Page 146 - 《广西植物》2025年第12期

２ ２ ８ ８ 广 西 植 物 ４５ 卷

不同小写字母表示各指标在 ０.０５ 水平差异显著ꎮ
Ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｌｏｗｅｒｃａｓｅ ｌｅｔｔｅｒｓ ｉｎｄｉｃａｔｅ ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔ ｄｉｆｆｅｒｅｎｃｅｓ ａｍｏｎｇ ｔｈｅ ｉｎｄｉｃａｔｏｒｓ ａｔ ｔｈｅ ０.０５ ｌｅｖｅｌ.
图 １ 川白芷和兴安白芷在低温和常温处理中的发芽率(ａ)、发芽势(ｂ)
Ｆｉｇ. １ Ｇｅｒｍｉｎａｔｉｏｎ ｒａｔｅｓ (ａ)ꎬ ａｎｄ ｇｅｒｍｉｎａｔｉｏｎ ｐｏｔｅｎｔｉａｌｓ (ｂ) ｏｆ Ａｎｇｅｌｉｃａ ｄａｈｕｒｉｃａ ａｎｄ Ａ. ｄａｈｕｒｉｃａ
ｃｖ. ‘Ｈａｎｇｂａｉｚｈｉ’ ｕｎｄｅｒ ｌｏｗ￣ｔｅｍｐｅｒａｔｕｒｅ ａｎｄ ｎｏｒｍａｌ￣ｔｅｍｐｅｒａｔｕｒｅ ｔｒｅａｔｍｅｎｔｓ

２.２ 转录组测序与注释 表 ３ Ｕｎｉｇｅｎｅ 注释统计
对 １２ 个样品进行转录组测序ꎬ共获得 ８０.８４４ Ｔａｂｌｅ ３ Ｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌ ｏｆ Ｕｎｉｇｅｎｅ ａｎｎｏｔａｔｉｏｎ
Ｇｂ Ｃｌｅａｎ Ｄａｔａꎬ各样品 Ｃｌｅａｎ Ｄａｔａ 均为 ７.２０ Ｇｂ 以 数据库 数量 ３００≤长度<１ ０００ 长度≥１ ０００
上ꎬＱ３０ 碱基百分比最低为 ９０.３８％ꎮ 后续对其进 Ｄａｔａｂａｓｅ Ｎｕｍｂｅｒ ３００≤Ｌｅｎｇｔｈ<１ ０００ Ｌｅｎｇｔｈ≥１ ０００
行组 装ꎬ 并 以 ＢＬＡＳＴ 参 数 Ｅ￣ｖａｌｕｅ ≤ １ × １０ 和 ＣＯＧ １５ ５４８ ７ ７４１ ７ ８０７
￣５
ＨＭＭＥＲ 参数 Ｅ￣ｖａｌｕｅ≤１ × １０ ￣１０ 为筛选条件ꎬ获得 ＧＯ ３５ ４５４ １８ ３７５ １７ ０６７
ＫＥＧＧ ２９ ６８３ １５ ０８１ １４ ６０２
４８ ０８１条有注释信息的 Ｕｎｉｇｅｎｅ(表 ３)ꎮ
２.３ 组间相关性分析 ＫＯＧ ２６ １９６ １３ ８８５ １２ ３１１
Ｐｆａｍ ３４ ９７６ １７ ５２１ １７ ４５５
计算组内样品间的皮尔逊相关性系数(Ｒ )ꎬ评
２
Ｓｗｉｓｓ￣Ｐｒｏｔ ２６ ０６３ １２ ２３４ １３ ８２９
估组内生物学样本的重复性ꎮ 结果(图 ２)表明ꎬ各
ＴｒＥＭＢＬ ４０ ３３３ ２０ ４７１ １９ ８６２
处理组内 ３ 个生物学重复间的相关性系数 Ｒ 均大
２
ｅｇｇＮＯＧ ３２ ０５８ １５ ２９７ １６ ７６１
于其他组别ꎬ表明各处理组内的样品生物学重复性
ＮＲ ４６ ７８７ ２６ １５１ ２０ ６３６
较好ꎬ为后续差异表达基因分析提供保障ꎮ
总计 Ｔｏｔａｌ ４８ ０８１ ２７ ２８５ ２０ ７８４
２.４ Ｘ＿ｖｓ＿ＸＬ、Ｃ＿ｖｓ＿ＣＬ 差异表达基因比对
基于 Ｕｎｉｇｅｎｅ 库的筛选结果进行差异基因比
同样在分子功能中表现出 ＡＢＡ 结合活性ꎮ 这表明
对ꎬ获得 Ｘ＿ｖｓ＿ＸＬ、Ｃ＿ｖｓ＿ＣＬ 两组差异比较基因ꎮ Ｘ＿
ｖｓ＿ＸＬ 有差异基因 １２ １２０ 条ꎬ其中 ６ ４５４ 条上调表 低温胁迫下种子通过调控基因表达ꎬ控制次生代
谢物的合成、运输和代谢等生理生化过程ꎬ特别是
达ꎬ５ ６６６ 条下调表达ꎻＣ＿ｖｓ＿ＣＬ 有差异基因 １４ ２４６
ＡＢＡ 与 ＧＡ 等关键激 素 基 因 的 表 达、转 运、识 别
条ꎬ其中 ７ ３６１ 条上调表达ꎬ６ ８８５ 条下调表达(图 ３)ꎮ
２.５ Ｘ＿ｖｓ＿ＸＬ、Ｃ＿ｖｓ＿ＣＬ 差异表达基因 ＧＯ 富集分析 等ꎬ为解析 ２ 个物种抗寒能力的分子差异提供了
将差异表达基因注释到 ＧＯ 数据库中ꎬ共注释 转录组水平依据ꎮ

到细胞组分、分子功能和生物过程( 图 ４)ꎮ 其中ꎬ ２.６ 差异表达基因 ＫＥＧＧ 通路分析
Ｘ＿ｖｓ＿ＸＬ 在分子功能中富集 ＡＢＡ 结合活性ꎬ并且 ２.６.１ 白芷低温萌发前后差异表达基因 ＫＥＧＧ 代谢

在生物过程中富集对 ＧＡ 的响应途径ꎮ Ｃ＿ｖｓ＿ＣＬ 通路分析 将 Ｘ＿ｖｓ＿ＸＬ 与 Ｃ＿ｖｓ＿ＣＬ 的差异基因在