Page 133 - 《广西植物》2026年第1期

１ 期 胡国瑾等: 水母雪兔子 ＧＰＡＴ 家族全基因组鉴定及表达分析 １ ２ ９

图 １ ＳｍＧＰＡＴ 基因家族的染色体定位分析
Ｆｉｇ. １ Ｃｈｒｏｍｏｓｏｍａｌ ｌｏｃａｌｉｚａｔｉｏｎ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ＳｍＧＰＡＴ ｇｅｎｅ ｆａｍｉｌｙ

表 ３ ＳｍＧＰＡＴ 蛋白质二级结构预测 ２.７ 水母雪兔子 ＧＰＡＴ 基因家族的组织表达分析
Ｔａｂｌｅ ３ Ｓｅｃｏｎｄａｒｙ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ｐｒｅｄｉｃｔｉｏｎ 基于 ＳｍＧＰＡＴ 基 因 家 族 成 员 ４ 个 组 织 ( 根、
ｏｆ ＳｍＧＰＡＴ ｐｒｏｔｅｉｎｓ 茎、叶、花)ＦＰＫＭ 标准化表达量ꎬ构建组织特异性
蛋白质二级结构 表达热图ꎬ如图 ６ 所示ꎬ水母雪兔子 ＳｍＧＰＡＴ 基因
Ｐｒｏｔｅｉｎ ｓｅｃｏｎｄａｒｙ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ
在茎中表达量较低ꎬ在根中只有 ＳｍＧＰＡＴ１４ 的表
蛋白质 ＩＤ 达量较高ꎬ推测其在根的生长发育过程中发挥重
α￣螺旋 延长链 无规则卷曲
Ｐｒｏｔｅｉｎ ＩＤ
Ａｌｐｈａ Ｅｘｔｅｎｄｅｄ Ｒａｎｄｏｍ
要 作 用ꎬ 而 ＳｍＧＰＡＴ２、 ＳｍＧＰＡＴ５、 ＳｍＧＰＡＴ７、
ｈｅｌｉｘ ｓｔｒａｎｄ ｃｏｉｌ
ＳｍＧＰＡＴ１１ 在叶中表达量比根、茎、花高ꎬ推测其在
(％) (％) (％)
叶的生长发育过程中发挥重要作用ꎬ而其余 １０ 个
ＳｍＧＰＡＴ１ ３９.０２ １３.９７ ４７.０１
ＳｍＧＰＡＴ 基 因 ( ＳｍＧＰＡＴ１、 ＳｍＧＰＡＴ３、 ＳｍＧＰＡＴ４、
ＳｍＧＰＡＴ２ ３１.９３ １７.３７ ５０.７０
ＳｍＧＰＡＴ６、 ＳｍＧＰＡＴ８、 ＳｍＧＰＡＴ９、 ＳｍＧＰＡＴ１０、
ＳｍＧＰＡＴ３ ３１.０６ １２.８８ ５６.０６
ＳｍＧＰＡＴ１２、ＳｍＧＰＡＴ１３、ＳｍＧＰＡＴ１５) 在花中的组织
ＳｍＧＰＡＴ４ ４３.８０ １４.８０ ４１.４０
表达量比在根、茎、叶高ꎬ推测其在花的生长发育
ＳｍＧＰＡＴ５ ４２.６３ ８.５３ ４８.８４
过程中发挥了重要作用ꎮ
ＳｍＧＰＡＴ６ ３８.４９ １５.０８ ４６.４３
２.８ 水母雪兔子 ＧＰＡＴ 基因 ｑＲＴ￣ＰＣＲ 验证分析
ＳｍＧＰＡＴ７ ４０.００ １１.３３ ４８.６７ 从水母雪兔子 ＳｍＧＰＡＴ 基因家族成员中随机
ＳｍＧＰＡＴ８ ３１.０４ １２.４７ ５６.４９ 挑选 ９ 个 基 因 ( ＳｍＧＰＡＴ１、 ＳｍＧＰＡＴ２、 ＳｍＧＰＡＴ３、
ＳｍＧＰＡＴ９ ３９.９３ ９.０１ ５１.０６ ＳｍＧＰＡＴ６、 ＳｍＧＰＡＴ７、 ＳｍＧＰＡＴ８、 ＳｍＧＰＡＴ９、
ＳｍＧＰＡＴ１３ 和 ＳｍＧＰＡＴ１４)ꎬ通过 ｑＲＴ￣ＰＣＲ 技术验
ＳｍＧＰＡＴ１０ ３８.１４ １２.８５ ４９.０１
证这 ９ 个基因在不同组织中的差异表达变化ꎮ 结
ＳｍＧＰＡＴ１１ ３６.６６ １６.１２ ４７.２２
果 如 图 ７ 所 示ꎬ 这 ９ 个 基 因 中 有 ７ 个 基 因
ＳｍＧＰＡＴ１２ ４０.５２ １４.５０ ４４.９８
( ＳｍＧＰＡＴ１、 ＳｍＧＰＡＴ２、 ＳｍＧＰＡＴ３、 ＳｍＧＰＡＴ６、
ＳｍＧＰＡＴ１３ ３７.７５ １３.２５ ４９.００
ＳｍＧＰＡＴ８、ＳｍＧＰＡＴ９ 和 ＳｍＧＰＡＴ１３) 在花中的相对
ＳｍＧＰＡＴ１４ ４７.４４ １１.３２ ４１.２４
表达量较高ꎬ与转录组组织表达结果相一致ꎮ 然
而ꎬＳｍＧＰＡＴ７ 在叶中的相对表达量最高ꎬ同样与转
ＳｍＧＰＡＴ１５ ５１.５７ ８.８６ ３９.５７