 + 1 / 2 Hoagland 营             https: / / web. expasy. org / protscale / ) 对 SaGPAT1 蛋
            养液胁迫 3 d 后ꎬ能直观观察到幼苗在干旱胁迫下                          白的理 化 性 质 和 亲 疏 水 性 进 行 预 测ꎻ利 用 Prabi
            叶片出现萎蔫卷曲但不致死ꎬ故本次研究将部分                              ( https: / / npsa ̄prabi.  ibcp.  fr / cgi ̄bin / npsa  _
            幼苗于 1 / 2 Hoagland 营养液中培养( CK)ꎬ其余幼                 automat.pl? page = npsa%20_sopma.html) 和 SWISS ̄
            苗 移 至 用 1 / 2 Hoagland 营 养 液 配 制 的 处 理 液           MODEL( https: / / swissmodel. expasy. org / interactive)
            (1.5% PEG6000)中模拟干旱胁迫(处理组)ꎬ以上                      对 SaGPAT1 蛋白进行二级结构和三级结构预测ꎻ
            处理均 3 次重复ꎮ 在处理 3 d 后选取株高约 4.5                      通 过 在 线 网 站 Plant ̄mPLoc ( http: / / www. csbio.
            cm 且具有 2 片真叶的幼苗ꎬ进行取样ꎬ将所取幼苗                         sjtu.edu.cn / bioinf/ plant ̄multi/ )对 SaGPAT1 蛋白进
            迅速放置液氮速冻后ꎬ-80 ℃ 冰箱保存ꎬ部分幼苗                          行亚 细 胞 定 位 预 测ꎻ 通 过 在 线 网 站 SignalP ̄6. 0
            用于转录组测序ꎬ部分幼苗与野外采摘的成熟叶                              ( https: / / services.  healthtech.  dtu.  dk / services/

            片和茎用于后续实时荧光定量 PCR( qRT ̄PCR)                        SignalP ̄6. 0 / ) 及 TMHMM ̄2. 0 ( https: / / services.
            实验ꎮ                                                healthtech. dtu. dk / services/ TMHMM ̄2. 0 / ) 对
            1.2 方法                                             SaGPAT1 蛋白进行跨膜结构及信号肽的预测ꎮ

            1.2.1 RNA 提取及 cDNA 的合成   使用 RNAprep                1.2.4 SaGPAT1 基因启动子区顺式作用元件分析
            Pure 多糖多酚植物总 RNA 提取试剂盒 [天根生化                         基于蒿叶猪毛菜基因组及 GFF 注释文件ꎬ利用

            科技(北京) 有限公司] 提取蒿叶猪毛菜总 RNAꎬ                         TBtools 软件中 Gtf/ Gff3 Sequences Extractor 功能提
            用 PrimerScript 1st Strand cDNA 合成试剂盒 [天根           取 SaGPAT1 基因上游 1.5 kb 序列作为启动子区

            生化科技( 北 京) 有 限 公 司] 合 成 第 一 链 cDNAꎬ                域ꎬ启 动 子 序 列 的 顺 式 作 用 元 件 由 在 线 工 具
            -20 ℃ 保存备用ꎮ                                        PlantCARE ( http: / / bioinformatics. psb. ugent. be /
            1.2.2 SaGPAT1 基因的引物设计与克隆  根据蒿                      webtools/ plantcare / html/ ) 预测ꎬ预测结果由 GSDS
            叶猪毛菜 SaGPAT1 基因序列ꎬ采用 Primer Premier                在线软件绘制ꎮ
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