Page 56 - 《广西植物》2026年第9期
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１ ４ ９ ２ 广 西 植 物 ４６ 卷
ｃａｒｂｏｘｙｌａｓｅ ｉｎ ｈｉｇｈｅｒ ｐｌａｎｔｓ: ｍｏｓｔ ｐｌａｎｔｓ ｏｔｈｅｒ ｔｈａｎ １３: １０４３７４０.
Ｇｒａｍｉｎｅａｅ ｈａｖｅ ｂｏｔｈ ｔｈｅ ｐｒｏｋａｒｙｏｔｉｃ ａｎｄ ｔｈｅ ｅｕｋａｒｙｏｔｉｃ ｆｏｒｍｓ Ｒａｎｗｅｚ Ｖꎬ Ｄｏｕｚｅｒｙ Ｅ Ｊ Ｐꎬ Ｃａｍｂｏｎ Ｃꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１８. ＭＡＣＳＥ
ｏｆ ｔｈｉｓ ｅｎｚｙｍｅ [ Ｊ]. Ｐｌａｎｔ ＆ Ｃｅｌｌ Ｐｈｙｓｉｏｌｏｇｙꎬ ３７(２): ｖ２: ｔｏｏｌｋｉｔ ｆｏｒ ｔｈｅ ａｌｉｇｎｍｅｎｔ ｏｆ ｃｏｄｉｎｇ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ａｃｃｏｕｎｔｉｎｇ
１１７－１２２. ｆｏｒ ｆｒａｍｅｓｈｉｆｔｓ ａｎｄ ｓｔｏｐ ｃｏｄｏｎｓ [Ｊ]. Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ ａｎｄ
Ｋｕｒｔｚ Ｓꎬ Ｃｈｏｕｄｈｕｒｉ Ｊ Ｖꎬ Ｏｈｌｅｂｕｓｃｈ Ｅꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２００１. ＲＥＰｕｔｅｒ: Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎꎬ ３５(１０): ２５８２－２５８４.
ｔｈｅ ｍａｎｉｆｏｌｄ ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ ｏｆ ｒｅｐｅａｔ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｎ ａ ｇｅｎｏｍｉｃ Ｒａｕｂｅｓｏｎ Ｌ Ａꎬ Ｐｅｅｒｙ Ｒꎬ Ｃｈｕｍｌｅｙ Ｔ Ｗꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２００７.
ｓｃａｌｅ [Ｊ]. Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈꎬ ２９(２２): ４６３３－４６４２. Ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｉｃｓ: ａｎａｌｙｓｅｓ ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ ｎｅｗ
Ｌｉ Ｘꎬ Ｙａｎｇ Ｊ Ｂꎬ Ｗａｎｇ Ｈꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２１. Ｐｌａｓｔｉｄ ＮＤＨ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｆｒｏｍ ｔｈｅ ａｎｇｉｏｓｐｅｒｍｓ Ｎｕｐｈａｒ ａｄｖｅｎａ ａｎｄ
ｐｓｅｕｄｏｇｅｎｉｚａｔｉｏｎ ａｎｄ ｇｅｎｅ ｌｏｓｓ ｉｎ ａ ｒｅｃｅｎｔｌｙ ｄｅｒｉｖｅｄ ｌｉｎｅａｇｅ Ｒａｎｕｎｃｕｌｕｓ ｍａｃｒａｎｔｈｕｓ [Ｊ]. ＢＭＣ Ｇｅｎｏｍｉｃｓꎬ ８(１): １７４.
ｆｒｏｍ ｔｈｅ ｌａｒｇｅｓｔ ｈｅｍｉｐａｒａｓｉｔｉｃ ｐｌａｎｔ ｇｅｎｕｓ Ｐｅｄｉｃｕｌａｒｉｓ Ｒｅｖｅｌｌ Ｌ Ｊꎬ ２０２４. Ｐｈｙｔｏｏｌｓ ２.０: ａｎ ｕｐｄａｔｅｄ Ｒ ｅｃｏｓｙｓｔｅｍ ｆｏｒ
(Ｏｒｏｂａｎｃｈａｃｅａｅ) [ Ｊ]. Ｐｌａｎｔ ＆ Ｃｅｌｌ Ｐｈｙｓｉｏｌｏｇｙꎬ ６２(６): ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ ｍｅｔｈｏｄｓ ( ａｎｄ ｏｔｈｅｒ ｔｈｉｎｇｓ )
９７１－９８４. [Ｊ]. ＰｅｅｒＪꎬ １２: ｅ１６５０５.
