Page 10 - 《广西植物》2025年第5期
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８ １ ４ 广 西 植 物 ４５ 卷
表 ２ 唐古红景天叶绿体基因组注释信息
Ｔａｂｌｅ ２ Ａｎｎｏｔａｔｉｏｎ ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ ｏｆ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｏｆ Ｒｈｏｄｉｏｌａ ｔａｎｇｕｔｉｃａ
基因类别 基因分组 基因名称
Ｇｅｎｅ ｃａｔｅｇｏｒｙ Ｇｅｎｅ ｇｒｏｕｐ Ｇｅｎｅ ｎａｍｅ
光合作用基因 光系统 Ｉ ｐｓａＡꎬ ｐｓａＢꎬ ｐｓａＣꎬ ｐｓａＪꎬ ｐｓａＩ
Ｇｅｎｅｓ ｆｏｒ ｐｈｏｔｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ Ｐｈｏｔｏｓｙｓｔｅｍ Ｉ
光系统Ⅱ ｐｓｂＡꎬ ｐｓｂＢꎬ ｐｓｂＣꎬ ｐｓｂＤꎬ ｐｓｂＥꎬ ｐｓｂＦꎬ ｐｓｂＨꎬ ｐｓｂＩꎬ ｐｓｂＪꎬ ｐｓｂＫꎬ ｐｓｂＬꎬ
Ｐｈｏｔｏｓｙｓｔｅｍ Ⅱ ｐｓｂＭꎬ ｐｓｂＴꎬ ｐｂｆ１ꎬ ｌｈｂＡ
细胞色素 ｂ / ｆ 复合体
ａ
ａ
ｐｅｔＡꎬ ｐｅｔＢ ꎬ ｐｅｔＤ ꎬ ｐｅｔＧꎬ ｐｅｔＬꎬ ｐｅｔＮ
Ｃｙｔｏｃｈｒｏｍｅ ｂ / ｆ ｃｏｍｐｌｅｘ
ＡＴＰ 合成酶 ａ
ＡＴＰ ｓｙｎｔｈａｓｅ ａｔｐＡꎬ ａｔｐＢꎬ ａｔｐＥꎬ ａｔｐＦ ꎬ ａｔｐＨꎬ ａｔｐＩ
ＮＡＤＨ 脱氢酶 ｎｄｈＡ ꎬ ｎｄｈＢ ａ∗ ꎬ ｎｄｈＣꎬ ｎｄｈＤꎬ ｎｄｈＥꎬ ｎｄｈＦꎬ ｎｄｈＧꎬ ｎｄｈＨꎬ ｎｄｈＩꎬ
ａ
ＮＡＤＨ ｄｅｈｙｄｒｏｇｅｎａｓｅ ｎｄｈＪꎬ ｎｄｈＫ
二磷酸核酮糖羧化酶大亚基
ｒｂｃＬ
ＲｕｂｉｓＣＯ ｌａｒｇｅ ｓｕｂｕｎｉｔ
自我复制基因 ＤＮＡ 依赖性 ＲＮＡ 聚合酶
ａ
ｒｐｏＡꎬ ｒｐｏＢꎬ ｒｐｏＣ１ ꎬ ｒｐｏＣ２
Ｇｅｎｅｓ ｏｆ ｓｅｌｆ￣ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎ ＤＮＡ ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ ＲＮＡ ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ
核糖体蛋白小亚基 ｒｐｓ２ꎬ ｒｐｓ３ꎬ ｒｐｓ４ꎬ ｒｐｓ７ꎬ ｒｐｓ１１ꎬ ｒｐｓ１２ ꎬ ｒｐｓ１４ꎬ ｒｐｓ１５ꎬ ｒｐｓ１６ꎬ
ｂ＃
Ｓｍａｌｌ ｓｕｂｕｎｉｔ ｏｆ ｒｉｂｏｓｏｍａｌ ｐｒｏｔｅｉｎ ｒｐｓ１８ꎬ ｒｐｓ１９
核糖体蛋白大亚基
ａ∗
ｒｐｌ２ ꎬ ｒｐｌ１４ꎬ ｒｐｌ１６ꎬ ｒｐｌ１９ꎬ ｒｐｌ２０ꎬ ｒｐｌ２２ꎬ ｒｐｌ２３ꎬ ｒｐｌ３２ꎬ ｒｐｌ３３ꎬ ｒｐｌ３６
Ｌａｒｇｅ ｓｕｂｕｎｉｔ ｏｆ ｒｉｂｏｓｏｍａｌ ｐｒｏｔｅｉｎ
ａ∗
ｔｒｎＡ￣ＵＧＣ ꎬ ｔｒｎＣ￣ＧＣＡꎬ ｔｒｎＤ￣ＧＵＣꎬ ｔｒｎＥ￣ＵＵＣꎬ ｔｒｎＦ￣ＧＡＡꎬ ｔｒｎｆＭ￣ＣＡＵꎬ
ａ
ａ∗
ｔｒｎＧ￣ＵＣＣ ꎬ ｔｒｎＧ￣ＧＣＣꎬ ｔｒｎＨ￣ＧＵＧꎬ ｔｒｎＩ￣ＧＡＵ ꎬ ｔｒｎＩ￣ＣＡＵꎬ ｔｒｎＫ￣
ａ
ａ
