Page 11 - 《广西植物》2025年第4期

４ 期 付晓莹等: 中国特有种勐海冷水花(荨麻科)的重新发现、补充描述及其系统位置探讨 ６ ２ ５

表 ２ 叶绿体基因组矩阵特征统计
Ｔａｂｌｅ ２ Ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃ ｓｔａｔｉｓｔｉｃｓ ｏｆ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｍａｔｒｉｘ
有效信息位点 有效信息位点占比
变异位点 变异位点占比
序列数 比对后长度 Ｐａｒｓｉｍｏｎｙ￣ Ｐｅｒｃｅｎｔａｇｅ ｏｆ
矩阵 Ｖａｒｉａｂｌｅ Ｐｅｒｃｅｎｔａｇｅ ｏｆ
Ｎｕｍｂｅｒ ｏｆ Ａｌｉｇｎｅｄ ｉｎｆｏｒｍａｔｉｖｅ ｐａｒｓｉｍｏｎｙ￣
Ｍａｔｒｉｘ ｓｉｔｅ ｖａｒｉａｂｌｅ ｓｉｔｅ
ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｌｅｎｇｔｈ (ｂｐ) ｓｉｔｅ ｉｎｆｏｒｍａｔｉｖｅ
(ｂｐ) (％)
(ｂｐ) ｓｉｔｅ (％)
叶绿体基因组 ｃｐＤＮＡ ２５ ６１ ７０９ １２ ３０５ １９.９４ ７ ８４８ ６３.７８
表 ３ 核质片段串联矩阵特征统计
Ｔａｂｌｅ ３ Ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃ ｓｔａｔｉｓｔｉｃｓ ｏｆ ｎｕｃｌｅｏｐｌａｓｍｉｃ ｆｒａｇｍｅｎｔ ｔａｎｄｅｍ ｍａｔｒｉｘ
有效信息位点 有效信息位点占比
变异位点
序列数 比对后长度 变异位点占比 Ｐａｒｓｉｍｏｎｙ￣ Ｐｅｒｃｅｎｔａｇｅ ｏｆ
矩阵 Ｖａｒｉａｂｌｅ
Ｎｕｍｂｅｒ ｏｆ Ａｌｉｇｎｅｄ ｌｅｎｇｔｈ Ｐｅｒｃｅｎｔａｇｅ ｏｆ ｉｎｆｏｒｍａｔｉｖｅ ｐａｒｓｉｍｏｎｙ￣
Ｍａｔｒｉｘ ｓｉｔｅ
ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ (ｂｐ) ｖａｒｉａｂｌｅ ｓｉｔｅ (％) ｓｉｔｅ ｉｎｆｏｒｍａｔｉｖｅ
(ｂｐ)
(ｂｐ) ｓｉｔｅ (％)
ＩＴＳ １４２ ５１３ ３６９ ７１.９３ ３１９ ８６.４５
ｒｂｃＬ ８９ ６３１ １３６ ２１.５５ ７８ ５７.３５
ｔｒｎＬ￣Ｆ １３９ ７２７ ４８２ ６６.３０ ３２７ ６７.８４
联合的 Ｃｏｍｂｉｎｅｄ １４２ １ ８７１ ９８７ ５２.７５ ７２４ ７３.３５

分支上的数字分别代表最大似然法的靴带值≥６０％和贝叶斯法的后验概率≥０.８ꎮ
Ｎｕｍｂｅｒｓ ｕｎｄｅｒ ｔｈｅ ｂｒａｎｃｈｅｓ ｉｎｄｉｃａｔｅ ｔｈｅ ｂｏｏｔｓｔｒａｐ ｖａｌｕｅｓ (≥６０％) ｏｆ ｍａｘｉｍｕｍ ｌｉｋｅｌｉｈｏｏｄ ａｎｄ ｔｈｅ ｐｏｓｔｅｒｉｏｒ ｐｒｏｂａｂｉｌｉｔｙ (≥０.８) ｏｆ ＢＩ.
图 ３ 基于叶绿体基因组编码蛋白基因序列(左)与核基因与叶绿体 ＤＮＡ 片段联合矩阵(ＩＴＳ、
ｔｒｎＬ￣Ｆ、 ｒｂｃＬ)(右)的最大似然法(ＭＬ)和贝叶斯法(ＢＩ)构建的冷水花属系统发育树
Ｆｉｇ. ３ Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｔｒｅｅｓ ｏｆ Ｐｉｌｅａ ｃｏｎｓｔｒｕｃｔｅｄ ｂｙ ｍａｘｉｍｕｍ ｌｉｋｅｌｉｈｏｏｄ (ＭＬ) ａｎｄ Ｂａｙｅｓｉａｎ ｉｎｆｅｒｅｎｃｅ (ＢＩ) ｂａｓｅｄ ｏｎ
ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ￣ｅｎｃｏｄｅｄ ｐｒｏｔｅｉｎ ｇｅｎｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ (ｌｅｆｔ) ａｎｄ ａ ｃｏｍｂｉｎｅｄ ｍａｔｒｉｘ ｏｆ ｎｕｃｌｅａｒ ｇｅｎｅｓ ａｎｄ
ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ＤＮＡ ｆｒａｇｍｅｎｔｓ (ＩＴＳꎬ ｔｒｎＬ￣Ｆ ａｎｄ ｒｂｃＬ)

７ ８４８ ｂｐ( 占变异位点长的 ６３.７８％)ꎮ 由表 ３ 可 有效 信 息 位 点 为 ７２４ ｂｐ ( 占 变 异 位 点 长 的
知ꎬ核基因与叶绿体基因组序列串联矩阵长 １ ８７１ ７３.３５％)ꎮ 通过 ＭＬ 和 ＢＩ 构建系统发育树ꎬ结果
ｂｐꎬ其中变异位点为 ９８７ ｂｐ( 占总长的 ５２.７５％)ꎬ 如图 ３ 所示ꎬ所有节点均得到高支持率ꎮ 其中ꎬ勐