Page 13 - 《广西植物》2025年第5期
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５ 期 曲荣举等: 高山植物唐古红景天叶绿体基因组特征及系统发育分析 ８ １ ７
表 ５ 唐古红景天叶绿体基因组 ＳＳＲｓ 信息
Ｔａｂｌｅ ５ Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ ｏｆ ＳＳＲｓ ｉｎ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｏｆ Ｒｈｏｄｉｏｌａ ｔａｎｇｕｔｉｃａ
编号 ＳＳＲ 类型 大小 起始 终止 位置
ＳＳＲ
Ｎｏ. ＳＳＲ ｔｙｐｅ Ｓｉｚｅ Ｓｔａｒｔ Ｅｎｄ Ｌｏｃａｔｉｏｎ
１ ｐ１ (Ａ) １０ １０ ３ ３９０ ３ ３９９ ｔｒｎＩ￣ＧＡＵ
２ ｐ１ (Ｔ) １１ １１ ２３ ９６０ ２３ ９７０ ｍａｔＫ
３ ｐ１ (Ａ) １０ １０ ２７ ００１ ２７ ０１０ ＩＧＳ(ｔｒｎＫ￣ＵＵＵꎬ ｒｐｓ１６)
(Ｔ)１０ｇａａａｃｔｇｃｔｔｃａｔｔｔｃｔｔａｇｔａｔｃａａａａｔａｇｔｔａｇａａｔａ
４ ｃ ９６ ２９ ２２２ ２９ ３１７ ＩＧＳ(ｐｓｂＫ－ｐｓｂＩ)
ｔｇｇｇｇｔａｔａａａａａｔｇｇｃｇａａｔｃｔａｔｔｃｔｃｔｔｔｔｔｔａｃ(Ａ) １０
５ ｐ１ (Ｔ) １１ １１ ２９ ９４２ ２９ ９５２ ＩＧＳ(ｔｒｎＳ￣ＧＣＵ－ｔｒｎＧ￣ＵＣＣ)
６ ｐ１ (Ｔ) １１ １１ ３０ ９１７ ３０ ９２７ ｔｒｎＧ￣ＵＣＣ
７ ｐ２ (ＴＡ) ６ １２ ３１ １３２ ３１ １４３ ＩＧＳ(ｔｒｎＧ￣ＧＣＣ－ｔｒｎＲ￣ＵＣＵ)
８ ｐ１ (Ｔ) １２ １２ ３３ ７１８ ３３ ７２９ ａｔｐＦ
９ ｐ１ (Ａ) １３ １３ ３７ ２９４ ３７ ３０６ ＩＧＳ(ｒｐｓ２－ｒｐｏＣ２)
１０ ｐ１ (Ｔ) １１ １１ ３９ ５１２ ３９ ５２２ ｒｐｏＣ２
１１ ｐ１ (Ｔ) １０ １０ ４３ ６１９ ４３ ６２８ ｒｐｏＣ１
１２ ｐ１ (Ｔ) １１ １１ ４８ １７５ ４８ １８５ ＩＧＳ(ｒｐｏＢ－ｔｒｎＣ￣ＧＣＡ)
１３ ｐ１ (Ａ) １１ １１ ４８ ７１８ ４８ ７２８ ＩＧＳ(ｒｐｏＢ－ｔｒｎＣ￣ＧＣＡ)
１４ ｐ１ (Ｔ) １０ １０ ５０ ９５７ ５０ ９６６ ＩＧＳ(ｐｓｂＭ－ｔｒｎＤ￣ＧＵＣ)
１５ ｐ１ (Ｔ) １１ １１ ５３ ８５７ ５３ ８６７ ＩＧＳ(ｔｒｎＴ￣ＧＧＵ－ｐｓｂＤ)
１６ ｐ２ (ＡＴ) ６ １２ ５７ ８８０ ５７ ８９１ ＩＧＳ(ｌｈｂＡ－ｔｒｎＧ￣ＵＣＣ)
