Page 117 - 《广西植物》2025年第4期

４ 期 李金梅等: 基于 ＳＬＡＦ￣ｓｅｑ 的广西八角种质资源遗传多样性分析 ７ ３ １

ｔｈｅ ｓｐｅｃｉｆｉｃ ｌｏｃｕｓ ａｍｐｌｉｆｉｅｄ ｆｒａｇｍｅｎｔ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ( ＳＬＡＦ￣ｓｅｑ) ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ｗａｓ ｅｍｐｌｏｙｅｄ. Ｔｈｉｓ ｅｎａｂｌｅｄ ａｎ ｉｎ￣ｄｅｐｔｈ
ｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｉｏｎ ｉｎｔｏ ｔｈｅ ｓｉｎｇｌｅ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ (ＳＮＰ) ｌｏｃｉ ａｃｒｏｓｓ ５３ ｓｔａｒ ａｎｉｓｅ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ ｓａｍｐｌｅｓꎬ ｇａｔｈｅｒｅｄ ｆｒｏｍ
ａ ｖａｒｉｅｔｙ ｏｆ ｇｅｏｇｒａｐｈｉｃａｌ ｔｅｒｒｉｔｏｒｉｅｓ ｗｉｔｈｉｎ Ｇｕａｎｇｘｉꎬ ａｓ ｗｅｌｌ ａｓ ４２ ｓａｍｐｌｅｓ ｏｆ ａｒｔｉｆｉｃｉａｌｌｙ ｓｅｌｅｃｔｅｄ ｓｕｐｅｒｉｏｒ
ｇｅｒｍｐｌａｓｍ. Ｂａｓｅｄ ｏｎ ＳＮＰ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍꎬ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ ｇｅｎｅｔｉｃ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ａｎｄ ｇｅｎｅｔｉｃ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ａｎａｌｙｓｅｓ ｗｅｒｅ ｃｏｎｄｕｃｔｅｄ ｏｎ
ｔｈｅｓｅ ｓｔａｒ ａｎｉｓｅ ｓａｍｐｌｅｓ. Ｔｈｅ ｒｅｓｕｌｔｓ ｗｅｒｅ ａｓ ｆｏｌｌｏｗｓ: (１) Ｆｒｏｍ ９５ ｓｔａｒ ａｎｉｓｅ ｓａｍｐｌｅｓꎬ ａ ｔｏｔａｌ ｏｆ １ ５８８ Ｍｂ ｏｆ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ
ｄａｔａ ａｎｄ ６４３ ６９０ ＳＬＡＦ ｔａｇｓ ｗｅｒｅ ｏｂｔａｉｎｅｄꎬ ｏｆ ｗｈｉｃｈ ７４ ４３４ ｗｅｒｅ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃ ＳＬＡＦ ｔａｇｓ. Ａｆｔｅｒ ｆｉｌｔｅｒｉｎｇꎬ ２ ６９０ ５６４
ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ ＳＮＰｓ ｗｅｒｅ ｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄ. (２) Ｔｈｅ ９５ ｓｔａｒ ａｎｉｓｅ ｓａｍｐｌｅｓ ｗｅｒｅ ｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ ｉｎｔｏ ｔｗｏ ｆｕｎｄａｍｅｎｔａｌ ｃｌｕｓｔｅｒｓ: ＣｌｕｓｔｅｒⅠ
