Page 100 - 《广西植物》2025年第12期

２ ２ ４ ２ 广 西 植 物 ４５ 卷
１ꎬ２ꎬ５ １ ３ ３
ＬＥＩ Ｈａｎｌｉｎ ꎬ ＬＩ Ｒｕｏｚｈｕ ꎬ ＣＡＩ Ｊｉｅ ꎬ ＹＡＮＧ Ｊｕｎｂｏ ꎬ
３ ３ １ꎬ２ꎬ４∗
ＺＨＡＮＧ Ｚｈｉｒｏｎｇ ꎬ ＬＩ Ｄｅｚｈｕ ꎬ ＹＵ Ｗｅｎｂｉｎ
( １. Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ｉｎｔｅｇｒａｔｉｖｅ Ｃｏｎｓｅｒｖａｔｉｏｎ ａｎｄ Ｙｕｎｎａｎ Ｋｅｙ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｆｏｒ ｔｈｅ Ｃｏｎｓｅｒｖａｔｉｏｎ ｏｆ Ｔｒｏｐｉｃａｌ Ｒａｉｎｆｏｒｅｓｔｓ ａｎｄ Ａｓｉａｎ Ｅｌｅｐｈａｎｔｓꎬ Ｘｉｓｈｕａｎｇｂａｎｎａ
Ｔｒｏｐｉｃａｌ Ｂｏｔａｎｉｃａｌ Ｇａｒｄｅｎꎬ Ｃｈｉｎｅｓｅ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓꎬ Ｍｅｎｇｌａ ６６６３０３ꎬ Ｙｕｎｎａｎꎬ Ｃｈｉｎａꎻ ２. Ｙｕｎｎａｎ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｊｏｉｎｔ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｆｏｒ ｔｈｅ
Ｃｏｎｓｅｒｖａｔｉｏｎ ａｎｄ Ｕｔｉｌｉｚａｔｉｏｎ ｏｆ Ｔｒｏｐｉｃａｌ Ｔｉｍｂｅｒ Ｔｒｅｅ Ｓｐｅｃｉｅｓꎬ Ｘｉｓｈｕａｎｇｂａｎｎａ Ｔｒｏｐｉｃａｌ Ｂｏｔａｎｉｃａｌ Ｇａｒｄｅｎꎬ Ｃｈｉｎｅｓｅ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓꎬ Ｍｅｎｇｌａ
６６６３０３ꎬ Ｙｕｎｎａｎꎬ Ｃｈｉｎａꎻ ３. Ｔｈｅ Ｇｅｒｍｐｌａｓｍ Ｂａｎｋ ｏｆ Ｗｉｌｄ Ｓｐｅｃｉｅｓꎬ Ｋｕｎｍｉｎｇ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ｏｆ Ｂｏｔａｎｙꎬ Ｃｈｉｎｅｓｅ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓꎬ Ｋｕｎｍｉｎｇ
６５０２０１ꎬ Ｃｈｉｎａꎻ ４. Ｓｏｕｔｈｅａｓｔ Ａｓｉａ Ｂｉｏｄｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅꎬ Ｃｈｉｎｅｓｅ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅꎬ Ｍｅｎｇｌａ ６６６３０３ꎬ
Ｙｕｎｎａｎꎬ Ｃｈｉｎａꎻ ５. Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｃｈｉｎｅｓｅ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓꎬ Ｂｅｉｊｉｎｇ １０００４９ꎬ Ｃｈｉｎａ )

Ａｂｓｔｒａｃｔ: Ｔｈｅ Ｍａｌｖａｔｈｅｃａ ｃｌａｄｅ ( ｅｎｃｏｍｐａｓｓｉｎｇ Ｍａｌｖｏｉｄｅａｅ ａｎｄ Ｂｏｍｂａｃｏｉｄｅａｅ ｗｉｔｈｉｎ Ｍａｌｖａｃｅａｅ ｓ. ｌ.) ｐｏｓｓｅｓｓｅｓ
ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔ ｅｃｏｎｏｍｉｃ ａｎｄ ｅｃｏｌｏｇｉｃａｌ ｖａｌｕｅｓ. Ｈｏｗｅｖｅｒꎬ ｔｈｅ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓ ｗｉｔｈｉｎ ｔｈｉｓ ｃｌａｄｅ ｒｅｍａｉｎ
ｃｏｎｔｒｏｖｅｒｓｉａｌꎬ ｐａｒｔｉｃｕｌａｒｌｙ ｃｏｎｃｅｒｎｉｎｇ ｔｈｅ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｐｌａｃｅｍｅｎｔ ｏｆ Ｆｒｅｍｏｎｔｏｄｅｎｄｒｅａｅꎬ Ｏｃｈｒｏｍｅａｅ ａｎｄ Ｍａｔｉｓｉｅａｅ.
