Page 61 - 《广西植物》2026年第9期

９ 期 田昌芬等: 基于叶绿体基因组的蔷薇科水榆属系统发育分析及分类处理 １ ４ ９ ７

Ａ１、Ａ２. 美脉花楸( 水榆属)ꎬ果期萼片脱落ꎬ果实具明显圆环结构ꎻ Ｂ１、Ｂ２. 冠萼花楸( 白花楸属)ꎬ果期萼片宿存ꎻ Ｃ１、Ｃ２.
Ｔｏｒｍｉｎａｌｉｓ ｇｌａｂｅｒｒｉｍａ ( Ｇａｎｄ.) Ｓｅｎｎｉｋｏｖ ＆ Ｋｕｒｔｔｏ ( 驱 疝 木 属)ꎬ 叶 裂 片 深 达 中 脉 一 半 处ꎬ 果 实 棕 色 具 紧 密 皮 孔ꎻ Ｄ１、 Ｄ２.
Ｃｈａｍａｅｍｅｓｐｉｌｕｓ ａｌｐｉｎａ (Ｍｉｌｌ.) Ｋ. Ｒ. Ｒｏｂｅｒｔｓｏｎ ＆ Ｊ. Ｂ. Ｐｈｉｐｐｓꎬ成熟果实红色ꎬ表皮光滑ꎮ
Ａ１ꎬ Ａ２. Ｍｉｃｒｏｍｅｌｅｓ ｃａｌｏｎｅｕｒａ Ｓｔａｐｆ (Ｍｉｃｒｏｍｅｌｅｓ)ꎬ ｗｉｔｈｏｕｔ ｐｅｒｓｉｓｔｅｎｔ ｓｅｐａｌｓ ｗｈｅｎ ｆｒｕｉｔｉｎｇ ａｎｄ ｉｔｓ ｆｒｕｉｔ ｅｘｉｓｔｓ ａ ｃｌｅａｒｌｙ ｃｉｒｃｕｌａｒ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅꎻ Ｂ１ꎬ
Ｂ２. Ａｒｉａ ｃｏｒｏｎａｔａ (Ｃａｒｄ.) Ｈ. Ｏｈａｓｈｉ ＆ Ｉｋｅｔａｎｉ (Ａｒｉａ)ꎬ ｗｉｔｈ ｐｅｒｓｉｓｔｅｎｔ ｓｅｐａｌｓ ｗｈｅｎ ｆｒｕｉｔｉｎｇꎻ Ｃ１ꎬ Ｃ２. Ｔｏｒｍｉｎａｌｉｓ ｇｌａｂｅｒｒｉｍａ (Ｇａｎｄ.) Ｓｅｎｎｉｋｏｖ
＆ Ｋｕｒｔｔｏ (Ｔｏｒｍｉｎａｌｉｓ)ꎬ ｗｉｔｈ ｔｈｅ ｌａｍｉｎａ ｌｏｂｅｄ ａｂｏｕｔ ｈａｌｆｗａｙ ｔｏ ｔｈｅ ｍｉｄｖｅｉｎꎬ ｆｒｕｉｔ ｂｒｏｗｎ ｗｉｔｈ ｄｅｎｓｅ ｌｅｎｔｉｃｅｌｓꎻ Ｄ１ꎬ Ｄ２. Ｃｈａｍａｅｍｅｓｐｉｌｕｓ ａｌｐｉｎａ
(Ｍｉｌｌ.) Ｋ. Ｒ. Ｒｏｂｅｒｔｓｏｎ ＆ Ｊ. Ｂ. Ｐｈｉｐｐｓꎬ ｔｈｅ ｆｒｕｉｔ ｉｓ ｒｅｄ ｗｈｅｎ ｒｉｐｅꎬ ｗｉｔｈ ａ ｓｍｏｏｔｈ ｓｕｒｆａｃｅ.
图 １ 水榆属及广义花楸属内单叶近缘类群物种的形态比较
Ｆｉｇ. １ Ｍｏｒｐｈｏｌｏｇｉｃａｌ ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎ ｂｅｔｗｅｅｎ Ｍｉｃｒｏｍｅｌｅｓ ａｎｄ ｓｉｍｐｌｅ￣ｌｅａｖｅｄ ｃｌｏｓｅｌｙ ｒｅｌａｔｅｄ ｔａｘａ ｗｉｔｈｉｎ Ｓｏｒｂｕｓ ｓ. ｌ.

