Page 121 - 《广西植物》2025年第4期
P. 121

4 期                 李金梅等: 基于 SLAF ̄seq 的广西八角种质资源遗传多样性分析                                      7 3 5














































                                             图 1  95 份八角种质资源的 PCA 图
                                     Fig. 1  PCA chart of 95 Illicium verum germplasm resources


            于桂 北、 桂 西 和 3 份 桂 中 部 地 区 的 居 群 样 本                八角居群样本聚为Ⅱ ̄3 亚类群ꎮ 以上分析结果表
            (NNSL3、NNSL4、NNSL5)ꎻ类群Ⅱ为桂东、桂南和                     明ꎬ不同地区八角居群样本的遗传结构在地理分
            余下的桂中部地区八角居群样本及 42 份经过人                            布上具有明显的地域特征ꎻ此外ꎬ人工筛选的优良
            工筛选的优良种质材料( 图 2)ꎮ 根据系统发育树                          种质材料与桂南、桂东和桂中地区的八角居群样
            结构进一步分析ꎬ可以将大类群Ⅱ样本细分为 3                             本之间的亲缘关系更为接近ꎮ
            个亚类群ꎬ其中大部分桂南、桂东、桂中部地区的                             2.4 群体遗传结构

            八角居群样本各自聚为 1 个亚类群(Ⅱ ̄1、Ⅱ ̄2、Ⅱ ̄                           为进一步了解广西八角的遗传背景关系ꎬ本
            3)ꎬ42 份经过人工筛选的优良种质材料则穿插分                           研究利用上述具有高度一致性 SNP 分子标记ꎬ通
            布于 3 个亚类群中ꎮ 具体而言ꎬ有 14 份人工筛选                        过 Admixture 分析 95 份八角种质的群体遗传结构

            优良种质( HZ1、HZ2、HZ ̄1、HZ ̄2、EN2、EN3、SJ1、               (图 3)ꎮ 交叉验证聚类结果显示ꎬ当 K = 2 时ꎬ交叉
            SJ2、FJJ1、FJJ2、RG1、RG2、BH1、BH2) 与桂南地区               验证错误率与 K = 1 时几乎相近ꎬ表明这些样本分
            八角居群样本聚合为Ⅱ ̄1 亚类群ꎻ21 份人工筛选                          成 1 个类群或者 2 个类群均是比较合理的ꎮ 当

            优良种质( LM1、LM2、LM3、ME1、ME2、ME3、HY1、                 K = 2 时ꎬ95 份八角样本划分成 2 个不同的群体
            HY2、HY3、CP1、CP3、GJ1、GJ3、MW1、MW2、MW3、               (图 3:A)ꎬ与 PCA 和系统发育树分类结果高度一
            SS1、SS2、SS3、MT1、MT2) 与桂东地区八角居群样                    致ꎮ 因此ꎬ本文认为 K = 2 相比于 K = 1 是更为合理
            本聚为Ⅱ ̄2 亚类群ꎻ7 份人工筛选优良种质( CP2、                       的分群方法ꎮ 基于 K = 2 的分组结果( 图 3:B)ꎬ类
            MT3、EN1、GJ2、DR1、DR2、DR3) 则与桂中部地区                   群Ⅰ基本为蓝色基因型样本ꎬ 少部分样本混杂了
   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126