Page 25 - 《广西植物》2021年第4期
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࿗ 期 夏铭泽等᧥ 多裂骆驼蓬叶片转录组分析 ጢ ԡ Ꭾ
ᡙʗᔠዞ၊ᅳዞᐹʗᡓᐹɯܦ雷蒙德氏棉ྉ ᤩᅳᡥᡓᔠࣩቂ ʗᐹᔠቂᅳႥʐᔠᔠɯ 和 ྉ图 ጢɯᤥ 其中ᖔ 翻译 ྉ ᡷʢᑕႿ༁ᑕᡷᔽᆍႿ ɯ 和信号传导
大麦ྉ̵ᅳʗʐᓣࣩቂ צࣩᤀᐹʗᓣɯᖔ这些物种与多裂骆驼蓬相 ྉ༁ᔽ੫Ⴟᑕ ᡷʢᑕႿ༁ʛࣼዹᡷᔽᆍႿɯ 获 得 注 释信息最多ᖔ 分别有
似的基因序列共有 Ꭾ ϟऐ 条ᖔ共占 શ 库注释的 ᤃᤃ 条和 ጢँԡ 条ଫ信号分子和相互作用ྉ ༁ᔽ੫ႿᑕᔽႿ੫
ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ 总数的 ϟ Ꭾጢᠮᤥ 其余 ࿗ ሕᎮᠮ 的注释 ቝᆍᔀዹࣼᔀ༁ ᑕႿʛ ᔽႿᡷᔀʢᑕዹᡷᔽᆍႿ ɯ 及 膜运输 ྉቝᔀቝᤦʢᑕႿᔀ
ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ 分布于其他 ጢᤃϟ 个物种中ྉ图 ɯᤥ ᡷʢᑕႿ༁ᡱᆍʢᡷɯ的注释最少ᖔ有 条和 ϟ 条ᤥ
ԣॹ ᤩᓣႥᓣ ᧣Ⴅᡙᅳᤀᅳᡥ 数据库 ІႥᔠᓣႥᓣ 功能分析 所有 注释的代谢通路信息 中ᖔ 共有 ࿗ԡ 个
在 ᥈ᨃ 数据库中比对骆驼蓬转录组 ВႿᔽ੫ᔀႿᔀᖔ ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ 与药物活 性成分合成相关ᤥ 其中ᖔጢϟ 个
有 ሕϟ ऐሕጢ 条 ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ 获得 ϟԡ Ꭾ࿗ऐ 条注释信息ᤥ ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ 参与了萜类骨架生物合成通路ྉጶ᥈᥈ 数
所 有注释信息分为三大类ᖔ 即生物学过程 据库通路 ᧧᧕᧥Ҵᆍԡԡँԡԡɯᖔጢ 个 ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ 参与了单萜
ྉᤦᔽᆍᆍ੫ᔽዹᑕ ᡱʢᆍዹᔀ༁༁ɯܦ细胞组分ྉ ዹᔀࣼᑕʢ ዹᆍቝᡱᆍႿᔀႿᡷɯ 类 生物合成通路 ྉጶ᥈᥈ 数据库通路 ᧧᧕᧥
和分子功能ྉ ቝᆍᔀዹࣼᑕʢ ࣼႿዹᡷᔽᆍႿɯᤥ 所有大类可细 Ҵᆍԡԡँԡɯᖔँ 个 ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ 参与了二萜类生物合成通
分为 ᤃᎮ 个二级分类ᤥ 对 ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ 在二级分类中的 路ྉጶ᥈᥈ 数据库通路 ᧧᧕᧥Ҵᆍԡԡँԡ࿗ɯᖔँ 个 ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ
