Page 28 - 《广西植物》2020年第4期
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图 １ 华山松基因组 ＤＮＡ 琼脂糖凝胶电泳检测结果
Ｆｉｇ. １ Ａｇａｒｏｓｅ ｇｅｌ ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ ｒｅｓｕｌｔｓ ｏｆ Ｐｉｎｕｓ ａｒｍａｎｄｉｉ ｇｅｎｏｍｉｃ ＤＮＡ
度(Ｈ)等参数]ꎻ利用 ＮＴＳＹＳ ２.１０ 软件对 ６ 个种源 表 ４ ６０ 个华山松 ＤＮＡ 样本的电泳位点结果统计
Ｔａｂｌｅ ４ Ｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌ ｒｅｓｕｌｔｓ ｏｆ ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ ｌｏｃｉ ｉｎ
的华山松进行聚类ꎬ形成聚类图ꎮ
６０ ｓａｍｐｌｅｓ ｏｆ Ｐｉｎｕｓ ａｒｍａｎｄｉｉ ＤＮＡ
２ 结果与分析 多态位点数
种源地 ＰＰＢ
Ｎｕｍｂｅｒ ｏｆ
Ｐｒｏｖｅｎａｎｃｅ ａｒｅａ (％)
ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃ ｌｏｃｕｓ
２.１ 华山松基因组 ＤＮＡ 提取结果
会泽 ＨＺ １３８.００ ７１.１３
将华山松基因组 ＤＮＡ 用 １％的琼脂糖凝胶检
巍山 ＷＳ １２５.００ ６４.４３
测ꎬ部分结果如图 １ 所示ꎬＤＮＡ 条带清晰且无拖带
腾冲 ＴＣ １５９.００ ８１.９６
和弥散现象ꎬ可满足后续实验的要求ꎮ
楚雄 ＣＸ １００.００ ５１.５５
２.２ ＳＲＡＰ￣ＰＣＲ 扩增结果
南华 ＮＨ ８９.００ ４５.８８
用 １５ 对具有多态性的引物对 ６ 个种源共 ６０
宜良 ＹＬ ８０.００ ４１.２４
株不同华山松无性系进行 ＰＣＲ 扩增反应ꎬ共扩增
平均值 Ｍｅａｎ １１５.１７ ５９.３７
出 １６５ 个多态性位点ꎬ其结果列于表 ４ꎮ
物种水平 Ｓｐｅｃｉｅｓ ｌｅｖｅｌ １６５.００ ８５.０５
从表 ４ 可以看出ꎬ在各种源间ꎬ华山松多态位
点百分率( ＰＰＢ) 为 ８５.０５％ꎻ在各种源内ꎬ各个种
为 ０. ４７１ ６ꎮ 等 位 基 因 数 ( Ｎａ) 最 高 的 是 腾 冲
源的 ＰＰＢ 为 ４１.２４％ ~ ８１.９６％ꎬ平均值为５９.３７％ꎮ
ＰＰＢ 最低的是宜良( ＹＬ) 种源ꎬ为 ４１.２４％ꎻＰＰＢ 最 (ＴＣ)ꎬ为 １.８１９ ６ꎬ最低的是宜良(ＹＬ)ꎬ为１.１４２ ４ꎬ
高的是腾冲(ＴＣ)种源ꎬ为 ８１.９６％ꎮ 把华山松 ６ 个 有效 等 位 基 因 数 ( Ｎｅ) 最 高 的 是 腾 冲 ( ＴＣ)ꎬ 为
种源根据 ＰＰＢ 大 小 进 行 排 序: 腾 冲 ( ＴＣ) > 会 泽 １.５８０ ９ꎬ最低的是宜良( ＹＬ)ꎬ为 １.２６９ １ꎮ ６ 个种
(ＨＺ) >巍山( ＷＳ) >楚雄( ＣＸ) >南华( ＮＨ) >宜良 源的 Ｈ 和 Ｉ 均表明ꎬ各种源的遗传变异从大到小
依次为腾冲( ＴＣ) >会泽( ＨＺ) >巍山( ＷＳ) >南华
(ＹＬ)ꎮ
２.３ 遗传多样性分析 (ＮＨ) >宜良(ＹＬ) >楚雄(ＣＸ)(表 ５)ꎮ
华山松 ６ 个 不 同 种 源 的 Ｎｅｉ′ ｓ 基 因 多 样 性 ２.４ 遗传分化分析
(Ｈ)范围为 ０.１８７ ３ ~ ０.３２３ ４ꎬ楚雄( ＣＸ) 的最低ꎬ 由 Ｎｅｉ′ｓ 指数估算可知ꎬ６ 个华山松种源的总
为 ０. １８７ ３ꎬ 腾 冲 ( ＴＣ ) 的 最 高ꎬ 为 ０. ３２３ ４ꎮ 基因多样度( Ｈｔ) 为 ０. ３４２ ０ꎬ种源内基因多样性
Ｓｈａｎｎｏｎ’ｓ 信息指数( Ｉ) 范围为 ０.２７７ ０ ~ ０.４７１ ６ꎬ (Ｈｓ)为 ０.２２０ ４ꎮ 遗传分化系数( Ｇ ) 为 ０.３５５ ５ꎬ
ＳＴ
楚雄(ＣＸ)的最低ꎬ为 ０.２７７ ０ꎬ腾冲(ＴＣ)的最高ꎬ 说明在华山松种源间有 ３５.５５％的遗传变异ꎬ 而在
