Page 150 - 《广西植物》2025年第3期
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５ ３ ０ 广 西 植 物 ４５ 卷
表 １ ３８ 份样品转录组数据的 ＧｅｎＢａｎｋ 登录号
Ｔａｂｌｅ １ ＧｅｎＢａｎｋ ａｃｃｅｓｓｉｏｎ ｎｕｍｂｅｒｓ ｏｆ ｔｈｅ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ ｄａｔａ ｏｆ ３８ ｓａｍｐｌｅｓ
物种名 ＳＳＲ 号 物种名 ＳＳＲ 号
Ｓｐｅｃｉｅｓ ｎａｍｅ ＳＳＲ ｎｕｍｂｅｒ Ｓｐｅｃｉｅｓ ｎａｍｅ ＳＳＲ ｎｕｍｂｅｒ
狭叶茶 ＳＲＲ１９２６６７２８ 汝城毛叶茶 ＳＲＲ１９２６６７２６
Ｃａｍｅｌｌｉａ ａｎｇｕｓｔｉｆｏｌｉａ Ｃ. ｐｕｂｅｓｃｅｎｓ
大树茶 ＳＲＲ１９２６６７２３ 茶梅 ＳＲＲ１９２６６６７９
Ｃ. ａｒｂｏｒｅｓｃｅｎｓ Ｃ. ｓａｓａｎｑｕａ
老黑茶 ＳＲＲ１９２６６７３５ 安吉白茶 ＳＲＲ１８４９９２９
Ｃ. ａｔｒｏｔｈｅａ Ｃ. ｓｉｎｅｎｓｉｓ ｖａｒ. ｓｉｎｅｎｓｉｓ ‘ＡＪＢＣ’
厚轴茶 ＳＲＲ１９２６６７２２ 英红 ９ 号 ＳＲＲ１９２６６６６８
Ｃ. ｃｒａｓｓｉｃｏｌｕｍｎａ Ｃ. ｓｉｎｅｎｓｉｓ ｖａｒ. ａｓｓａｍｉｃａ ‘ＹＨ９’
丹寨秃茶 ＳＲＲ１９２６６６６５ 云抗 １０ 号 ＳＲＲ１９２６６７２５
Ｃ. ｄａｎｚａｉｅｎｓｉｓ Ｃ. ｓｉｎｅｎｓｉｓ ｖａｒ. ａｓｓａｍｉｃａ ‘ＹＫ１０’
糙果茶 ＳＲＲ１９２６６７５４ 紫鹃 ＳＲＲ１９２６６６６９
Ｃ. ｆｕｒｆｕｒａｃｅａ Ｃ. ｓｉｎｅｎｓｉｓ ｖａｒ. ａｓｓａｍｉｃａ ‘ＺＪ’
弄岗金花茶 ＳＲＲ１９２６６７４３ 白鸡冠 ＳＲＲ２７８１８４７
Ｃ. ｇｒａｎｄｉｓ Ｃ. ｓｉｎｅｎｓｉｓ ｖａｒ. ｓｉｎｅｎｓｉｓ ‘ＢＪＧ’
秃房茶 ＳＲＲ１９２６６７３１ 黄金芽 １ 号 ＳＲＲ５０７５６４１
Ｃ. ｇｙｍｎｏｇｙｎａ Ｃ. ｓｉｎｅｎｓｉｓ ｖａｒ. ｓｉｎｅｎｓｉｓ ‘ＨＪ１’
河口超长柄茶 ＳＲＲ１９２６６６６７ 金萱 ＳＲＲ２１９１７６９
Ｃ. ｈｅｋｏｕｅｎｓｉｓ Ｃ. ｓｉｎｅｎｓｉｓ ｖａｒ. ｓｉｎｅｎｓｉｓ ‘ＪＸ’
缙云山茶 ＳＲＲ１９２６６７３０ 宁州 ２ 号 ＳＲＲ２７３０１４１
Ｃ. ｊｉｎｇｙｕｎｓｈａｎｉｃａ Ｃ. ｓｉｎｅｎｓｉｓ ｖａｒ. ｓｉｎｅｎｓｉｓ ‘ＮＺ２’
金沙江红山茶 ＳＲＲ１９２６６７００ 舒茶早 ＳＲＲ１９２８１４９
Ｃ. ｊｉｎｓｈａｊｉａｎｇｉｃａ Ｃ. ｓｉｎｅｎｓｉｓ ｖａｒ. ｓｉｎｅｎｓｉｓ ‘ＳＣＺ’