个ꎬ其中水榆属 １８ 个ꎬ冠萼类群物种 １７ 个ꎬ狭义 １.３ 系统发育分析
花楸属 ３ 个ꎮ 结合美国国家生物技术信息中心 桑科是蔷薇目中分化较早的类群ꎬ其原始特
( Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎꎬ 征与苹果族的特化特征差异明显ꎬ分子标记稳定
ＮＣＢＩ)公开数据ꎬ共有广义花楸属 ７１ 个物种 ７２ 条 且单系性明确ꎬ能有效锚定进化树的根部位置ꎬ桑
序列ꎬ参试物种覆盖 Ｐｈｉｐｐｓ 划分的 ６ 个亚属以及 科在蔷薇目系统发育研究中被广泛用作外类群ꎬ
俞德浚划分的 １４ 个系(材料信息见附录 １)ꎮ 其分子标记(如 ＩＴＳ、ｔｒｎＬ－Ｆ) 的适用性已在多个研
１.２ ＤＮＡ 提取测序与组装注释 究中验证ꎬ确保了分析结果的可重复性与可信度
采用改良 ＣＴＡＢ 法提取样品叶片总 ＤＮＡꎬ通 (陈仁芳等ꎬ ２０１１ꎻ Ｚｈａｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１１)ꎮ 本研究以
过高通量测序平台 Ｉｌｌｕｍｉｎａ ＨｉＳｅｑ２５００ 完成 ｃＤＮＡ 桑(Ｍｏｒｕｓ ａｌｂａ Ｌ.)为外类群ꎬ苹果族 ２８ 个属 ６２ 个
文库测序ꎬＤＮＡ 提取和测序工作委托百迈客生物 物种为近缘类群ꎬ结合花楸属复合群 ７１ 个物种ꎬ
科技有限公司和深圳华大基因股份有限公司ꎮ 利 共 １３５ 条 序 列ꎬ 构 建 水 榆 属 系 统 发 育 树ꎮ 使 用

用 ＧｅｔＯｒｇａｎｅｌｌｅ ｖ１.７.２ 对原始数据进行组装( Ｊｉｎ ｅｔ ＭＡＦＦＴ ｖ７.４９０(Ｋａｔｏｈ ＆ Ｓｔａｎｄｌｅｙꎬ ２０１３) 进行全基
ａｌ.ꎬ ２０２０)ꎬ以苹果族和广义花楸属物种的叶绿体 因组 序 列 多 序 列 比 对ꎬ 选 择 ＩＱ￣ＴＲＥＥ ｖ２. １. １

基因组作 为 参 考 序 列ꎮ 使 用 在 线 软 件 Ｏｒｇｎｅｌｌａｒ￣ (Ｎｇｕｙｅｎ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１５) 构 建 最 大 似 然 ( ｍａｘｉｍｕｍ
ＧｅｎｏｍｅＤＲＡＷꎬ注释叶绿体基因组( Ｇｒｅｉｎｅｒ ｅｔ ａｌ.ꎬ ｌｉｋｅｌｉｈｏｏｄꎬＭＬ)树ꎬ模型选择 ＧＴＲＧＡＭＭＡ(ＧＴＲ＋Ｆ＋Ｉ＋
２０１９)ꎮ Ｒ４)ꎬＢｏｏｔｓｔｒａｐ 值设置为 ５ ０００ꎮ 以 ＭｒＢａｙｅｓｖ３.２.７