Page 86 - 《广西植物》2020年第7期

９ ８ ２ 广 西 植 物 ４０ 卷
续表 １
氨基酸大小
基因名称 染色体定位 蛋白登录号
Ｐｅｐｔｉｄｅ ｌｅｎｇｔｈ
Ｇｅｎｅ ｎａｍｅ Ｃｈｒｏｍｏｓｏｍａｌ ｌｏｃａｌｉｚａｔｉｏｎ Ｐｒｏｔｅｉｎ ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ.
(ａａ)
ＥｇＷＲＫＹ８５ ７０７..１８７６ － ＸＰ＿０１０９１１４５８.１ ２３２
ＥｇＷＲＫＹ８６ ３０９５１..３３２０７ － ＸＰ＿０１０９１０３２３.１ １３３
ＥｇＷＲＫＹ８７ １１１８５２３..１１２２９２６ ＋ ＸＰ＿０１０９０４９５８.１ ２５１
ＥｇＷＲＫＹ８８ １１５４５５０..１１５６５２５ ＋ ＸＰ＿０１０９４２１０１.１ ３１６
ＥｇＷＲＫＹ８９ ７７６０６７.. ７８４８８２ － ＸＰ＿０１０９４２０９２.１ ５３５
ＥｇＷＲＫＹ９０ １１３２０５３.. １１９６５４４ － ＸＰ＿０１０９４３６０６.１ ７０９
ＥｇＷＲＫＹ９１ １０５６４８８.. １０８２２８５ － ＸＰ＿０１０９０５３００.１ ６７２
ＥｇＷＲＫＹ９２ ２９８０９１..３１１１９３ ＋ ＸＰ＿０１０９０６８６９.１ ５５１
ＥｇＷＲＫＹ９３ １５７０５２..１７４７１３ ＋ ＸＰ＿０１０９０８２４４.１ ５４５
ＥｇＷＲＫＹ９４ ２３１２３８..２５３８４９ － ＸＰ＿０１０９０８５８１.１ ６４１
ＥｇＷＲＫＹ９５ ２４５４９４.. ２５０１８１ ＋ ＸＰ＿０１０９０８９６２.１ ４７８

图 １ 所示ꎮ 油棕 ＷＲＫＹ 蛋白主要分为三大类ꎬ即 ２００４)ꎬ黄瓜基因组中有 １３２ 个 ＷＲＫＹ 转录因子
Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ类ꎮ 其中ꎬ根据 ＷＲＫＹ 保守结构域所处 (谷彦冰等ꎬ２０１５)ꎬ棉花基因组中有 １１６ 个 ＷＲＫＹ
的位置ꎬ将第 Ｉ 类分为 Ｉ Ｎ 和 Ｉ Ｃ 两个亚类ꎻ第Ⅱ类 转录因子( Ｄｏｕ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１４)ꎬ橡胶树基因组中含
含有 １ 个锌指结构和 １ 个 ＷＲＫＹ 保守结构域ꎬ根 有 ８１ 个 ＷＲＫＹ 转录因子(Ｌｉ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１４)ꎬ桑树基

据锌指结构的不同ꎬ又将其分为Ⅱ ａ、Ⅱ ｂ、Ⅱ ｃ 及 因组 中 含 有 ５４ 个 ＷＲＫＹ 转 录 因 子 ( Ｂａｒａｎｗａｌ ｅｔ
Ⅱ ｄ 四个亚类ꎻ第Ⅲ类是含有 ２ 个 ＷＲＫＹ 保守结 ａｌ.ꎬ ２０１６)及鹰嘴豆基因组中含有 ７０ 个 ＷＲＫＹ 转
构域ꎮ 录因子(Ｗａｑａｓ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１９)ꎮ 本研究通过分析油
２.４ 油棕 ＷＲＫＹ 外显子及内含子 棕基因 组 数 据ꎬ 挖 掘 出 ９５ 个 ＷＲＫＹ 转 录 因 子ꎬ
通过油棕基因组数据分析得到 ＷＲＫＹ 转录因 ＷＲＫＹ 家族中转录因子的数目不仅与物种的基因
子基因 外 显 子 和 内 含 子 的 结 构 分 布 示 意 图 ( 图 组相关ꎬ而且与植物在长期进化过程中所受的外
２)ꎮ ＥｇＷＲＫＹ 转录因子家族成员所含内含子数的 界环境影响有关ꎮ 油棕 ＷＲＫＹ 转录因子数目与其
范围为 ０ ~ １２ 个ꎬ平均每个 ＥｇＷＲＫＹ 含内含子数 他物种相比ꎬ属于中等数目的类型ꎬ该结果可推测
为 ２.９９ 个ꎮ 其中ꎬＥｇＷＲＫＹ４２ 含有内含子数最多 油棕在自然进化过程中ꎬＷＲＫＹ 基因家族受到了

(１２ 个)ꎬ转录因子基因长度变化范围为 ４７７ ｂｐ 一定的外界环境压力ꎮ
(ＥｇＷＲＫＹ０８) 至 ８９ １６７ ｂｐ( ＥｇＷＲＫＹ７１)ꎬ平 均 大 本研究通过预测油棕 ＷＲＫＹ 蛋白的二级结
小为 ５ ９９２ ｂｐꎬ图 ２ 中阴影部分的数字代表该外显 构ꎬ发现其以 α￣螺旋及无规卷曲为主ꎬ这与丁蒙蒙

子 翻 译 成 部 分 ＷＲＫＹ 保 守 结 构 域 的 长 度ꎮ 等(２０１８)报道结果相一致ꎮ 本研究对油棕 ＷＲＫＹ
ＥｇＷＲＫＹ 基因家族的结构变化较大ꎬ说明在长期 保守结构域进行系统进化分析ꎬ将油棕 ＷＲＫＹ 家

进化过程中油棕基因组经历了较大的变异选择ꎮ 族蛋白分为三大类ꎬ即 Ｉ、Ⅱ、Ⅲ类ꎬ其中Ⅱ类又分
为四个亚类ꎮ 本研究中油棕 ９５ 个 ＷＲＫＹ 家族成
３ 讨论与结论 员均含有 ＷＲＫＹＧＱＫ 保守基序ꎬⅡ类均含有 １ 个

锌指结构及 １ 个 ＷＲＫＹ 保守结构域ꎬ根据锌指结
随着高通量测序技术的成熟ꎬＷＲＫＹ 作为调 构和位置的不同又分为四个亚类ꎬ类似分类在拟
控植物多种生理过程的转录因子家族之一ꎬ已在 南芥及 桑 树 等 物 种 中 发 现ꎬ 该 结 果 可 推 测 植 物
多个物种中被挖掘及鉴定ꎬ如拟南芥基因组中含 ＷＲＫＹ 基因家族在结构上具有高度保守性ꎮ 油棕
有 ７２ 个 ＷＲＫＹ 转 录 因 子 ( Ｕｌｋｅｒ ＆ Ｓｏｍｓｓｉｃｈꎬ 作为热带地区重要的油料作物之一ꎬ 低温气候严