广西茶 ＳＲＲ１９２６６７３８ 福鼎大白 ＳＲＲ１９２６６６７２
Ｃ. ｋｗａｎｇｓｉｅｎｓｉｓ Ｃ. ｓｉｎｅｎｓｉｓ ｖａｒ. ｓｉｎｅｎｓｉｓ ‘ＦＤＤＢ’
广东秃茶 ＳＲＲ１９２６６６６６ 龙井 ＳＲＲ１９２６６７２１
Ｃ. ｋｗａｎｇｔｕｎｇｅｎｓｉｓ Ｃ. ｓｉｎｅｎｓｉｓ ｖａｒ. ｓｉｎｅｎｓｉｓ ‘ＬＪ’
膜叶茶 ＳＲＲ１９２６６７３２ 铁观音 ＳＲＲ１９２６６６７１
Ｃ. ｌｅｐｔｏｐｈｙｌｌａ Ｃ. ｓｉｎｅｎｓｉｓ ｖａｒ. ｓｉｎｅｎｓｉｓ ‘ＴＧＹ’
马关茶 ＳＲＲ１９２６６７３４ 大厂茶 ＳＲＲ１９２６６７３７
Ｃ. ｍａｋｕａｎｉｃａ Ｃ. ｔａｃｈａｎｇｅｎｓｉｓ
小长尾连蕊茶 ＳＲＲ１９２６６７６１ 大理茶 ＳＲＲ１９２６６７３３
Ｃ. ｐａｒｖｉｃａｕｄａｔａ Ｃ. ｔａｌｉｅｎｓｉｓ
细萼茶 ＳＲＲ１９２６６７２４ 四球茶 ＳＲＲ１９２６６７３６
Ｃ. ｐａｒｖｉｓｅｐａｌａ Ｃ. ｔｅｔｒａｃｏｃｃａ
西南红山茶 ＳＲＲ１９２６６６８９ 瘤果茶 ＳＲＲ１９２６６７１１
Ｃ. ｐｉｔａｒｄｉｉ Ｃ. ｔｕｂｅｒｃｕｌａｔａ
毛叶茶 ＳＲＲ１９２６６７２７ 四川大头茶 ＳＲＲ１９２６６７５７
Ｃ. ｐｔｉｌｏｐｈｙｌｌａ Ｐｏｌｙｓｐｏｒａ ｓｐｅｃｉｏｓａ
在 ＮＢＣＩ 上 进 行 相 似 性 搜 索ꎬ 下 载 山 茶 科 ７７ 种 以及碱基组成频率ꎮ 以圆籽荷( Ａ. ｏｂｌａｔａ) 为外类
( 含变种) 植 物 的 １０３ 条 叶 绿 体 基 因 组 序 列 ( 表 群( 闫明慧等ꎬ２０２１) ꎬ基于叶 绿 体 基 因 组 序 列ꎬ
２) ꎬ 包 含 山 茶 属 ７６ 种 ( 含 变 种 ) ꎬ 圆 籽 荷 属 用 ＲＡｘＭＬ ７.２.６ 软件( Ｓｔａｍａｔａｋｉｓꎬ ２００６) 中的最
( Ａｐｔｅｒｏｓｐｅｒｍａ)１ 种ꎮ 除茶这一物种共下载 ２９ 条 大似然法( ｍａｘｉｍｕｍ ｌｉｋｅｌｉｈｏｏｄꎬ ＭＬ) 构建系统发
序列以外ꎬ其余每种下载 １ 条序列ꎮ 使用 ＭＡＦＦＴ 育树ꎬ碱基替换模型设定为 ＧＴＲＧＡＭＭＡꎬ用随机
７.４９０ 软件( Ｋａｔｏｈ ＆ Ｓｔａｎｄｌｅｙꎬ ２０１３) 对所有序列 起 始 树ꎬ 矩 阵 重 复 抽 样 １００ 次 计 算 支 持 率
进行比对ꎬ再用 ＢｉｏＥｄｉｔ ７.２.５ 软件( Ｈａｌｌꎬ １９９９) ( ｂｏｏｔｓｔｒａｐ ｓｕｐｐｏｒｔ) ꎮ
手工调整ꎮ 使 用 ＭＥＧＡ ７. ０ 软 件 ( Ｋｕｍａｒ ｅｔ ａｌ.ꎬ 用 ＭＵＳＣＬＥ ３.８.１ 软件( Ｅｄｇａｒꎬ ２００４) 对 ７９８
２０１６) 计算叶绿体基因组矩阵的长度、变异位点 个单拷贝核基因序列分别进行比对ꎬ之后用自创 Ｒ
