Page 108 - 《广西植物》2026年第2期
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3 0 2 广 西 植 物 46 卷
用 GetOrganelle v 1.7.7.1( Jin et al.ꎬ 2020) 软件 de 为 139 157 bpꎬ二者长度相差 370 bpꎬGC 含量稳定
novo 组装质体基因组和nrDNAꎬ无法自动成环的个 在 38.9%ꎬ表明竹类植物在质体基因组结构上的
体使用 Geneious 进行拼接( Kearse et al.ꎬ 2012)ꎮ 高度一致性ꎮ nrDNA 长度范围为 8 226 ~ 10 591
组装结果使用 Bandage( Wick et al.ꎬ 2015) 查看ꎬ bpꎬ其 中 流 苏 梨 藤 竹 ( ZC038 ) 和 高 肩 梨 藤 竹
再使用 Cpstools v 2.5 软件调整叶绿体结构( Huang (JC001)个体的 nrDNA 长度最长ꎬ为 10 591 bpꎬ最
et al.ꎬ 2024 )ꎬ 随 后 使 用 叶 绿 体 注 释 网 站 短的是高肩梨藤竹( JP021、12153)ꎬ为 8 226 bpꎬ
CPGAVAS 2 ( Shi et al.ꎬ 2019 ) 进 行 注 释ꎬ 用 最长和最短的长度相差 2 365 bpꎬGC 含量变化范
Cpstools v 2. 5 软 件 校 正 注 释 结 果 ( Huang et al.ꎬ 围为 61.1% ~ 62.6%(附表 1)ꎮ
2024)ꎬ 使 用 Geneious 对 nrDNA 进 行 批 量 注 释 2.2 矩阵数据特征
( Kearse et al.ꎬ 2012 )ꎮ 使 用 MAFFT v 7. 520 比对后获得质体基因组和 nrDNA 矩阵ꎬ通过
(Katoh & Standleyꎬ 2013)软件对 fasta 文件进行比 计算统计发现ꎬ质体基因组的长度为 141 393 bpꎬ
对ꎮ 将注 释 后 的 质 体 基 因 组 和 nrDNA 提 交 至 包 括 391 个 变 异 位 点ꎬ 占 总 序 列 比 对 长 度 的
NCBI 数据库ꎬ获得登录号ꎮ 0.28%ꎬ320 个 简 约 信 息 位 点ꎬ 占 总 对 比 序 列 的
1.3 系统发育树构建 0.23%ꎮ nrDNA 的长度为 7 057 bpꎬ具有 286 个变
使用 IQ ̄TREE v.1.6.12 软件建立最大似然树 异位点ꎬ占总对比序列的 4. 05%ꎬ简约信 息 位 点
(Minh et al.ꎬ 2020)ꎬ 利 用 IQ ̄TREE 软 件 自 带 的 218 个ꎬ占总对比序列的 3.09%ꎮ
ModelFinder 模块筛选出建树最佳模型为 K3Pu + 2.3 系统发育树分析
F+ Iꎬ 该 模 型 基 于 贝 叶 斯 信 息 准 则 ( Bayesian 基于最大似然法和贝叶斯法构建梨藤竹属质
information criterionꎬ BIC)ꎬ设置自展值( bootstrap) 体基因组系统发育树ꎬ结果( 图 1) 表明ꎬ梨藤竹属
为 1 000 次ꎮ 构建贝叶斯树ꎬ首先使用 MrModeltest 构成 1 个单系群ꎬ并得到较高支持率ꎮ 图 1 中加粗
v. 2. 4 ( https: / / github. com / nylander / MrModeltest2 / 标注 的 流 苏 梨 藤 竹 个 体 ( ZC033、 ZC034、 ZC037、
releases)软件选择最佳替代模型(GTR+I+G)ꎬ然后 ZC038)采自模式标本产地附近( 澜沧拉祜族自治
使 用 MrBayes ( https:/ / github. com/ NBISweden/ 县糯福—孟连)ꎬ采自德宏傣族景颇族州的流苏梨
MrBayes)软件运行 1 000 000 代ꎬ构建贝叶斯系统发 藤竹个体与上述个体聚为 1 支并得到较高支持
育树ꎬ最后在 FigTree v 1. 4. 4 ( https:/ / github. com/ (BI / ML = 1.00 / 100)ꎮ 流苏梨藤竹与大吊竹为
PP BS
rambaut/ figtree/ releases)软件中查看结果并美化系统 姐妹类群( BI / ML = 1.00 / 100)ꎬ其中加粗标注
PP BS
发育树ꎮ 的个体(JC046-JC048)采自模式产地江城ꎬ其他个
1.4 形态补充描述 体采自景洪市勐养镇ꎻ高肩梨藤竹则作为上述 2
基于查阅标本、拍摄照片ꎬ采用形态观察法对 个物 种 的 共 同 姐 妹 类 群 得 到 较 高 支 持 ( BI /
PP
上述标本鉴定ꎬ 同时ꎬ 借助莱卡荧光体视显微镜 ML = 1.00 / 100)ꎬ澜沧梨藤竹则位于梨藤竹属最
BS
(M165FC)解剖观察大吊竹繁殖器官ꎮ 将观察结果 基部ꎮ 另外ꎬ大吊竹 Liujx16005(红色) 单独聚为 1
用中文补充描述ꎬ并同原始文献记载内容作比较ꎬ 支ꎬ并未与其他大吊竹个体聚在一起ꎮ 采自文山
完整描述 2 个竹种的形态特征ꎬ并提供彩色照片ꎮ 的流苏梨藤竹 Xuzc2023041 和 YXY149( 蓝色) 单
独聚为 1 支ꎬ与采自德宏傣族景颇族州和普洱市
2 结果与分析 的流苏梨藤竹相距较远ꎮ
基于最大似然法和贝叶 斯 法 构 建 梨 藤 竹 属
2.1 质体基因组和 nrDNA 的特征 nrDNA 系统发育树ꎬ结果( 图 2) 显示ꎬ梨藤竹属与
梨藤竹属新测序物种为典型的四分体结构ꎬ 外类群明显区分开来ꎬ大吊竹、流苏梨藤竹、高肩
由大单拷贝区(LSC)ꎬ小单拷贝区(SSC) 和 2 个反 梨藤竹和澜沧梨藤竹分别聚为单系分支ꎬ并得到
向重复区(IR) 构成ꎬ序列之间共线性良好ꎮ 质体 较高支持率ꎮ 图 2 中加粗标注的流苏梨藤竹个体
基因组长度为 139 157 ~ 139 527 bpꎬ其中流苏梨藤 (ZC033、ZC034、ZC037、ZC038) 采 自 模 式 产 地 附
竹(JC001) 的 质 体 基 因 组 长 度 最 长ꎬ 为 139 527 近(澜沧拉祜族自治县糯福—孟连)ꎬ采自德宏傣
bpꎬ具有最短长度的个体是澜沧梨藤竹(12150)ꎬ 族景颇族州和文山州流苏梨藤竹个体与模式产地