Ｍｏｒｅｏｖｅｒꎬ ｃｏｍｐｒｅｈｅｎｓｉｖｅ ａｎａｌｙｓｅｓ ｏｆ ｐｌａｓｔｏｍｅ ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ ｖａｒｉａｔｉｏｎｓ ａｎｄ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｗｉｔｈｉｎ ｔｈｉｓ ｃｌａｄｅ ｒｅｍａｉｎ ｐｏｏｒｌｙ
ｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｅｄ. Ｔｏ ｒｅｓｏｌｖｅ ｔｈｅｓｅ ｒｅｓｅａｒｃｈ ｇａｐｓꎬ ｔｈｉｓ ｓｔｕｄｙ ｉｎｃｏｒｐｏｒａｔｅｄ ｔｈｅ ｐｌａｓｔｉｄ ｗｈｏｌｅ ｇｅｎｏｍｅ (ＷＧＭ) ｄａｔａ ｆｒｏｍ １４２
ｓｐｅｃｉｅｓ ｒｅｐｒｅｓｅｎｔｉｎｇ ８ ｔｒｉｂｅｓ ａｎｄ ３８ ｇｅｎｅｒａ ｏｆ ｔｈｅ Ｍａｌｖａｔｈｅｃａ ｃｌａｄｅꎬ ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ ７７ ｐｌａｓｔｏｍｅｓ ｎｅｗｌｙ ｄｅ ｎｏｖｏ
ａｓｓｅｍｂｌｅｄ. Ｗｅ ｐｅｒｆｏｒｍｅｄ ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ ｇｅｎｏｍｉｃ ａｎｄ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ａｎａｌｙｓｅｓ ｕｓｉｎｇ ｔｈｅ ｐｌａｓｔｏｍｅ ｄａｔａｓｅｔｓ. Ｔｈｅ ｒｅｓｕｌｔｓ ｗｅｒｅ
ａｓ ｆｏｌｌｏｗｓ: (１) Ｔｈｅ ｐｌａｓｔｏｍｅ ｓｉｚｅ ｉｎ ｔｈｅ Ｍａｌｖａｔｈｅｃａ ｃｌａｄｅ ｅｘｈｉｂｉｔｅｄ ｖａｒｉａｔｉｏｎ ｒａｎｇｉｎｇ ｆｒｏｍ １５６ ７０１ ｂｐ ｔｏ １６３ ７４１ ｂｐꎬ
ｐｒｉｍａｒｉｌｙ ａｔｔｒｉｂｕｔｅｄ ｔｏ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌ ｌｅｎｇｔｈｓ ｉｎ ｔｈｅ ｉｎｖｅｒｔｅｄ ｒｅｐｅａｔ ( ＩＲ) ｒｅｇｉｏｎ ａｎｄ ｖａｒｙｉｎｇ ｎｕｍｂｅｒｓ ｏｆ ｒｅｐｅｔｉｔｉｖｅ
ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ. (２) Ｆｏｕｒ ＩＲ ｂｏｕｎｄａｒｙ ｔｙｐｅｓ ｗｅｒｅ ｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄ ｔｈｒｏｕｇｈ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｇｅｎｅ ｖａｒｉａｔｉｏｎ ａｔ ＩＲ/ ＳＣ ｊｕｎｃｔｉｏｎｓ. Ｔｈｅ Ｔｙｐｅ