Ｌｉｕ Ｂ Ｂꎬ Ｃａｍｐｂｅｌｌ Ｃ Ｓꎬ Ｈｏｎｇ Ｄ Ｙꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２０. Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ Ｒｏｎｑｕｉｓｔ Ｆꎬ Ｔｅｓｌｅｎｋｏ Ｍꎬ ｖａｎ ｄｅｒ Ｍａｒｋ Ｐꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１２.
ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓ ａｎｄ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｃａｐｔｕｒｅ ｉｎ ｔｈｅ Ａｍｅｌａｎｃｈｉｅｒ￣ ＭｒＢａｙｅｓ ３.２: ｅｆｆｉｃｉｅｎｔ Ｂａｙｅｓｉａｎ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｉｎｆｅｒｅｎｃｅ ａｎｄ
Ｍａｌａｃｏｍｅｌｅｓ￣Ｐｅｒａｐｈｙｌｌｕｍ ｃｌａｄｅ ( Ｍａｌｅａｅꎬ Ｒｏｓａｃｅａｅ ): ｍｏｄｅｌ ｃｈｏｉｃｅ ａｃｒｏｓｓ ａ ｌａｒｇｅ ｍｏｄｅｌ ｓｐａｃｅ [ Ｊ]. Ｓｙｓｔｅｍａｔｉｃ
Ｅｖｉｄｅｎｃｅ ｆｒｏｍ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ａｎｄ ｎｕｃｌｅａｒ ｒｉｂｏｓｏｍａｌ Ｂｉｏｌｏｇｙꎬ ６１(３): ５３９－５４２.
ＤＮＡ ｄａｔａ ｕｓｉｎｇ ｇｅｎｏｍｅ ｓｋｉｍｍｉｎｇ [ Ｊ ]. Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｒｏｚａｓ Ｊꎬ Ｆｅｒｒｅｒ￣Ｍａｔａ Ａꎬ Ｓｎｃｈｅｚ￣Ｄｅｌｂａｒｒｉｏ Ｊ Ｃꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ
Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃｓ ａｎｄ Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎꎬ １４７: １０６７８４. ２０１７. ＤｎａＳＰ ６: ＤＮＡ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ
Ｌóｐｅｚ￣Ｃａａｍａｌ Ａꎬ Ｇａｎｄｅｅ Ｔꎬ Ｇａｌｌｏｗａｙ Ｌ Ｆꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２５. ｌａｒｇｅ ｄａｔａ ｓｅｔｓ [ Ｊ ]. Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ ａｎｄ Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎꎬ
Ｓｕｂｓｔａｎｔｉａｌ ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ ｖａｒｉａｔｉｏｎ ａｎｄ ｒｅｐｅｔｉｔｉｖｅ ＤＮＡ ｃｏｎｔｅｎｔ ３４(１２): ３２９９－３３０２.
ｃｏｎｔｒｉｂｕｔｅ ｔｏ ｉｎｔｒａｓｐｅｃｉｆｉｃ ｐｌａｓｔｉｄ ｇｅｎｏｍｅ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ [Ｊ]. ＢＭＣ Ｒｕｈｌｍａｎ Ｔ Ａꎬ Ｃｈａｎｇ Ｗ Ｊꎬ Ｃｈｅｎ Ｊ Ｊꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１５. ＮＤＨ
Ｇｅｎｏｍｉｃｓꎬ ２６(１): ３４０. ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｍａｒｋｓ ｍａｊｏｒ ｔｒａｎｓｉｔｉｏｎｓ ｉｎ ｐｌａｎｔ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ａｎｄ
Ｍｅｒｃｋｘ Ｖꎬ Ｂｉｄａｒｔｏｎｄｏ Ｍ Ｉꎬ Ｈｙｎｓｏｎ Ｎ Ａꎬ ２００９. Ｍｙｃｏ￣ ｒｅｖｅａｌｓ ｃｏｏｒｄｉｎａｔｅ ｉｎｔｒａｃｅｌｌｕｌａｒ ｇｅｎｅ ｌｏｓｓ [ Ｊ]. ＢＭＣ Ｐｌａｎｔ
ｈｅｔｅｒｏｔｒｏｐｈｙ: ｗｈｅｎ ｆｕｎｇｉ ｈｏｓｔ ｐｌａｎｔｓ [Ｊ]. Ａｎｎａｌｓ ｏｆ Ｂｏｔａｎｙꎬ Ｂｉｏｌｏｇｙꎬ １５(１): １００.