１７ ｐ１ (Ａ) １０ １０ ５８ ０７５ ５８ ０８４ ＩＧＳ(ｔｒｎＧ￣ＵＧＧ－ｔｒｎｆＭ￣ＣＡＵ)
１８ ｐ１ (Ｔ) １０ １０ ６８ １５３ ６８ １６２ ｔｒｎＬ￣ＵＡＡ
１９ ｐ１ (Ｔ) １０ １０ ７１ ４３４ ７１ ４４３ ＩＧＳ(ｎｄｈＣ－ｔｒｎＶ￣ＵＡＣ)
２０ ｐ２ (ＴＡ) ６ １２ ７９ ３８３ ７９ ３９４ ＩＧＳ(ａｃｃＤ－ｐｓａｌ)
２１ ｐ１ (Ｔ) １１ １１ ８４ ８７３ ８４ ８８３ ＩＧＳ(ｐｓｂＥ－ｐｅｔＬ)
２２ ｐ１ (Ｔ) １０ １０ ８６ ３２２ ８６ ３３１ ＩＧＳ(ｐｓｂＥ－ｐｅｔＬ)
２３ ｐ１ (Ｔ) １０ １０ ８７ ３４６ ８７ ３５５ ＩＧＳ(ｐｓａＪ－ｒｐｌ３３)
(Ｔ)１０ｇａｇａａｔｃａｔａａｔｃａｔｃｇｇｇｇｇｔｇｔａｇｔａｔｇａａｔｃｔｇａｇｇｔｔｔｔ
２４ ｃ １０１ ９５ ０６４ ９５ １６４ ｐｅｔＢ
ａａｔｔａａｔｔｃａｔａｇｇｇｔｃｔｔａａｃａａｇａｇａａｔｔｃｃｔａｔｃ(Ａ) １１
２５ ｐ１ (Ｔ) １４ １４ １０３ ２７３ １０３ ２８６ ＩＧＳ(ｒｐｓ３－ｒｐｌ２２)
２６ ｐ１ (Ｔ) １０ １０ １２２ ３２３ １２２ ３３２ ｔｒｎＩ￣ＧＡＵ
２７ ｐ１ (Ａ) １０ １０ １３０ ０４１ １３０ ０５０ ｎｄｈＦ
２８ ｐ１ (Ｔ) １８ １８ １３０ ５０７ １３０ ５２４ ｎｄｈＦ
２９ ｐ１ (Ａ) １４ １４ １３４ ３１５ １３４ ３２８ ＩＧＳ(ｃｃｓＡ－ｎｄｈＤ)
３０ ｐ１ (Ｔ) １０ １０ １３９ ３８５ １３９ ３９４ ｎｄｈＡ
３１ ｐ１ (Ａ) １０ １０ １４４ ０２９ １４４ ０３８ ｙｃｆ１
(Ｔ)１４ｇａｔｔｃａａａａｔｃａａａａａａａａｇｔｔｇｔｃｃｃｔｔｇａｔｃｃｔｔａｔｔａｔａｔｔ
３２ ｃ １０２ １４４ ６６０ １４４ ７６１ ｙｃｆ１
ａａｔａａｃｔａｇｇａｃｇａｔａｇｃａａｔｇｔａｔａｔｔｃｔｔｔｃ(Ａ) １１
３３ ｐ１ (Ａ) １１ １１ １４５ ２１９ １４５ ２２９ ｙｃｆ１
３４ ｐ１ (Ｔ) １０ １０ １４５ ３５３ １４５ ３６２ ｙｃｆ１
３５ ｐ１ (Ａ) １１ １１ １４６ ６８２ １４６ ６９２ ｙｃｆ１
值大于 １ 的相对同义密码子共 ２９ 种ꎬ并且具有明 以及核 苷 酸 突 变 和 回 复 突 变 而 引 起 ( Ｄｕ ｅｔ ａｌ.ꎬ
显的 ＡＵ 偏好性(仅 ＵＵＧ 以 Ｇ 结尾ꎬ其他均以Ａ / Ｕ ２０２０ꎻ张雨等ꎬ２０２２)ꎮ 简单重复序列是高等真核
结尾)ꎬ我们推测这可能是因 Ａ、Ｕ 碱基含量较高 生物叶绿体基因组中长度为 １ ~ ６ ｂｐ 的重复序列
