Page 183 - 《广西植物》2026年第3期

３ 期 王飞等: 花椒主要栽培种叶绿体基因组比较及密码子使用偏好分析 ５ ５ ９

表 ４ 竹叶花椒叶绿体编码基因变异情况统计
Ｔａｂｌｅ ４ Ｓｔａｔｉｓｔｉｃｓ ｏｆ Ｚａｎｔｈｏｘｙｌｕｍ ａｒｍａｔｕｍ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｃｏｄｉｎｇ ｇｅｎｅ ｖａｒｉａｔｉｏｎ

转换 Ｔｓ 颠换 Ｔｖ 转换 Ｔｓ 颠换 Ｔｖ
基因 插入 缺失 基因 插入 缺失
Ｇｅｎｅ Ｉｎｓ Ｄｅｌ Ｇｅｎｅ Ｉｎｓ Ｄｅｌ
Ｃ⇌Ｔ Ａ⇌Ｇ Ａ⇌Ｔ Ｇ⇌Ｃ Ａ⇌Ｃ Ｇ⇌Ｔ Ｃ⇌Ｔ Ａ⇌Ｇ Ａ⇌Ｔ Ｇ⇌Ｃ Ａ⇌Ｃ Ｇ⇌Ｔ
ｐｓｂＡ １ — — — １ — — — ｐｅｔＡ １ — — １ — — — —
ｍａｔＫ ２ １ ２ — １ １ — — ｒｐｓ１８ １ — — — — — — —
ｒｐｓ１６ — １ １ １ ３ ４ １ ２ ｒｐｌ２０ １ — — — — — — —
ｐｓｂＫ — — — — — １ — — ｃｌｐＰ — — — — — １ — １
ａｔｐＡ ５ １ — — — — — — ｐｓｂＢ １ — — — — — — —
ａｔｐＦ — — — １ — — １ １ ｐｓｂＮ — — — — — １ — —
ｒｐｓ２ — １ — — — — — — ｐｅｔＢ — — — — — １ — １
ｒｐｏＣ２ — １ — — — — — — ｐｅｔＤ １ — — — １ ２ — —
ｒｐｏＣ１ １ １ — — ２ ２ １ １ ｒｐｌ３６ — — — — — １ — —
ｒｐｏＢ — — ２ — １ １ — — ｒｐｌ１６ — — １ — １ — １ —
ｐｓｂＭ — １ — — — １ — — ｒｐｓ３ — — １ — — ２ — —
ｒｐｓ１４ — — — — — １ — — ｙｃｆ２ １ — — — １ ３ — —
ｐｓａＢ ２ — １ — — — — — ｎｄｈＢ — — — — １ — — —
ｐｓａＡ １ — — — １ — — — ｎｄｈＦ １ ３ — １ １ — — —
ｙｃｆ３ — — １ — １ — １ １ ｒｐｌ３２ — — — １ — — — —
ｎｄｈＫ — — — — — １ — — ｃｃｓＡ ２ １ １ — １ — — —
ａｔｐＢ — １ — — — — — — ｎｄｈＤ １ １ — — — — — —
ｒｂｃＬ １ — — — — — — — ｎｄｈＡ ２ １ — — ２ ３ — ２
ａｃｃＤ １ — １ — １ ２ — — ｙｃｆ１ ５ ３ ３ １ ５ ７ — —
总计
ｃｅｍＡ — — — — １ ２ — — ３１ １７ １４ ６ ２５ ３７ ５ ９
Ｔｏｔａｌ

ａｎｇｕｓｔｉｆｏｌｉａ)(王婧等ꎬ２０１９)等不同ꎬ表明造成密码 叶花椒叶绿体基因序列中共检测到 １４ 个 ｉｎｄｅｌ 位
子使用偏好性的差异因植物而异ꎮ 点ꎬ并且所有的 ｉｎｄｅｌ 位点均位 于 基 因 的 内 含 子
花椒属植物普遍为无融合生殖ꎬ无明显杂交 区ꎬ植物在遗传进化过程中基因内含子区更容易
优势ꎬ物种间或种内个体间遗传变异小( Ｆｅｉ ｅｔ ａｌ.ꎬ 发生碱基的插入或缺失ꎬ导致 ｉｎｄｅｌ 位点在此区域
２０２１)ꎬ选用花椒叶绿体基因组为参考ꎬ分析竹叶 产生 和 积 累 ( Ｙｏｎｇｕｋ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２０)ꎮ 黄 平 仙 等
花椒 ＣＤＳ 的 单 核 苷 酸 变 异 情 况ꎬ 从 中 共 检 测 到 (２０２０)研究发现ꎬｉｎｄｅｌ 标记在基因间隔区和内含
１３０ 个 ＳＮＰꎬ 其 中 ｍａｔＫ、 ｒｐｓ１６、 ａｔｐＡ、 ｒｐｏＣ１、 ｎｄｈＦ、 子区分布的数量最多ꎬ占全部标记的 ８０％以上ꎬ并
ｎｄｈＡ 和 ｙｃｆ１ 这 ７ 个基因的单核苷酸多态性最为丰 指出从基因间隔区和内含子区开发出来的 ｉｎｄｅｌ 标
富ꎬ尤其是 ｙｃｆ１ 基因ꎬ共发现了 ２４ 个单核苷酸变 记多态性更丰富ꎮ 本研究中检测到的多个 ｉｎｄｅｌ 位
异位点ꎬ突变率高达 １８.５％ꎮ 然而ꎬ研究人员早已 点将为花椒属植物分子标记开发及种质资源鉴定
在蔷薇科( Ｗａｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１７)、芸香科( Ｙｏｎｇｕｋ ｅｔ 提供依据ꎮ
ａｌ.ꎬ ２０２０)植物叶绿体基因组进化和突变模式的 高等植物叶绿体基因组核苷酸多态性丰富ꎬ
研究中指出ꎬ在筛选到的几个 ＳＮＰ 多态性较丰富 从序列中检测到的高变区可被用作开发 ＤＮＡ 条
的编码基因中以 ｙｃｆ１ 的单核苷酸变异位点数最 形码ꎬ这些条形码普遍多态性丰富、辨识性高ꎬ可
多ꎬ变异程度也最高ꎬ相比其他基因 ｙｃｆ１ 更有助于 广泛 应 用 于 植 物 分 类 鉴 定 及 系 统 发 育 研 究
种间分类鉴定ꎬ这与本研究结果一致ꎮ 同时ꎬ在竹 (Ｈｅｒｌｉａｎａ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２３ꎻ孟文娜等ꎬ２０２４)ꎮ 以花椒