分布情况进行统计分析ᖔ结果显示细胞ྉ ዹᔀɯ 和细 参与了倍半萜类和三萜类生物合成通路ྉጶ᥈᥈
胞部 分 ྉ ዹᔀ ᡱᑕʢᡷɯ 类型的 ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ 最多ᖔ 分别为 数据库通路 ᧧᧕᧥Ҵᆍԡԡँԡँɯᖔ这些通路均与萜类物质
ሕ ࿗࿗ሕܦሕ ሕँँ 个ᖔ 分别占 ᥈ᨃ 注释信息总数的 合成相关ᤥ 有 ᤃ 个 ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ 参与了苯丙烷类生物
Ꭾሕᤃ࿗ᠮܦ Ꭾሕ ጢԡᠮᤥ 此外ᖔ 细胞过程 ྉ ዹᔀࣼᑕʢ 合成通路ྉጶ᥈᥈ 数据库通路 ᧧᧕᧥Ҵᆍԡԡँ࿗ԡɯᖔ这与
ᡱʢᆍዹᔀ༁༁ɯܦ连接ྉ ᤦᔽႿʛᔽႿ੫ɯܦ细胞器ྉ ᆍʢ੫ᑕႿᔀᔀɯܦ代谢 苯丙素类物质合成相关ᤥ 此外ᖔ还有 ϟሕ 个 ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ
过程ྉቝᔀᡷᑕᤦᆍᔽዹ ᡱʢᆍዹᔀ༁༁ɯ和细胞膜ྉቝᔀቝᤦʢᑕႿᔀɯ类型 参与了黄酮类生物合成通路ྉጶ᥈᥈ 数据库通路
的 ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ 也较多ᖔ 分别有 ϟ ϟጢ࿗ ྉ ᤃᤃ ࿗ጢᠮɯܦ ᧧᧕᧥Ҵᆍԡԡँ࿗ϟɯᖔϟᤃ 个 ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ 参与了易喹啉生物碱
ϟऐ ᎮᎮᤃ ྉ ጢऐ ँऐᠮɯܦ ϟऐ ᤃऐँ ྉ ጢऐ Ꭾϟᠮɯܦ ϟऐ ࿗ᎮᎮ 生物合成通路ྉጶ᥈᥈ 数据库通路 ᧧᧕᧥Ҵᆍԡԡँጢԡɯᖔ
ྉጢऐԡ࿗ᠮɯ 和 ϟԡ ँँँྉሕ࿗ጢጢᠮɯ 条注释信息ᤥ 化学 ሕϟ 个 ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ 参与了泛醌和其他萜类醌生物合成
引 诱剂活 性 ྉ ዹၤᔀቝᆍᑕᡷᡷʢᑕዹᡷᑕႿᡷ ᑕዹᡷᔽᔽᡷᢃ ɯܦ 生物相 通路 ྉጶ᥈᥈ 数据库通路 ᧧᧕᧥ Ҵᆍԡԡϟሕԡ ɯᖔ ϟँ 个
ྉᤦᔽᆍᆍ੫ᔽዹᑕ ᡱၤᑕ༁ᔀ ɯ 和形态发生素 ྉ ቝᆍʢᡱၤᆍ੫ᔀႿ ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ 参 与 了 花生四烯酸类生物合成通路
ᑕዹᡷᔽᔽᡷᢃɯ类型的注释信息较少ྉ图 ሕɯᤥ ྉጶ᥈᥈ 数据库通路 ᧧᧕᧥Ҵᆍԡԡጢँԡɯᤥ
ԣॹጇ ᣞ᧣ᤩ 数据库 ІႥᔠᓣႥᓣ 功能分类 多裂骆驼蓬在干旱生境下仍有较强的适应力
在 ᨃ᥈ 数据库中比对骆驼蓬转录组 ВႿᔽ੫ᔀႿᔀᖔ ྉ刘媖心ᖔϟँँጢɯᤥ 通过转录组数据分析发现ᖔ多裂
结果显示共 ϟᎮ ԡᤃ 条 ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ 获得注释信息ᖔ被分 骆驼蓬叶片转录信息包含有多个脱落酸ྉᑕᤦ༁ዹᔽ༁ᔽዹ
