Page 54 - 《广西植物》2026年第2期
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                                       图 1  乌蒙山国家级自然保护区地理位置示意图
                       Fig. 1  Geographical location schematic diagram of Wumeng Mountain National Nature Reserve


            丰富度指数( D        ) 定量描述本研究区域兰科植物                    extended.tre” 作 为 背 景 系 统 发 育 树ꎬ 以 “ phylo.
                          MG
            的多样性特征ꎮ 计算公式如下:                                    maker”作为生成系统发育树的核心函数ꎮ 在剔除
                 RA(%)= 某一物种株( 丛) 数 / 所有物种的株                   未鉴定到种的数据后ꎬ整理形成了乌蒙山保护区
            (丛)数总和×100ꎻ                                        30 种兰科植物的物种名称列表ꎮ 将乌蒙山保护区
                 RF(%)= 某一物种的频度 / 所有物种的频度                      兰科植物物种名称绑定到背景系统发育树上ꎬ以
            总和×100ꎻ                                            此生成该区域兰科植物的系统发育树ꎮ 在此基础
                 H′ = - ∑ P lnP ꎬ P = n / N ( Shannon &        上ꎬ借助 “ggtree”包将生成的系统发育树进行可视
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            Weaverꎬ1949)ꎻ                                      化绘制ꎮ 最后检查树的拓扑结构是否合理ꎬ根据
                          2
                 λ = ∑ P ꎬ P  i  2  = n ( n - 1 ) / N ( N - 1 )  需要进行优化和调整ꎬ以获得准确可靠的系统发
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                                    i
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            (Greenbergꎬ1959)ꎻ                                  育树ꎮ
                 D  = (S – 1) / lnN(Margalefꎬ1958)ꎮ
                  MG
                 式中: P 表示第 i 个物种在总个体中的比例ꎻ                      2  结果与分析
                        i
            S 表示物种的丰富度ꎬ以物种的数目表示ꎻN 表示
            所有物种的个体数之和ꎻn 为第 i 个物种的个体                           2.1 兰科植物物种组成
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            数量ꎮ                                                    乌蒙山保护区内共记录到兰科植物 22 属 33
                 利用开源软件 R 中 V.PhyloMaker 包绘制乌蒙                 种(表 1)ꎬ其中以玉凤花属( Habenariaꎬ4 种)、舌
            山保护区内兰科植物的系统发育树( Jin & Qianꎬ                       唇兰属( Platantheraꎬ4 种)、虾脊兰属( Calantheꎬ3
            2019)ꎮ V.PhyloMaker 是一个专门用于生成维管                    种)为主ꎮ 物种水平上ꎬ相对多度( RA) 分析显示ꎬ
            植 物 系 统 发 育 树 的 R 包ꎬ 其 以 “ GBOTB.                  光萼斑叶兰(Goodyera henryi)占据显著优势(RA =
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