Page 24 - 《广西植物》2021年第4期

ጢ ԡ ᤃ 广জ 西জ 植জ 物 ࿗ϟ 卷
表 ϓই 多裂骆驼蓬转录组数据拼接结果
ఋᑕᤦ᤟ᔀ ϟজ ዶ༁༁ᔀቝᤦ᤟ᢃ ʢᔀ༁ࣼ᤟ᡷ ᆍ஦ ᡷʢᑕႿ༁ዹʢᔽᡱᡷᆍቝᔀ ʛᑕᡷᑕ ஦ʢᆍቝ ۗᓣ੖ᐹႥࣩቂ ቂࣩᤀᡙᔠ໧ᓣዞᡙࣩቂ

最大长度 最小长度 总长 平均长度
数据类型 数量
ᤠጢԡԡ Ⴟᡷ ᤠϟ ԡԡԡ Ⴟᡷ શ ጢԡ શ ँԡ ᥘᑕ଴ ᤟ᔀႿ੫ᡷၤ ᥘᔽႿ ᤟ᔀႿ੫ᡷၤ ఋᆍᡷᑕ᤟ ᤟ᔀႿ੫ᡷၤ ዶ׹ᔀʢᑕ੫ᔀ ᤟ᔀႿ੫ᡷၤ
᧕ᑕᡷᑕ ᡷᢃᡱᔀ શࣼቝᤦᔀʢ
ྉᤦᡱɯ ྉᤦᡱɯ ྉᤦᡱɯ ྉᤦᡱɯ
ఋʢᑕႿ༁ዹʢᔽᡱᡷ ϟ࿗ऐ ሕϟᎮ Ꭾ࿗ ँϟ࿗ ࿗ϟ ᤃᎮሕ ϟ ԰ጢँ ሕϟँ ऐ ᎮऐᎮ ԰ԡϟ ϟϟᎮ ࿗԰ϟ ࿗ሕँ Ꭾँϟ঎ᤃँ
ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ Ꭾऐ ᤃ࿗ϟ ԰ँ ԡँϟ ϟᤃ ԡᎮϟ ϟ ϟጢ࿗ ԰ᤃԡ ऐ ᎮऐᎮ ԰ԡϟ ጢ԰ ԰ऐँ ँᎮϟ ᤃᤃ࿗঎ँ԰

图 ϟজ 多裂骆驼蓬 ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ 分布图ྉዛɯ与 ऊ᧕୩ 长度分布图ྉଧɯ
èᔽ੫঎ ϟজ ᓂᔀႿ੫ᡷၤ ʛᔽ༁ᡷʢᔽᤦࣼᡷᔽᆍႿ ᆍ஦ ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ ྉዛɯᑕႿʛ ऊ᧕୩ ᆍ஦ ۗᓣ੖ᐹႥࣩቂ ቂࣩᤀᡙᔠ໧ᓣዞᡙࣩቂ ྉଧɯ