Ⅲａ ｗａｓ ｉｎｆｅｒｒｅｄ ａｓ ｔｈｅ ａｎｃｅｓｔｒａｌ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ｏｆ ｔｈｅ ｐｌａｓｔｏｍｅ ｗｉｔｈｉｎ ｔｈｅ Ｍａｌｖａｔｈｅｃａ ｃｌａｄｅꎬ ｗｉｔｈ ｉｄｅｎｔｉｃａｌ ＩＲ ｅｘｐａｎｓｉｏｎ/
ｃｏｎｔｒａｃｔｉｏｎ ｅｖｅｎｔｓ ｅｖｏｌｖｉｎｇ ｃｏｎｖｅｒｇｅｎｔｌｙ ｍｕｌｔｉｐｌｅ ｔｉｍｅｓ ｄｕｒｉｎｇ ｉｔｓ ｄｉｖｅｒｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ. (３) Ｅｉｇｈｔ ｈｉｇｈｌｙ ｖａｒｉａｂｌｅ ｒｅｇｉｏｎｓ ｗｅｒｅ
ｄｅｔｅｃｔｅｄ ｉｎ ｂｏｔｈ Ｍａｌｖｏｉｄｅａｅ ａｎｄ Ｂｏｍｂａｃｏｉｄｅａｅꎬ ｗｉｔｈ ｔｒｎＳ ＧＣＵ －ｔｒｎＧ ＵＣＣ ꎬ ｐｅｔＡ－ｐｓｂＪꎬ ｎｄｈＤ－ｃｃｓＡ ａｎｄ ｙｃｆ１ ｂｅｉｎｇ ｃｏｍｍｏｎ ｔｏ
ｂｏｔｈ ｃｌａｄｅｓ. Ｎｏｔａｂｌｙꎬ ｔｒｎＳ ＧＣＵ － ｔｒｎＧ ＵＣＣ ꎬ ｙｃｆ１ ａｎｄ ｔｈｅ ｃｏｍｍｏｎｌｙ ｕｓｅｄ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｍａｒｋｅｒｓ ｎｄｈＦ ｅｘｈｉｂｉｔｅｄ ｒｏｂｕｓｔ
ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｒｅｓｏｌｕｔｉｏｎ. (４) Ｔｈｅ ｔｏｐｏｌｏｇｉｅｓ ｉｎｆｅｒｒｅｄ ｆｒｏｍ ｂｏｔｈ ｔｈｅ ｐｌａｓｔｉｄ ＷＧＭ ｍａｔｒｉｘ ａｎｄ ｐｒｏｔｅｉｎ ｃｏｄｉｎｇ ｓｅｑｕｅｎｃｅ
(ＣＤＳ) ｍａｔｒｉｘ ｄａｔａｓｅｔｓ ｗｅｒｅ ｌａｒｇｅｌｙ ｉｄｅｎｔｉｃａｌ ａｎｄ ｗｅｌｌ￣ｒｅｓｏｌｖｅｄꎬ ａｎｄ ｐｒｏｖｉｄｅｄ ａ ｒｅｌｉａｂｌｅ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｆｒａｍｅｗｏｒｋ ｆｏｒ
Ｍａｌｖａｔｈｅｃａ ｃｌａｄｅ. Ｔｈｅ ｒｅｓｕｌｔ ｓｈｏｗｅｄ ｔｈａｔ ｔｈｅ Ｍａｌｖａｔｈｅｃａ ｃｌａｄｅ ｗａｓ ｄｉｖｉｄｅｄ ｉｎｔｏ ｆｏｕｒ ｌｉｎｅａｇｅｓꎬ ｗｉｔｈ Ｆｒｅｍｏｎｔｏｄｅｎｄｒｅａｅ ａｓ
ｔｈｅ ｅａｒｌｉｅｓｔ ｄｉｖｅｒｇｅｎｔ ｇｒｏｕｐꎬ ｆｏｌｌｏｗｅｄ ｂｙ Ｏｃｈｒｏｍｅａｅꎬ ｔｈｅｎ Ｂｏｍｂａｃｏｉｄｅａｅ ａｎｄ Ｍａｌｖｏｉｄｅａｅ ｆｏｒｍｅｄ ａｓ ｓｉｓｔｅｒ ｇｒｏｕｐ.
