Page 15 - 《广西植物》2025年第5期
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5 期               曲荣举等: 高山植物唐古红景天叶绿体基因组特征及系统发育分析                                            8 1 9





































                              图 5  基于红景天属 24 个物种叶绿体基因组序列构建的系统发育树
                         Fig. 5  Phylogenetic tree constructed based on chloroplast genomes of 24 Rhodiola species


            IR、LSC 和 SSC 区的扩张和收缩造成ꎮ 本研究通                       2011)ꎮ 红景天属植物是中国西北地区的一种传
            过比较红景天属 7 个物种叶绿体基因组边界区的                            统中藏药ꎬ种间和种内形态变异复杂ꎬ系统位置和
            收缩和扩展ꎬ发现 JLB 边界均位于 rps19 基因区                       亲缘关系存在争议ꎬ物种界定及系统发育研究困
            间ꎻ除长鞭红景天、大花红景天和圣地红景天的                              难较大( 贺美艳和张小龙ꎬ2012)ꎮ 为澄清红景天
            ycf1 向 IRB 收缩而偏离 JSB 边界以外ꎬ其他物种的                    属部分物种的系统位置和亲缘关系ꎬ构建合理的

            IRB / SSC 边界均位于 ycf1 和 ndhF 的重叠区ꎻJSA               系统发育关系ꎬ本研究通过叶绿体基因组序列分
            和 JLA 边界的基因种类、长度和位置等基本相似ꎬ                          析红景天属 24 个物种的系统发育关系ꎬ结果发现
            尤其与亲缘关系最近的四裂红景天更是如此ꎬ并                              红景天属所有参试物种构成一个靴带支持率高达
            且两者在基因大小、跨区及分布位置等方面呈现                              100%的单系类群ꎬ其被明显划分为两大分支ꎬ唐
            高度一致性ꎮ 因此ꎬ本研究认为红景天属物种的                             古红景天与四裂红景天互为姊妹群ꎬ两者具有较

            叶绿体基因组结构高度保守ꎬJLB、JSB、JSA 和 JLA                     近的亲缘关系ꎮ 本研究获得的红景天属系统发育
            的边界变化可能是 IR 区扩张与收缩的主要原因ꎮ                           树的拓扑结构与 Yu 等(2023) 利用叶绿体基因组
            为进一步分析各物种之间的进化程度ꎬ将唐古红                              序列 和 Zhang 等 ( 2014) 基 于 5 个 DNA 条 形 码
            景天与其近缘物种的蛋白编码基因进行 Ka / Ks 分                        (rbcL、matK、trnH ̄psbA、trnL ̄F 和内部转录间隔区)
            析ꎬKa / Ks 通常用于评估蛋白编码基因的分化速                         构建的红景天属系统发育关系基本一致ꎬ因此本
            度ꎮ Ka / Ks 表明基因受到正向选择作用( >1)、中                     研究基于叶绿体基因组序列构建的系统发育树较
            性选择作用(接近 1)或纯化选择作用( <1)ꎮ 本研                        为准确可靠ꎮ 此外ꎬ胡挺松等( 2004) 利用 RAPD
            究中ꎬ唐古红景天的 psaB 基因受到强烈的正选择                          分子标记探讨了红景天属物种的亲缘关系ꎬ发现
            作用ꎬaccD 基因在不同物种间显示出显著性差异ꎮ                          大花红景天与长鞭红景天聚为一支ꎬ亲缘关系较
                 目前ꎬ叶绿体基因组序列已被广泛应用于植                           近ꎻ倪念春和王卫华(2004) 采用 UPGMA 聚类分
            物系统进化和亲缘关系鉴定的研究( Nock et al.ꎬ                      析同样认为大花红景天与长鞭红景天亲缘关系较
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