Page 179 - 《广西植物》2025年第3期

３ 期 蒋凯等: 叶绿体序列和核微卫星显示同域分布润楠属物种杂交严重 ５ ５ ９

图 １ １２ 个润楠属物种的采样图及其潜在分布区
Ｆｉｇ. １ Ｓａｍｐｌｉｎｇ ｍａｐ ｏｆ １２ Ｍａｃｈｉｌｕｓ ｓｐｅｃｉｅｓ ａｎｄ ｔｈｅｉｒ ｐｏｔｅｎｔｉａｌ ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎｓ

分 析 之 前 我 们 使 用 Ｍｉｃｒｏｃｈｅｃｋｅｒ 软 件 ( Ｖａｎ 设置 的 Ｋ 值 对 微 卫 星 数 据 分 别 进 行 迭 代 周 期
Ｏｏｓｔｅｒｈｏｕｔ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２００４)对每个种群的哑等位基因 (ｌｅｎｇｔｈ ｏｆ ｐｅｒｉｏｄ)为 １×１０ 、ＭＣＭＣ 为 １×１０ 次的运
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进行检测ꎮ 算ꎬ计算时选择混合模型(ａｄｍｉｘｔｕｒｅ ｍｏｄｅｌ)ꎮ 使用
１.５.２ 种群遗传多样性分析 计算平均等位基因 Ｅｖａｎｎｏ 等(２００５) 的方法得出最优物种数 Ｋꎬ使用
数(ｍｅａｎ ｎｕｍｂｅｒ ｏｆ ａｌｌｅｌｅｓꎬ Ａ) 和等位基因丰富度 最优 Ｋ 值对分析的 １２ 个物种进行分类ꎮ 本文使
(ａｌｌｅｌｅ ｒｉｃｈｎｅｓｓꎬ Ａ ) 来衡量种群遗传多样性ꎮ 使 用基于 Ｄ 遗传距离的邻接树( ＮＪ) 法获得每个物
Ｒ Ａ
用 ＴＦＰＧＡ ｖ１. ３ 软 件 ( ｈｔｔｐ: / / ｗｗｗ. ｍａｒｋｓｇｅｎｅｔｉｃ￣ 种间 遗 传 距 离 之 间 的 关 系ꎮ 相 关 分 析 使 用
ｓｏｆｔｗａｒｅ.ｎｅｔ/ ) 计 算 期 望 杂 合 度 ( ｕｎｂｉａｓｅｄ Ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ １.２.３０ 软件 ( ｈｔｔｐｓ: / / ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ.ｏｒｇ /
ｈｅｔｅｒｏｚｙｏｕｓｉｔｙꎬ Ｈ ) 和 观 察 杂 合 度 ( ｏｂｓｅｒｖｅｄ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓ/ )计算ꎮ 每个节点使用基于 １ ０００ 次重
Ｅ
ｈｅｔｅｒｏｚｙｏｕｓｉｔｙꎬ Ｈ )ꎮ 在 ＦＳＴＡＴ ｖ２.９.３.２ 软件中经 复的自展概率值进行估算ꎮ
Ｏ
过 １ ０００ 次模拟来检验总的近交系数( ｉｎｂｒｅｅｄｉｎｇ
ｃｏｅｆｆｉｃｉｅｎｔꎬ Ｆ )是否显著偏离 ０ꎮ ２ 结果与分析
ＩＳ
１.５. ３ 遗 传 聚 类 分 析 采 用 ＳＴＲＵＣＴＵＲＥ ｖ２. ３
(Ｐｒｉｔｃｈａｒｄ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０００) 对 １２ 个物种进行聚类分 ２.１ 叶绿体基因组序列分析
析ꎬ推断种群遗传结构及每个个体在种群中分布 ２.１.１ 叶绿体基因组基本信息 使用 ７２ 对引物对
的概率ꎮ 在软件中设置 Ｋ ＝ １ 到 Ｋ ＝ １５ꎬ基于以上 润楠属 １２ 个物种的长单拷贝区域进行扩增测序ꎬ