ａｓｓｉｍｉｌａｔｅｄ ｓａｍｐｌｅｓ ｏｒｉｇｉｎａｔｉｎｇ ｆｒｏｍ ｔｈｅ Ｎｏｒｔｈ Ｇｕａｎｇｘｉꎬ Ｗｅｓｔ Ｇｕａｎｇｘｉꎬ ａｎｄ ｓｏｍｅ ｒｅｇｉｏｎｓ ｏｆ Ｃｅｎｔｒａｌ Ｇｕａｎｇｘｉꎬ ｗｈｅｒｅａｓ
Ｃｌｕｓｔｅｒ Ⅱ ｅｍｂｒａｃｅｄ ｔｈｅ ４２ ｓａｍｐｌｅｓ ｏｆ ａｒｔｉｆｉｃｉａｌｌｙ ｓｅｌｅｃｔｅｄ ｓｕｐｅｒｉｏｒ ｇｅｒｍｐｌａｓｍꎬ ｃｏｕｐｌｅｄ ｗｉｔｈ ｓａｍｐｌｅｓ ｆｒｏｍ Ｓｏｕｔｈ
Ｇｕａｎｇｘｉꎬ Ｅａｓｔ Ｇｕａｎｇｘｉꎬ ａｎｄ ｐｏｒｔｉｏｎｓ ｏｆ Ｃｅｎｔｒａｌ Ｇｕａｎｇｘｉ. (３) Ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓ ｆｒｏｍ Ｎｏｒｔｈ Ｇｕａｎｇｘｉ ｅｘｈｉｂｉｔｅｄ ｔｈｅ ｈｉｇｈｅｓｔ
ｌｅｖｅｌ ｏｆ ｇｅｎｅｔｉｃ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙꎬ ｆｏｌｌｏｗｅｄ ｓｅｑｕｅｎｔｉａｌｌｙ ｂｙ ｔｈｏｓｅ ｆｒｏｍ Ｅａｓｔꎬ Ｃｅｎｔｒａｌꎬ Ｗｅｓｔꎬ ａｎｄ Ｓｏｕｔｈ Ｇｕａｎｇｘｉ. Ｉｎ ｃｏｎｔｒａｓｔꎬ ｔｈｅ
ａｒｔｉｆｉｃｉａｌｌｙ ｓｅｌｅｃｔｅｄ ｓｕｐｅｒｉｏｒ ｇｅｒｍｐｌａｓｍ ｓａｍｐｌｅｓ ｄｉｓｐｌａｙｅｄ ｔｈｅ ｌｏｗｅｓｔ ｄｅｇｒｅｅ ｏｆ ｇｅｎｅｔｉｃ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ. Ｉｎ ｃｏｎｃｌｕｓｉｏｎꎬ ｔｈｅ ｓｔｕｄｙ
ｅｆｆｅｃｔｉｖｅｌｙ ｄｅｍｏｎｓｔｒａｔｅｓ ｔｈａｔ ＳＮＰ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｍａｒｋｅｒｓꎬ ｄｅｒｉｖｅｄ ｆｒｏｍ ＳＬＡＦ￣ｓｅｑ ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙꎬ ａｒｅ ｃａｐａｂｌｅ ｏｆ ｅｆｆｉｃｉｅｎｔｌｙ
ａｓｓｅｓｓｉｎｇ ｔｈｅ ｇｅｎｅｔｉｃ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｉｎ ｓａｍｐｌｅｓ ｆｒｏｍ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｒｅｇｉｏｎｓ ｏｆ Ｇｕａｎｇｘｉ ａｎｄ ｔｈｅ ｓａｍｐｌｅｓ ｏｆ ａｒｔｉｆｉｃｉａｌｌｙ ｓｅｌｅｃｔｅｄ
ｓｕｐｅｒｉｏｒ ｇｅｒｍｐｌａｓｍ. Ｔｈｉｓ ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ ａｃｔｓ ａｓ ａ ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔ ｔｈｅｏｒｅｔｉｃａｌ ｇｕｉｄｅ ｆｏｒ ｔｈｅ ｃｏｎｓｅｒｖａｔｉｏｎꎬ ｕｔｉｌｉｚａｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ｓｔａｒ
ａｎｉｓｅ ｇｅｎｅｔｉｃ ｒｅｓｏｕｒｃｅｓ ｉｎ Ｇｕａｎｇｘｉꎬ ａｓ ｗｅｌｌ ａｓ ｔｈｅ ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ ｏｆ ｓｕｐｅｒｉｏｒ ｇｅｒｍｐｌａｓｍｓ.