１０４(７): １２５５－１２６１. Ｒｕｈｌｍａｎ Ｔ Ａꎬ Ｊａｎｓｅｎ Ｒ Ｋꎬ ２０１８. Ａｂｅｒｒａｔｉｏｎ ｏｒ ａｎａｌｏｇｙ? Ｔｈｅ
Ｍｉｌｌｅｎ Ｒ Ｓꎬ Ｏｌｍｓｔｅａｄ Ｒ Ｇꎬ Ａｄａｍｓ Ｋ Ｌꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２００１. Ｍａｎｙ ａｔｙｐｉｃａｌ ｐｌａｓｔｏｍｅｓ ｏｆ Ｇｅｒａｎｉａｃｅａｅ [Ｍ] / / Ｃｈａｗ Ｓ Ｍꎬ Ｊａｎｓｅｎ
ｐａｒａｌｌｅｌ ｌｏｓｓｅｓ ｏｆ ｉｎｆＡ ｆｒｏｍ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ＤＮＡ ｄｕｒｉｎｇ Ｒ Ｋ. Ａｄｖａｎｃｅｓ ｉｎ ｂｏｔａｎｉｃａｌ ｒｅｓｅａｒｃｈ: Ｖｏｌ. ８５. Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ:
ａｎｇｉｏｓｐｅｒｍ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｗｉｔｈ ｍｕｌｔｉｐｌｅ ｉｎｄｅｐｅｎｄｅｎｔ ｔｒａｎｓｆｅｒｓ ｔｏ Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ: ２２３－２６２.
ｔｈｅ ｎｕｃｌｅｕｓ [Ｊ]. Ｔｈｅ Ｐｌａｎｔ Ｃｅｌｌꎬ １３(３): ６４５－６５８. Ｓｈｉ Ｃꎬ Ｌｉｕ Ｙꎬ Ｈｕａｎｇ Ｈꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１３. Ｃｏｎｔｒａｄｉｃｔｉｏｎ ｂｅｔｗｅｅｎ
Ｍｕｒａｇｕｒｉ Ｓꎬ Ｘｕ Ｗꎬ Ｃｈａｐｍａｎ Ｍꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２０. Ｉｎｔｒａｓｐｅｃｉｆｉｃ ｐｌａｓｔｉｄ ｇｅｎｅ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ａｎｄ ｆｕｎｃｔｉｏｎ ｄｕｅ ｔｏ ｃｏｍｐｌｅｘ
ｖａｒｉａｔｉｏｎ ｗｉｔｈｉｎ Ｃａｓｔｏｒ ｂｅａｎ (Ｒｉｃｉｎｕｓ ｃｏｍｍｕｎｉｓ Ｌ.) ｂａｓｅｄ ｏｎ ｐｏｓｔｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎａｌ ｓｐｌｉｃｉｎｇ: ａｎ ｅｘｅｍｐｌａｒｙ ｓｔｕｄｙ ｏｆ ｙｃｆ１５
ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ [ Ｊ]. Ｉｎｄｕｓｔｒｉａｌ Ｃｒｏｐｓ ａｎｄ Ｐｒｏｄｕｃｔｓꎬ ｆｕｎｃｔｉｏｎ ａｎｄ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｉｎ ａｎｇｉｏｓｐｅｒｍｓ [ Ｊ]. ＰＬｏＳ ＯＮＥꎬ
１５５: １１２７７９. ８(３): ｅ５９６２０.
Ｎｉｃｋｒｅｎｔ Ｄ Ｌꎬ ２０２０. Ｐａｒａｓｉｔｉｃ ａｎｇｉｏｓｐｅｒｍｓ: Ｈｏｗ ｏｆｔｅｎ ａｎｄ ｈｏｗ Ｓｈｉｋａｎａｉ Ｔꎬ ２０１６. Ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ＮＤＨ: ａ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｅｎｚｙｍｅ ｗｉｔｈ ａ
ｍａｎｙ? [Ｊ]. Ｔａｘｏｎꎬ ６９(１): ５－２７. ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ｓｉｍｉｌａｒ ｔｏ ｔｈａｔ ｏｆ ｒｅｓｐｉｒａｔｏｒｙ ＮＡＤＨ ｄｅｈｙｄｒｏｇｅｎａｓｅ
Ｐａｌｍｅｒ Ｊ Ｄꎬ １９８５. Ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ ｏｒｇａｎｉｚａｔｉｏｎ ｏｆ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ [Ｊ]. Ｂｉｏｃｈｉｍｉｃａ ｅｔ Ｂｉｏｐｈｙｓｉｃａ Ａｃｔａ (ＢＢＡ)￣Ｂｉｏｅｎｅｒｇｅｔｉｃｓꎬ
ｇｅｎｏｍｅｓ [Ｊ]. Ａｎｎｕａｌ Ｒｅｖｉｅｗ ｏｆ Ｇｅｎｅｔｉｃｓꎬ １９: ３２５－３５４. １８５７(７): １０１５－１０２２.