转运 ＲＮＡ ＵＵＵ ꎬ ｔｒｎＬ￣ＵＡＧꎬ ｔｒｎＬ￣ＣＡＡꎬ ｔｒｎＬ￣ＵＡＡ ꎬ ｔｒｎＭ￣ＣＡＵꎬ ｔｒｎＮ￣ＧＵＵꎬ ｔｒｎＰ￣
Ｔｒａｎｓｆｅｒ ＲＮＡ ＵＧＧꎬ ｔｒｎＱ￣ＵＵＧꎬ ｔｒｎＲ￣ＵＣＵꎬ ｔｒｎＲ￣ＡＣＧꎬ ｔｒｎＳ￣ＵＧＡꎬ ｔｒｎＳ￣ＧＣＵꎬ ｔｒｎＳ￣
ａ
ＧＧＡꎬ ｔｒｎＴ￣ＵＧＵꎬ ｔｒｎＴ￣ＧＧＵꎬ ｔｒｎＶ￣ＧＡＣꎬ ｔｒｎＶ￣ＵＡＣ ꎬ ｔｒｎＷ￣ＣＣＡꎬ
ｔｒｎＹ￣ＧＵＡ
核糖体 ＲＮＡ
ｒｒｎ４.５ꎬ ｒｒｎ５ꎬ ｒｒｎ１６ꎬ ｒｒｎ２３
Ｒｉｂｏｓｏｍａｌ ＲＮＡ
翻译起始因子
ｉｎｆＡ
Ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎ ｉｎｉｔｉａｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒ
其他基因 成熟酶 ｍａｔＫ
Ｏｔｈｅｒ ｇｅｎｅｓ Ｍａｔｕｒａｓｅ
包膜蛋白
ｃｅｍＡ
Ｅｎｖｅｌｏｐ ｐｒｏｔｅｉｎ
ｃ 型细胞色素合成基因
ｃｃｓＡ
Ｃ￣ｔｙｐｅ ｃｙｔｏｃｈｒｏｍｅ ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ ｇｅｎｅ
乙酰辅酶 Ａ 羧化酶亚基
ａｃｃＤ
Ｓｕｂｍｉｔ ｏｆ ａｃｅｔｙｌ￣ＣｏＡ￣ｃａｒｂｏｘｙｌａｓｅ
ＡＴＰ 依赖的蛋白酶亚基 Ｐ
ｃｌｐＰ１ ｂ
ＡＴＰ￣ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ ｐｒｏｔｅａｓｅ ｓｕｂｕｎｉｔ Ｐ
未知功能基因 假定叶绿体阅读框
ｙｃｆ１ꎬ ｙｃｆ２
Ｇｅｎｅｓ ｏｆ ｕｎｋｎｏｗｎ ｆｕｎｃｔｉｏｎ Ｈｙｐｏｔｈｅｔｉｃａｌ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｒｅａｄｉｎｇ ｆｒａｍｅｓ
ａ ｂ ∗ ＃
注: 表示蛋白编码基因含有 １ 个内含子ꎻ 表示蛋白编码基因含有 ２ 个内含子ꎻ 表示含有 ２ 个拷贝基因ꎻ 表示含有 ３ 个拷贝
基因ꎮ
ａ ｂ ∗
Ｎｏｔｅ: ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ｔｈｅ ｉｎ ｐｒｏｔｅｉｎ￣ｃｏｄｉｎｇ ｇｅｎｅｓ ｗｉｔｈ ｏｎｅ ｉｎｔｒｏｎꎻ ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ｔｈｅ ｐｒｏｔｅｉｎ￣ｃｏｄｉｎｇ ｇｅｎｅｓ ｗｉｔｈ ｔｗｏ ｉｎｔｒｏｎｓꎻ ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ｔｗｏ ｃｏｐｉｅｓ ｏｆ
＃
ｇｅｎｅｓꎻ ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ｔｈｒｅｅ ｃｏｐｉｅｓ ｏｆ ｇｅｎｅｓ.
表明ꎬ红景天属所有参试物种均不存在基因缺失ꎬ 值可以表明基因受到何种选择作用ꎬＫａ / Ｋｓ 大于 １
基因分布位置、数量、类型及扩张与收缩情况大致 表明受到正选择效应ꎬ小于 １ 则表明受到纯化选
相同ꎬ基因组结构相对保守ꎬ变异率较低ꎮ 择作用ꎮ Ｋａ / Ｋｓ>０ 的基因如图 ４ 所示ꎬ不同蛋白
非同义突变率 (Ｋａ)和同义突变率 (Ｋｓ) 的比 编码基因的核苷酸替代速率不同ꎮ Ｋａ / Ｋｓ>１ 的基
