Page 178 - 《广西植物》2026年第3期
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表 2 花椒和竹叶花椒叶绿体基因组基因类型
Table 2 Chloroplast genome genotypes of Zanthoxylum bungeanum and Z. armatum
基因功能分类
基因分组 基因
Gene function
Group of genes Gene
classification
自我复制相关基因 核糖体 RNA rrn16 、rrn23 、rrn4.5 、rrn5 2
2
2
2
Genes of self ̄replication Ribosomal RNA
2
转运 RNA trnA ̄UGC ( 2 )、 trnC ̄GCA、 trnD ̄GUC、 trnE ̄UUC、 trnF ̄GAA、 trnfM ̄CAU、
2
2
Transfer RNA trnG ̄GCC、trnG ̄UCC( 2)、 trnH ̄GUG、trnI ̄CAU 、 trnI ̄GAU ( 2)、 trnK ̄UUU
(2 )、 trnL ̄CAA 、 trnL ̄UAA ( 2 )、 trnL ̄UAG、 trnM ̄CAU、 trnN ̄GUU 、 trnP ̄
2
2
2
UGG、 trnQ ̄UUG、 trnR ̄ACG 、 trnR ̄UCU、 trnS ̄GCU、 trnS ̄GGA、 trnS ̄UGA、
trnT ̄GGU、trnT ̄UGU、trnV ̄GAC 、trnV ̄UAC(2)、trnW ̄CCA、trnY ̄GUA
2
核糖体蛋白小亚基 rps2、 rps3、 rps4、 rps7 、 rps8、 rps11、 rps12 2∗ 、 rps14、 rps15、 rps16 ( 2 )、
2
Small subunit of ribosomal proteins rps18、rps19 ∗
核糖体蛋白大亚基 rpl2 (2)、rpl14、rpl16(2)、rpl20、rpl22 、rpl23 、rpl32、rpl33、rpl36
2
2
∗
Large subunit of ribosomal proteins
RNA 聚合酶亚基 rpoA、rpoB、rpoC1(2)、rpoC2
RNA polymerase
光合作用相关基因 NADH 脱氢酶 ndhA ( 2 )、 ndhB ( 2 )、 ndhC、 ndhD、 ndhE、 ndhF、 ndhG、 ndhH、 ndhI、
2
Genes for photosynthesis NADH dehydrogenase ndhJ、ndhK
ATP 合成酶 atpA、atpB 、atpE、atpF(2)、atpH、atpI
ATP synthase
光合系统Ⅰ psaA、psaB、psaC、 psaI、psaJ
Photosystem I
∗
光合系统Ⅱ psbA、psbB、 psbC 、 psbD、 psbE、 psbF、 psbH、 psbI、 psbJ、 psbK、 psbL、 psbM、
Photosystem II psbN、psbT、psbZ
细胞色素 b / f 复合体 petA、petB(2)、petD(2)、petG、petL、petN
Cytochrome b / f complex
RubisCO 大亚基 rbcL
RubisCO large subunit
其他基因 成熟酶 K matK
Other genes Maturase K
蛋白酶 clpP(3)
Protease
囊膜蛋白 cemA
Envelop membrane protein
C 型细胞色素合成 ccsA
C ̄type cytochrome synthesis
乙酰辅酶 A 羧化酶亚基 accD
Acetyl ̄CoA carboxylase beta subunit
编码翻译起始因子 infA ∗
Translation initiation factor
未知功能基因 假定叶绿体阅读框 ycf1 、ycf2 、ycf3(3)、ycf4、ycf15 2
2
∗
Unknown function genes Hypothetical chloroplast reading frames
2 ∗
注: 表示该基因存在 2 个拷贝ꎻ (2)表示该基因有 2 个外显子ꎬ (3)表示该基因有 3 个外显子ꎻ 表示该基因为特有基因或在 2
个物种间存在较大差异ꎮ
∗
Note: The gene labeled with superscript 2 has 2 copiesꎻ the gene labeled (2) has 2 exonsꎬ and the gene labeled (3) has 3 exons.
indicates that the gene is endemic or differs significantly between the two species.
椒属植物密码子使用偏好影响小ꎬ2 条线截距分别 和其 他 因 素 对 密 码 子 使 用 偏 好 的 影 响 则 约 为
为0.367 8、0.361 9ꎬ表明碱基突变对 2 种花椒属植 64%ꎬ进一步证明 2 种花椒属植物密码子使用偏好
物密码子使用偏好的影响约为 36%ꎬ而自然选择 受自然选择的影响更大ꎮ