Ｐｅｄｅｎ Ｊ Ｆꎬ １９９９. Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｃｏｄｏｎ ｕｓａｇｅ [Ｄ]. Ｎｏｔｔｉｎｇｈａｍ: Ｓｔａｍａｔａｋｉｓ Ａꎬ ２０１４. ＲＡｘＭＬ ｖｅｒｓｉｏｎ ８: ａ ｔｏｏｌ ｆｏｒ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ
Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｎｏｔｔｉｎｇｈａｍ. ａｎａｌｙｓｉｓ ａｎｄ ｐｏｓｔ￣ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｌａｒｇｅ ｐｈｙｌｏｇｅｎｉｅｓ [ Ｊ ].
Ｐｏｓａｄａ Ｄꎬ ２００８. ｊＭｏｄｅｌＴｅｓｔ: ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｍｏｄｅｌ ａｖｅｒａｇｉｎｇ Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓꎬ ３０(９): １３１２－１３１３.
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Ｑｕ Ｘ Ｊꎬ Ｍｏｏｒｅ Ｍ Ｊꎬ Ｌｉ Ｄ Ｚꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１９. ＰＧＡ: ａ ｓｏｆｔｗａｒｅ ｂａｓｉｃｓꎬ ｈｉｓｔｏｒｙ ａｎｄ ｍｏｄｅｌｌｉｎｇ [ Ｊ ]. Ａｎｎａｌｓ ｏｆ Ｂｏｔａｎｙꎬ
ｐａｃｋａｇｅ ｆｏｒ ｒａｐｉｄꎬ ａｃｃｕｒａｔｅꎬ ａｎｄ ｆｌｅｘｉｂｌｅ ｂａｔｃｈ ａｎｎｏｔａｔｉｏｎ ｏｆ １２６(４): ５１１－５３７.
ｐｌａｓｔｏｍｅｓ [Ｊ]. Ｐｌａｎｔ Ｍｅｔｈｏｄｓꎬ １５: ５０. Ｓｔｒａｎｄ Ｄ Ｄꎬ ＤＡｎｄｒｅａ Ｌꎬ Ｂｏｃｋ Ｒꎬ ２０１９. Ｔｈｅ ｐｌａｓｔｉｄ ＮＡＤ(Ｐ)
Ｒａｍａｎ Ｇꎬ Ｎａｍ Ｇ Ｈꎬ Ｐａｒｋ Ｓꎬ ２０２２. Ｅｘｔｅｎｓｉｖｅ ｒｅｏｒｇａｎｉｚａｔｉｏｎ ｏｆ Ｈ ｄｅｈｙｄｒｏｇｅｎａｓｅ￣ｌｉｋｅ ｃｏｍｐｌｅｘ: ｓｔｒｕｃｔｕｒｅꎬ ｆｕｎｃｔｉｏｎ ａｎｄ
ｔｈｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｏｆ Ｃｏｒｙｄａｌｉｓ ｐｌａｔｙｃａｒｐａ: ａ ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙ ｄｙｎａｍｉｃｓ [ Ｊ ]. Ｔｈｅ Ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ Ｊｏｕｒｎａｌꎬ
ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｔｈｅｉｒ ｏｒｇａｎｉｚａｔｉｏｎ ａｎｄ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｗｉｔｈ ｏｔｈｅｒ ４７６(１９): ２７４３－２７５６.
Ｃｏｒｙｄａｌｉｓ ｐｌａｓｔｏｍｅｓ [ Ｊ ]. Ｆｒｏｎｔｉｅｒｓ ｉｎ Ｐｌａｎｔ Ｓｃｉｅｎｃｅꎬ Ｓｕｄｉａｎｔｏ Ｅꎬ Ｃｈａｗ Ｓ Ｍꎬ ２０１９. Ｔｗｏ ｉｎｄｅｐｅｎｄｅｎｔ ｐｌａｓｔｉｄ ａｃｃＤ
