Page 178 - 《广西植物》2026年第3期
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5 5 4                                  广  西  植  物                                         46 卷
                                        表 2  花椒和竹叶花椒叶绿体基因组基因类型
                          Table 2  Chloroplast genome genotypes of Zanthoxylum bungeanum and Z. armatum

             基因功能分类
                              基因分组                         基因
             Gene function
                              Group of genes               Gene
             classification
             自我复制相关基因         核糖体 RNA                      rrn16 、rrn23 、rrn4.5 、rrn5 2
                                                              2
                                                                   2
                                                                         2
             Genes of self ̄replication  Ribosomal RNA
                                                                 2
                              转运 RNA                       trnA ̄UGC ( 2 )、 trnC ̄GCA、 trnD ̄GUC、 trnE ̄UUC、 trnF ̄GAA、 trnfM ̄CAU、
                                                                                         2
                                                                                                 2
                              Transfer RNA                 trnG ̄GCC、trnG ̄UCC( 2)、 trnH ̄GUG、trnI ̄CAU 、 trnI ̄GAU ( 2)、 trnK ̄UUU
                                                           (2 )、 trnL ̄CAA 、 trnL ̄UAA ( 2 )、 trnL ̄UAG、 trnM ̄CAU、 trnN ̄GUU 、 trnP ̄
                                                                     2
                                                                                                       2
                                                                             2
                                                           UGG、 trnQ ̄UUG、 trnR ̄ACG 、 trnR ̄UCU、 trnS ̄GCU、 trnS ̄GGA、 trnS ̄UGA、
                                                           trnT ̄GGU、trnT ̄UGU、trnV ̄GAC 、trnV ̄UAC(2)、trnW ̄CCA、trnY ̄GUA
                                                                               2
                              核糖体蛋白小亚基                     rps2、 rps3、 rps4、 rps7 、 rps8、 rps11、 rps12  2∗ 、 rps14、 rps15、 rps16 ( 2 )、
                                                                         2
                              Small subunit of ribosomal proteins  rps18、rps19  ∗
                              核糖体蛋白大亚基                     rpl2 (2)、rpl14、rpl16(2)、rpl20、rpl22 、rpl23 、rpl32、rpl33、rpl36
                                                                                         2
                                                             2
                                                                                    ∗
                              Large subunit of ribosomal proteins
                              RNA 聚合酶亚基                    rpoA、rpoB、rpoC1(2)、rpoC2
                              RNA polymerase
             光合作用相关基因         NADH 脱氢酶                     ndhA ( 2 )、 ndhB ( 2 )、 ndhC、 ndhD、 ndhE、 ndhF、 ndhG、 ndhH、 ndhI、
                                                                      2
             Genes for photosynthesis NADH dehydrogenase   ndhJ、ndhK
                              ATP 合成酶                      atpA、atpB 、atpE、atpF(2)、atpH、atpI
                              ATP synthase
                              光合系统Ⅰ                        psaA、psaB、psaC、 psaI、psaJ
                              Photosystem I
                                                                      ∗
                              光合系统Ⅱ                        psbA、psbB、 psbC 、 psbD、 psbE、 psbF、 psbH、 psbI、 psbJ、 psbK、 psbL、 psbM、
                              Photosystem II               psbN、psbT、psbZ
                              细胞色素 b / f 复合体               petA、petB(2)、petD(2)、petG、petL、petN
                              Cytochrome b / f complex
                              RubisCO 大亚基                  rbcL
                              RubisCO large subunit
             其他基因             成熟酶 K                        matK
             Other genes      Maturase K
                              蛋白酶                          clpP(3)
                              Protease
                              囊膜蛋白                         cemA
                              Envelop membrane protein
                              C 型细胞色素合成                    ccsA
                              C ̄type cytochrome synthesis
                              乙酰辅酶 A 羧化酶亚基                 accD
                              Acetyl ̄CoA carboxylase beta subunit
                              编码翻译起始因子                     infA  ∗
                              Translation initiation factor
             未知功能基因           假定叶绿体阅读框                     ycf1 、ycf2 、ycf3(3)、ycf4、ycf15  2
                                                                  2
                                                             ∗
             Unknown function genes Hypothetical chloroplast reading frames
                 2                                                                   ∗
              注: 表示该基因存在 2 个拷贝ꎻ (2)表示该基因有 2 个外显子ꎬ (3)表示该基因有 3 个外显子ꎻ                   表示该基因为特有基因或在 2
            个物种间存在较大差异ꎮ
                                                                                                           ∗
              Note: The gene labeled with superscript 2 has 2 copiesꎻ the gene labeled (2) has 2 exonsꎬ and the gene labeled (3) has 3 exons.
            indicates that the gene is endemic or differs significantly between the two species.

            椒属植物密码子使用偏好影响小ꎬ2 条线截距分别                            和其 他 因 素 对 密 码 子 使 用 偏 好 的 影 响 则 约 为
            为0.367 8、0.361 9ꎬ表明碱基突变对 2 种花椒属植                   64%ꎬ进一步证明 2 种花椒属植物密码子使用偏好
            物密码子使用偏好的影响约为 36%ꎬ而自然选择                            受自然选择的影响更大ꎮ
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