Page 73 - 《广西植物》2020年第4期
P. 73

4 期                      樊航等: 西番莲 PeERG 基因克隆及其表达模式分析                                       5 1 1

   程中发挥重要作用ꎮ                                         州省平塘县西番莲种质资源库(106°48′45.44″ E、
       植物 ERG 蛋白定位于线粒体或叶绿体ꎬ它们                        25°44′24.77″ Nꎬ海拔 884 m)ꎬ其不同组织器官根、
   在植物的生长发育过程中扮演重要角色(Ingram et                       茎、叶、花、果(R、S、L、Fl、Fr) 采集于 2 年生的大田
   al.ꎬ 1998ꎻ Suwastika et al.ꎬ 2014ꎻ Cheng et al.ꎬ  扦插苗ꎮ 盆栽的 1 年生扦插苗ꎬ用于 4 ℃ 低温胁
   2018)ꎮ 迄今ꎬ还没有木本植物 ERG 基因克隆和                       迫及 25 ℃ 常温恢复试验ꎬ并在其低温胁迫 0 h( 对

   功能验证的相关报道ꎮ 西番莲抗寒新品种‘ 平塘 1                         照)、1 h( LST ̄1h)、4 h( LST ̄4h)、8 h( LST ̄8h)、24
   号’ꎬ经受过 2008 年中国南方雪凝冰冻极端天气                         h(LST ̄24h)、72 h(LST ̄72h) 及其放置于常温恢复

   的考验ꎬ是目前选育出的唯一能在贵州喀斯特山                             1 h( NTR ̄1h)、4 h( NTR ̄4h)、8 h( NTR ̄8h)、24 h
   区不经任何保暖防护措施而在零下温度条件能顺                             (NTR ̄24h)、72 h(NTR ̄72h)11 个时间点取其叶片
   利越冬的西番莲新种质ꎮ 课题组前期开展了西番                            用于目的基因在低温胁迫及常温恢复过程中的表
   莲抗 寒 性 状 的 分 子 调 控 模 式 研 究 ( Liu et al.ꎬ          达谱分析ꎮ 所用三个生物学重复的上述样品经液
   2017)ꎬ差异基因表达谱分析发现ꎬERG 基因参与                        氮速冻后保存于-80 ℃ 超低温冰箱备用ꎮ
   调控西番莲低温应答响应ꎮ 本研究以此为切入                             1.2 总 RNA 提取与 cDNA 合成
   点ꎬ通过 RACE 技术克隆西番莲 ERG 基因ꎬ开展该                          采用天根生物科技( 北京) 有限公司提供的

   基因编码蛋白质序列的同源性比对、保守结构域                             RNAprep Pure Plant Kit( TIANGENꎬ北京) 抽提纯
   及系统进化分析ꎬ并利用实时定量 PCR 平台检测                          化植物总 RNAꎬ并用宝生物工程( 大连) 有限公司
   该转录本在低温胁迫条件下的动态变化模式ꎬ为                             的 PrimeScript RT Master Mix(TaKaRaꎬ大连)进行
                                                                  TM
   深入揭示 ERG 基因在植物生长发育和逆境应答响                          反转录合成 cDNA 用于后续基因表达分析ꎮ
   应中的生物学功能提供新思路ꎮ                                    1.3 cDNA 末端快速克隆(RACE)
                                                         根据实验室前期研究获得的候选基因 unigene
   1  材料与方法                                          序列(Liu et al.ꎬ 2017)ꎬ设计 PCR 引物( 表 1)ꎬ以
                                                     ‘平塘 1 号’ 叶片 cDNA 为模板ꎬ开展候选基因片
   1.1 植物材料及低温胁迫试验                                   段的 PCR 扩增和测序验证ꎮ 基于测序验证获得的

       西番莲抗寒新品种‘平塘 1 号’ 材料来自于贵                       基因片段序列设计 RACE 特异引物 (表 1)ꎬ 按照
                                            表 1  引物序列
                                        Table 1  Primer sequences

        引物名称                   正向引物(5′ ̄3′)                             反向引物(5′ ̄3′)
        Primer_ID           Forward PCR primer(5′ ̄3′)              Reverse PCR primer(5′ ̄3′)
      PeERG_基因片段         GACGGCGACGAAGAGGACGAAGAA                TGGCCCAGAGCAAGACAACGTAG
      PeERG _Unigene
      PeERG_3 外引物        CCGATAAGCACAGACAACAAGGC       ACTCTGCGTTGATACCACTGCTTGCCCTATAGTGAGTCGTATTAG
      PeERG _3OUTER
      PeERG_3 内引物         ATGAAGAATGTCCGCAGTGCTG                  GCCCTATAGTGAGTCGTATTAG
      PeERG _3INNER
      PeERG_5 外引物       GCGAGGCATGGAATCATCCTGTGCTAA   CTAATACGACTCACTATAGGGCAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGT
      PeERG _5OUTER
      PeERG_5 内引物         CAACAAAAGGGACGGCTACGAA                  CTAATACGACTCACTATAGGGC
      PeERG _5INNER
       开放阅读框              ATGGAGCTAGTTTTAAACGTCTC                  TAATGCTGCGATTTTCCCTC
       PeERG _ORF
      PeERG 定量引物           CAGATGCGGATTAGCGAGC                      CGTCTTCTTCGTCCTCTTC
     PeERG _qRT ̄PCR
     内参基因定量引物              TGGGCCGATGTCCTTGAGAGA                 GGATGACTTGAGGCTCCCAACTG
      eIF ̄5A_qRT ̄PCR
   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78