Ｋｅｙ ｗｏｒｄｓ: Ｉｌｌｉｃｉｕｍ ｖｅｒｕｍꎬ ＳＬＡＦ￣ｓｅｑꎬ ＳＮＰꎬ ｇｅｎｅｔｉｃ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅꎬ ｇｅｎｅｔｉｃ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ

八角(Ｉｌｌｉｃｉｕｍ ｖｅｒｕｍ)ꎬ又称为大茴香或八角茴 以提高其生产力ꎮ 目前ꎬ八角的研究主要集中在
香ꎬ隶属于八角科(Ｉｌｌｉｃｉａｃｅａｅ)八角属(Ｉｌｌｉｃｉｕｍ)ꎮ 从 其生物学特性、活性成分和药理作用等方面ꎬ如陆
系统发育学的角度来看ꎬ八角被划分为被子植物门 华业等(２０２４)探究光氮互作对八角幼苗生长和生
中的一个古老分支ꎬ揭示出它与木兰目植物的密切 理特性的影响ꎬ发现光照强度对八角幼苗的生长
亲缘关系ꎬ代表被子植物早期演化的一部分(中国 至关重要ꎮ 此外ꎬ已有研究对八角的化学成分和
科学院中国植物志编辑委员会ꎬ２０１６ꎻＣｈｅｎ ｅｔ ａｌ.ꎬ 药理学研究进展进行了详细综述ꎬ表明八角的生
２０１９)ꎮ 八角科植物的特征包括具有芳香的气味和 物活性取决于是否存在有价值的次生代谢物ꎬ如
独特的果实结构ꎬ凸显了其在植物分类中的特殊地 单萜类、倍半萜类、苯丙烷类和黄酮类等( Ｐａｔｒａ ｅｔ
位(孙雪阳等ꎬ２０１１ꎻ曾丽萍等ꎬ２０１４)ꎮ 八角是一种 ａｌ.ꎬ ２０２０ꎻ Ｓｈａｒａｆａｎ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２２ )ꎮ 同 时ꎬ Ｌｉ 等
重要的香料和药材资源ꎬ在经济和药用方面具有不 (２０２２)通过鉴定八角果实中的 ２０ 种化合物ꎬ并评
可忽视的价值(Ｗａｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１１)ꎮ 八角的干燥成 估它们的抗病毒和抗氧化活性ꎬ为开发新的天然
熟果实富含高浓度的芳香油ꎬ是食品工业中极为重 产物提供了科学基础ꎮ 但是目前ꎬ对八角的分子
要的香料成分ꎮ 八角芳香油具有独特的甜香和辛 遗传学研究相对较少ꎬ直接影响了八角优良种质
辣风味ꎬ因此在烘烤食品、酒类、饮料、糖果等食品 的筛选进程ꎬ这在一定程度上阻碍了八角产业的
领域中得到广泛应用(Ｈｅ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２４)ꎮ 在中医领 科学化发展ꎮ 以往的研究主要依赖于八角的花
域ꎬ八角因其具有温阳散寒、理气止痛的特性而被 色、叶形和果实外部形态等特征来划分种质资源
广泛用于治疗寒疝腹痛、腰膝冷痛等病症(国家药 类型ꎬ而缺乏遗传学的证据支持( 孙雪阳等ꎬ２０１１ꎻ
典委员会ꎬ２０２０)ꎮ 广西是我国最大的八角原产地 戴晓萧和江立庚ꎬ２０１９)ꎮ 在广西不同地区ꎬ八角
和主产区ꎬ种植面积和产量占比均超过全国总量的 种质资源的遗传背景尚未得到系统性的研究ꎬ各
８５％(Ｌｉａｏ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２３)ꎬ２０２３ 年八角种植产业年产 地居群及人工筛选的优良种质间的遗传变异和群
值达 ４０ 亿元ꎬ作为“桂十味”药材之一ꎬ其发展前景 体结构问题也未被充分阐明ꎮ

备受期待(Ｚｏｕ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２３)ꎮ ＳＬＡＦ￣ｓｅｑ ( ｓｐｅｃｉｆｉｃ ｌｏｃｕｓ ａｍｐｌｉｆｉｅｄ ｆｒａｇｍｅｎｔ
八角的种质资源评价及优良品系筛选是提升 ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ)技术是一种结合了限制性酶切和 ＰＣＲ
其经济价值和药用价值的关键环节ꎮ 广西的种植 扩增步骤的高通量测序方法ꎬ主要用于基因组水平
者们通过嫁接换冠技术对低产八角林进行改良ꎬ 上的单核苷酸多态性( ＳＮＰ) 鉴定和遗传变异分析