Page 195 - 《广西植物》2026年第1期
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1 期 代英超等: 不同生长年限短萼黄连根内及根际微生物群落多样性研究 1 9 1
表 1 根内和根际微生物多样性指数
Table 1 Diversity indices of microbial communities in roots and rhizosphere soils
细菌 Bacteria 真菌 Fungi
指数
Index
Root1 Root2 Root3 RS1 RS2 RS3 Root1 Root2 Root3 RS1 RS2 RS3
Ace 1 842 ± 2 012 ± 1 842 ± 5 999 ± 5 876 ± 5 736 ± 322 ± 177 ± 246 ± 505 ± 1 034 ± 1 152 ±
206a 167a 257a 386a 283a 385a 70a 165a 164a 172b 158a 287a
Chao 1 1 787 ± 1 960 ± 1 801 ± 5 859 ± 5 697 ± 5 612 ± 322 ± 177 ± 245 ± 508 ± 1 040 ± 1 161 ±
189a 153a 254a 368a 311a 357a 69a 165a 163a 174b 162a 293a
Shannon 5.14 ± 5.27 ± 4.73 ± 7.07 ± 6.96 ± 6.94 ± 4.05 ± 2.04 ± 3.66 ± 4.44 ± 4.79 ± 5.04 ±
0.26a 0.19a 0.39b 0.04a 0.06b 0.11b 0.40a 1.52b 0.38a 0.19a 0.81a 0.37a
Simpson 0.022 ± 0.023 ± 0.044 ± 0.003 ± 0.003 ± 0.004 ± 0.05 ± 0.44 ± 0.06 ± 0.05 ± 0.06 ± 0.03 ±
0.01b 0.01b 0.02a 0.00b 0.00ab 0.00a 0.02a 0.37b 0.03a 0.02a 0.09a 0.02a
注: Root1、Root2、Root3 分别对应一年生、两年生和多年生的根样本ꎻRS1、RS2、RS3 分别对应一年生、两年生和多年生的根际土壤
样本ꎮ 数值后的不同字母表示组内不同年限样本间差异显著(P<0.05)ꎮ
Note: Root1ꎬ Root2ꎬ Root3 correspond to 1 ̄year ̄oldꎬ 2 ̄year ̄oldꎬ and perennial root samplesꎬ respectivelyꎻ RS1ꎬ RS2ꎬ RS3 correspond
to 1 ̄year ̄oldꎬ 2 ̄year ̄oldꎬ and perennial soil samplesꎬ respectively. Different letters after values indicate significant differences among samples
of different years within the group (P<0.05).
在属水平上ꎬRoot1、Root2 和 Root3 中共有细 中各有 8 个、6 个、11 个 差 异 显 著 菌 属ꎬ 其 中 在
菌 493 个ꎬ独有细菌分别有 70 个、73 个和 42 个 Root1 中显著富集的 Top 3 菌属是游动放线菌属
(图 3:C)ꎮ 进一步分析细菌群落组成结构ꎬ发现 (Actinoplanes)、假诺卡氏菌属、链霉菌属ꎬ在 Root2
根样本中主要以慢生根瘤菌属( Bradyrhizobium)、 中是生丝微菌属、norank_f_SC ̄I ̄84、鞘氨醇单胞菌
根 瘤 菌 属 菌 群 ( Allorhizobium ̄Neorhizobium ̄ 属( Sphingomonas)ꎬ在 Root3 中是慢生根瘤菌属、
Pararhizobium ̄Rhizobium ) 和 生 丝 微 菌 属 Steroidobacter、 Tardiphaga ( 图 4: B )ꎮ RS1、 RS2、
(Hyphomicrobium)等组成(图 3:G)ꎮ 其中ꎬ慢生根 RS3 中分别有 3 个、2 个、2 个显著差异菌属ꎬRS1
瘤菌 属、 根 瘤 菌 属 菌 群、 Steroidobacter、 贪 噬 菌 属 中最富集菌属为 MND1、鞘脂单胞菌属、unclassified
(Variovorax)的相对丰度随着短萼黄连生长年限的 _f_ComamonadaceaeꎬRS2 中为 norank_f_norank_o_
增 加 而 增 加ꎮ 值 得 注 意 的 是ꎬ 假 诺 卡 氏 菌 属 norank _ c _ bacteriap25 和 norank _ f _
( Pseudonocardia )、 链 霉 菌 属 ( Streptomyces )、 Nitrososphaeraceaeꎬ RS3 中 为 慢 生 根 瘤 菌 属 和
Galbitalea、细杆菌属(Microbacterium) 等在 Root1 中 Candidatus_Xiphinematobacter(图 4:D)ꎮ
相对丰度较高ꎬ但是在 Root2、Root3 中丰度极低ꎮ 2.5 不同年限短萼黄连根内和根际真菌群落特征
在根际土壤中ꎬ共有 772 个细菌属ꎬRS1、RS2、RS3 分析
分别有 200 个、51 个、38 个独有细菌属( 图 3:D)ꎮ 2.5.1 真菌群落结构分析 从短萼黄连根组织样
共有细菌属中相对丰度较大的依次为 norank_f_ 本中共获得 1 675 个真菌 OTUsꎬ分布在 12 门 49
norank _ o _ Vicinamibacterales、 norank _ f _ 个纲 126 个目 268 个科 483 个属 619 个种ꎻ根际土
Xanthobacteraceae 和 慢 生 根 瘤 菌 属 ( 图 3: H )ꎮ 壤样本中获得 4 214 个 OTUsꎬ分布在 14 门 67 个
norank _ f _ Nitrososphaeraceae、 norank _ f _ 纲 167 个目 420 个科 908 个属 1 378 个种ꎮ OTUs
Vicinamibacteraceae、norank_f_norank_o_norank_c_ 韦恩图显示ꎬRoot1、Root2 和 Root3 中共有 172 个
bacteriap25、芽孢杆菌属( Bacillus) 在 Root2、Root3 真菌 OTUsꎬ独有真菌 OTUs 分别为 565 个、239 个、
中相对丰度高ꎻ而 norank_f_norank_o_Gaiellales 在 372 个(图 5:A)ꎮ 根际土壤样本中共有真菌 OTUs
Root1 中相对丰度较高ꎮ 数量为 624 个ꎬ分别占各生长年限总数的 40.52%、
2.4.2 细菌群落标志物种分析 通过对短萼黄连 26.11%和 23.22%ꎮ 随着生长年限的增加ꎬ根际土
根内和 根 际 土 壤 细 菌 测 序 结 果 进 行 LEfSe 分 析 壤中特有真菌 OTUs 数量呈上升趋势ꎬRS3 中独有
(LDA 阈值 >3.5)ꎬ分别获得了 25 个和 7 个差异 的真菌 OTUs 最多ꎬ为 1 024 个(图 5:B)ꎮ
显著 的 细 菌 属 ( 图 4:A、C)ꎮ Root1、 Root2、 Root3 为进一步阐明不同生长年限短萼黄连根组织