为 ጢ 类ྉ图 ࿗ɯᤥ 其中ᖔ一般功能预测基因ྉ੫ᔀႿᔀʢᑕ ᑕዹᔽʛᖔ ዶାዶɯ 合成相关基因ᖔ 即 Ԯጛۗ ྉ झᔀᑕᑕႿᡷၤᔽႿ
ࣼႿዹᡷᔽᆍႿ ᡱʢᔀʛᔽዹᡷᔽᆍႿ ᆍႿᢃɯܦ翻译后修饰ܦ蛋白质折叠 ᔀᡱᆍᔽʛᑕ༁ᔀɯ基因ܦዛዛ᧣ሕྉᑕᤦ༁ዹᔽ༁ᔽዹ᥋ᑕʛᔀၤᢃʛᔀ ᆍᔽʛᑕ༁ᔀɯ基
和分 子 伴 侣 ྉ ᡱᆍ༁ᡷᡷʢᑕႿ༁ᑕᡷᔽᆍႿᑕ ቝᆍʛᔽᔽዹᑕᡷᔽᆍႿᖔ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ 因和 ۗɔᒦྉᑕᤦ༁ዹᔽ༁ᔽዹ ᑕዹᔽʛ ʢᔀዹᔀᡱᡷᆍʢɯ 基因ᤥ 此外ᖔ还有
ᡷࣼʢႿᆍᔀʢᖔ ዹၤᑕᡱᔀʢᆍႿᔀ༁ ɯܦ 信号传 导 机 制 ྉ༁ᔽ੫Ⴟᑕ 茉莉酸 ྉᢼᑕ༁ቝᆍႿᔽዹ ᑕዹᔽʛᖔ Ȯዶɯ合成相关基因ᖔ即 ᒦ᧣ᣏ
ᡷʢᑕႿ༁ʛࣼዹᡷᔽᆍႿ ቝᔀዹၤᑕႿᔽ༁ቝ༁ɯ 获得注释最多ᖔ 分别有 ྉᔽᡱᆍᢃ੫ᔀႿᑕ༁ᔀɯ基因ܦ௴ᤩዛྉᡷʢᑕႿ༁ዹʢᔽᡱᡷᔽᆍႿ ᑕዹᡷᆍʢɯ基因ܦ
ϟᎮँܦ ԡ࿗ँ 和 ϟ ऐᎮϟ 条ᤥ 细胞活性ྉ ዹᔀ ቝᆍᡷᔽᔽᡷᢃɯ ȣዛቴϟ ྉ ᢼᑕ༁ቝᆍႿᔽዹ ᑕዹᔽʛ᥋ᑕቝᔽႿᆍ ༁ᢃႿᡷၤᔀᡷᑕ༁ᔀ ɯ 基因ܦ ዛ᧣
获得注释最少ᖔ仅 ᤃ 条ྉ图 ࿗ɯᤥ ྉ ၤᢃʛʢᆍᡱᔀʢᆍᔽʛᔀ ʛᔀၤᢃʛʢᑕᡷᑕ༁ᔀ ɯ 基因 和 ᤹ɔࣷ
ԣॹᣤ ᣞጛᤩᤩ 数据库 ІႥᔠᓣႥᓣ 代谢通路分析 ྉᡷʢᑕႿ༁ዹʢᔽᡱᡷᔽᆍႿ ᑕዹᡷᆍʢɯ基因ᤥ 已有研究表明ᖔ脱落酸
使用 ጶ᥈᥈ 数据库对 ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ 序列进行比对 和茉莉酸的合成可以增加植物的抗逆能力ྉ 张春
注释ᖔ代谢通路分析结果显示多裂骆驼蓬转录组 荣等ᖔԡϟጢɯᤥ
中共有 ሕ ऐᎮጢ 个 ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ 获得 Ꭾ ᤃϟᎮ 条代谢通路注 ԣॹ᎒ 多裂骆驼蓬 ІႥᔠᓣႥᓣ 序列单核苷酸多态性检
释信息ᤥ 这些通路信息可分为四大类ᖔ分别为细 测分析
胞进 程 ྉ ዹᔀࣼᑕʢ ᡱʢᆍዹᔀ༁༁ᔀ༁ ɯܦ 环境信息处理 对多裂骆驼蓬 ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ 序列进行检测ᖔ共发现
ྉᔀႿᔽʢᆍႿቝᔀႿᡷᑕ ᔽႿᆍʢቝᑕᡷᔽᆍႿ ᡱʢᆍዹᔀ༁༁ᔽႿ੫ɯܦ遗传信息处 ऐᤃ ϟϟሕ 个单核苷酸多态性ྉ ୩શ۪ᖔ༁ᔽႿ੫ᔀ Ⴟࣼዹᔀᆍᡷᔽʛᔀ
理 ྉ ੫ᔀႿᔀᡷᔽዹ ᔽႿᆍʢቝᑕᡷᔽᆍႿ ᡱʢᆍዹᔀ༁༁ᔽႿ੫ ɯ 和新陈代 谢 ᡱᆍᢃቝᆍʢᡱၤ༁ᔽቝ༁ɯ位点ᤥ 对这些 ୩શ۪ 位点进行类型
ྉቝᔀᡷᑕᤦᆍᔽ༁ቝɯᤥ 这四大类可进一步分为 ሕ 个小类 统计ᖔ结果显示转换突变类型的 ୩શ۪ 有 ጢऐ ࿗ऐᤃ 个