Ａｄｄｉｔｉｏｎａｌｌｙꎬ ｏｕｒ ｒｅｓｕｌｔｓ ｒｅｖｅａｌｅｄ ｎｏｎ￣ｍｏｎｏｐｈｙｌｙ ｉｎ ｔｒｉｂｅｓ Ａｄａｎｓｏｎｉｅａｅ ａｎｄ Ｂｏｍｂａｃｅａｅꎬ ａｓ ｗｅｌｌ ａｓ ｔｈｅ ｇｅｎｅｒａ Ｓｉｄａ ａｎｄ
Ｈｉｓｂｉｓｃｕｓ. Ｔｈｅ ｃｏｍｐｏｓｉｔｉｏｎ ａｎｄ ｔａｘｏｎｏｍｉｃ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｏｆ ｔｈｅｓｅ ｇｒｏｕｐｓ ｓｔｉｌｌ ｒｅｑｕｉｒｅ ｆｕｒｔｈｅｒ ｒｅｓｅａｒｃｈ. Ｔｈｉｓ ｓｔｕｄｙ ｃｌａｒｉｆｉｅｓ
ｃｒｉｔｉｃａｌ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓ ｗｉｔｈｉｎ ｔｈｅ Ｍａｌｖａｔｈｅｃａ ｃｌａｄｅ ｗｈｉｌｅ ｐｒｏｖｉｄｉｎｇ ｎｅｗ ｐｅｒｓｐｅｃｔｉｖｅｓ ｏｎ ｔｈｅ ｐｌａｓｔｏｍｅ
ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ ａｎｄ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｔｈｒｏｕｇｈ ｔｈｅ ｍｏｓｔ ｅｘｔｅｎｓｉｖｅｌｙ ｓａｍｐｌｅｄ ｐｌａｓｔｏｍｅ ｄａｔａｓｅｔ ｃｕｒｒｅｎｔｌｙ ａｖａｉｌａｂｌｅ ｆｏｒ ｔｈｉｓ ｃｌａｄｅ.
Ｋｅｙ ｗｏｒｄｓ: Ｍａｌｖａｔｈｅｃａ ｃｌａｄｅꎬ ｐｈｙｌｏｇｅｎｙꎬ ｐｌａｓｔｏｍｅꎬ Ｂｏｍｂａｃｏｉｄｅａｅꎬ Ｍａｌｖｏｉｄｅａｅꎬ Ｍａｌｖａｃｅａｅ

分 子 系 统 学 研 究 建 立 了 广 义 锦 葵 科 有很多具有重要的经济价值和生态意义的物种ꎬ
(Ｍａｌｖａｃｅａｅ ｓｅｎｓｕ ｌａｔｏ) 的系统框架ꎬ包含了传统的 一直备受关注ꎮ 整体上ꎬ锦葵亚科作为一个全球
木棉科(Ｂｏｍｂａｃａｃｅａｅ)、梧桐科(Ｓｔｅｒｃｕｌｉａｃｅａｅ) 及椴 广布的类群ꎬ包括约 ７８ 属超过 １ ８００ 种( Ｓｔｅｖｅｎｓꎬ
树 科 ( Ｔｉｌｉａｃｅａｅ) ( Ａｌｖｅｒｓｏｎ ｅｔ ａｌ.ꎬ １９９９ꎻ Ｂａｙｅｒ ｅｔ ２００１)ꎬ多为灌木或草本ꎬ其成员如棉( Ｇｏｓｓｙｐｉｕｍ
ａｌ.ꎬ １９９９)ꎮ 广义锦葵科内 ９ 个主要分支现已划分 ｈｉｒｓｕｔｕｍ Ｌ.)、 秋 葵 [ Ａｂｅｌｍｏｓｃｈｕｓ ｅｓｃｕｌｅｎｔｕｓ ( Ｌ.)

为 ９ 个 亚 科ꎬ 并 得 到 了 广 泛 的 认 可 ( Ｓｔｅｖｅｎｓꎬ Ｍｏｅｎｃｈ] 是 重 要 的 经 济 作 物ꎬ 而 木 槿 属 ( Ｈｉｂｉｓｃｕｓ
２００１)ꎮ 值得注意的是ꎬ系统发育分析揭示锦葵亚 Ｌ.)物种是全球广泛栽培的观赏植物ꎮ 相较之下ꎬ
科(Ｍａｌｖｏｉｄｅａｅ)和木棉亚科(Ｂｏｍｂａｃｏｉｄｅａｅ)构成一 木棉亚科约含 １７ 属 １６４ 种ꎬ多为热带森林中冠层
个高度支持分支ꎬ被命名为 Ｍａｌｖａｔｈｅｃａ 分支ꎮ 该分 优势物种ꎬ典型代表包括具有生态指示意义的木
支整 合 了 传 统 分 类 学 中 的 锦 葵 科 与 木 棉 科 棉(Ｂｏｍｂａｘ ｃｅｉｂａ Ｌ.)ꎬ以及具有独特储水结构的猴
(Ｂｏｍｂａｃａｃｅａｅ)核心类群( Ｂａｕｍ ｅｔ ａｌ.ꎬ １９９８)ꎬ拥 面包树(Ａｄａｎｓｏｎｉａ ｄｉｇｉｔａｔａ Ｌ.)ꎮ