Page 104 - 《广西植物》2025年第5期
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9 0 8                                  广  西  植  物                                         45 卷
                                                          续表 2
                                      氨基酸数目       分子量               不稳定
             基因名称                                         理论等电点             脂溶指数                  亚细胞定位
                           基因 ID       Number of  Molecular          系数               总亲水性
               Gene                                        Theoretical      Aliphatic             Subcellular
                           Gene ID    amino acids  weight          Instability        GRAVY
               name                                          pI              index                localization
                                        (aa)      (Da)               index
             AhWRKY41   AHE.Chr21.1023   590     64 371.79   7.03    50.48   66.39     -0.659   细胞核 Nucleus
             AhWRKY42   AHE.Chr21.1388   269     29 160.18   5.08    59.93   62.71     -0.595   细胞核 Nucleus
             AhWRKY43   AHE.Chr21.1618   372     41 610.71   8.69    45.05   65.86     -0.905   细胞核 Nucleus
             AhWRKY44   AHE.Chr21.333    454     49 066.64   7.27    54.77   71.37     -0.516   细胞核 Nucleus
             AhWRKY45   AHE.Chr21.787    497     53 889.26   7.02    55.71   54.43     -0.835   细胞核 Nucleus
             AhWRKY46   AHE.Chr22.1375   329     36 799.00   8.74    44.73   62.37     -0.926   细胞核 Nucleus
             AhWRKY47   AHE.Chr22.1797   596     64 842.12   7.31    49.23   63.24     -0.677   细胞核 Nucleus
             AhWRKY48   AHE.Chr22.2153   265     28 897.02   5.35    64.12   60.00     -0.678   细胞核 Nucleus
             AhWRKY49   AHE.Chr22.527    469     50 975.04   7.29    55.44   70.30     -0.598   细胞核 Nucleus
             AhWRKY50   AHE.Chr22.672    497     53 974.10   7.32    58.85   54.43     -0.855   细胞核 Nucleus
             AhWRKY51   AHE.Chr22.722    559     62 193.78   6.01    59.06   44.11     -0.999   细胞核 Nucleus
             AhWRKY52   AHE.Chr23.1081   355     39 695.57   7.57    42.65   66.48     -0.710   细胞核 Nucleus
             AhWRKY53   AHE.Chr23.1552   287     32 051.41   5.67    63.63   55.05     -0.914   细胞核 Nucleus
             AhWRKY54   AHE.Chr23.1898   535     58 240.71   6.06    49.57   56.19     -0.835   细胞核 Nucleus
             AhWRKY55   AHE.Chr23.196    636     68 411.74   6.53    45.32   63.79     -0.661   细胞核 Nucleus
             AhWRKY56   AHE.Chr23.226    636     68 412.73   6.42    45.53   63.79     -0.661   细胞核 Nucleus
             AhWRKY57   AHE.Chr24.1044   239     26 408.58   9.20    45.17   57.15     -0.814   细胞核 Nucleus
             AhWRKY58   AHE.Chr24.1582   284     31 714.00   5.96    60.99   51.13     -0.893   细胞核 Nucleus
             AhWRKY59   AHE.Chr24.184    632     67 978.79   6.26    46.35   62.63     -0.698   细胞核 Nucleus
             AhWRKY60   AHE.Chr25.124.1  491     55 048.84   9.20    52.37   48.43     -1.085   细胞核 Nucleus
             AhWRKY61   AHE.Chr26.132.1  435     48 647.81   9.37    50.11   47.03     -1.134   细胞核 Nucleus


            化关系进行分析ꎬ并利用 MEGA X 构建系统发育                          特征ꎬ利用 MEME 在线网站分析和 TBtools 可视化
            进化树(图 1)ꎮ 结果显示ꎬ3 个物种中的 WRKY 基                      菠萝蜜 WRKY 基因的保守基序 Motifꎮ 由图 3 可
            因家族成员被分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ亚族ꎬAhWRKY 基                         知ꎬ位于同一亚族的 AhWRKY 基因家族成员基本
            因家族成员在每个亚族中分别有 27 个、9 个、9                          含有 相 同 的 Motifꎬ 如 Ⅰ 亚 族 中 的 AhWRKY16、
            个、22 个成员ꎬ与水稻相比ꎬ菠萝蜜 WRKY 基因家                        AhWRKY20、AhWRKY25、 AhWRKY33、 AhWRKY36 不
            族成员与拟南芥 WRKY 基因家族成员密切相关ꎬ                           含 有 Motif 3、 Motif 6 和 Motif 9ꎬ Ⅱ 亚 族 中 的
            说明其与双子叶植物的亲缘关系更近ꎮ                                  AhWRKY7、 AhWRKY11、 AhWRKY57、 AhWRKY24 含
            2.3 菠萝蜜 WRKY 基因家族染色体定位                             有 Motif 9ꎬ 而 AhWRKY55 和 AhWRKY56 不 含 有
                 通过 TBtools 对菠萝蜜 61 个 WRKY 基因家族                Motif 9ꎬ Ⅲ 亚 族 中 AhWRKY42、 AhWRKY48、
            成员进行 染 色 体 定 位 分 析ꎮ 由 图 2 可 知ꎬ61 个                 AhWRKY53、AhWRKY58 含 有 Motif 5ꎬ 而 AhWRKY6
            WRKY 基因分别定位于 28 条染色体中的 23 条ꎮ                       和 AhWRKY12 含 有 Motif 9ꎬ 说 明 同 一 亚 族 中
            其中ꎬ22 号染色体上有 6 个 AhWRKY 基因ꎬ1 号、3                   AhWRKY 基因的功能可能有差异ꎮ
            号、4 号、9 号、18 号、19 号、25 号和 26 号染色上均                     基因结构分析表明ꎬ菠萝蜜 WRKY 基因家族
            只有 1 个 AhWRKY 基因ꎮ 此外ꎬAhWRKY 基因家族                   成员的内含子为 2 ~ 6 个ꎬ第Ⅰ亚族和第Ⅱ亚族成
            成员在每条染色体上不均匀分布且没有出现小型                              员的 内 含 子 普 遍 为 2 ~ 5 个ꎬ 而 第 Ⅲ 亚 族 中
            的基因簇ꎬ推测各基因之间的功能有差异ꎮ                                AhWRKY 均 只 含 有 2 个 内 含 子ꎬ 这 一 结 果 表 明
            2.4 菠萝蜜 WRKY 基因家族保守基序和基因结构分析                       AhWRKY 基因家族不同成员的功能存在差异ꎮ 此
                 为进一步探究菠萝蜜 WRKY 基因家族的结构                        外ꎬAhWRKY 基因家族所有成员的 CDS 区域被至
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