并注释基因功能ྉ 表 ԰ɯᤥ 其中ᖔ注释到 શ኏ 数据 表 ԣই ІႥᔠ੖ᓣႥᓣ 注释结果统计
库ܦఋʢጶᥘାᓂ 数据库 和 ᥈ᨃ 数据库的基因数目最 ఋᑕᤦ᤟ᔀ ԰জ ୩ᡷᑕᡷᔽ༁ᡷᔽዹ༁ ᆍ஦ ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ ᑕႿႿᆍᡷᑕᡷᔽᆍႿ ʢᔀ༁ࣼ᤟ᡷ༁
多ᖔ分别有 ሕሕ ϟऐ࿗ܦሕ԰ ऐऐᎮܦሕϟ ऐሕጢ 个ᖔ占总基因数
数据库 基因数量 百分比
目的 ࿗԰঎԰ᠮܦ࿗ϟ঎ऐ԰ᠮܦ࿗ԡ঎࿗ऐᠮଫ注释到 ᣽ጶ᥈᥈ 数据 શࣼቝᤦᔀʢ ᆍ஦ ۪ᔀʢዹᔀႿᡷᑕ੫ᔀ
᧕ᑕᡷᑕᤦᑕ༁ᔀ
ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ༁ ྉᠮɯ
库的基因数目最少ᖔ为 ሕ ऐᎮጢ 个ᖔ仅占总基因数目
的 ԰঎ँᎮᠮᤥ 总体而言ᖔ共有 ሕऐ ጢँऐ 个 ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ 基因 注释到 ऊ᧕᧕ ԰԰ ँϟϟ ԰ँ঎ϟሕ
ዶႿႿᆍᡷᑕᡷᔀʛ ᔽႿ ऊ᧕᧕
经过多数据库比对后成功注释ᖔ仍有 ࿗ԡ ԡ࿗ሕ 个 注释到 ᣽ᨃ᥈ ϟᎮ ԰ԡᤃ ԰ϟ঎ऐऐ
ዶႿႿᆍᡷᑕᡷᔀʛ ᔽႿ ᣽ᨃ᥈
ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ 基因未能获取注释信息ᤥ
注释到 શ኏ ሕሕ ϟऐ࿗ ࿗԰঎԰
ԣॹᇺ ટቴ 数据库 ІႥᔠ੖ᓣႥᓣ 近似物种比对 ዶႿႿᆍᡷᑕᡷᔀʛ ᔽႿ શ኏
将 ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ 与 શ኏ 数据库进行比对ᖔ结果显示 注释到 શఋ ԰ԡ ጢ԰Ꭾ ԰ᤃ঎ϟ
ዶႿႿᆍᡷᑕᡷᔀʛ ᔽႿ શఋ
有 ሕሕ ϟऐ࿗ 个 ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ 获得注释信息ᖔ占 ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ 总 注释到 ۪èዶᥘ ϟᎮ ԡ࿗԰ ԰ϟ঎ᤃᎮ
数的 ࿗԰঎԰ᠮᤥ 通过与 શ኏ 库的比对ᖔ揭示了多裂骆 ዶႿႿᆍᡷᑕᡷᔀʛ ᔽႿ ۪èዶᥘ
注释到 ୩औᔽ༁༁ᡱʢᆍᡷ ԰ऐ Ꭾँᤃ ሕᤃ঎ᤃ԰
驼蓬转录组序列与库中物种的近似情况ᖔ结果显 ዶႿႿᆍᡷᑕᡷᔀʛ ᔽႿ ୩औᔽ༁༁ᡱʢᆍᡷ
注释到 ఋʢጶᥘାᓂ ሕ԰ ऐऐᎮ ࿗ϟ঎ऐ԰
示该物种与甜橙ྉࣷᔠᡙʗࣩ໧ ໧ᔠႥᓣႥ໧ᔠ໧ɯ 的相似序列最多ᖔ
ዶႿႿᆍᡷᑕᡷᔀʛ ᔽႿ ఋʢጶᥘାᓂ
有 Ꭾ ԡᎮऐ 条ᖔ 占 શ኏ 库注释的 ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ 总数的 注释到 ᥈ᨃ ሕϟ ऐሕጢ ࿗ԡ঎࿗ऐ
ዶႿႿᆍᡷᑕᡷᔀʛ ᔽႿ ᥈ᨃ
԰ϟ঎ሕሕᠮଫ其次为克莱门柚ྉ ࣷॹ ዞᤀᓣቂᓣႥᡙᔠႥᐹɯᖔ有࿗ ऐ԰Ꭾ
注释到 ᣽ጶ᥈᥈ ሕऐᎮጢ ࿗঎ँሕ
条ᖔ占 શ኏ 库注释的 ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ 总数的 ϟ࿗঎ ጢጢᠮᤥ 此 ዶႿႿᆍᡷᑕᡷᔀʛ ᔽႿ ᣽ጶ᥈᥈
至少注释到一个数据库 ሕऐ ጢँऐ ࿗ँ঎ԡऐ
外ᖔ部分物种还与多裂骆驼蓬有大量基因序列相 ዶႿႿᆍᡷᑕᡷᔀʛ ᔽႿ ᑕᡷ ᤟ᔀᑕ༁ᡷ ᆍႿᔀ ʛᑕᡷᑕᤦᑕ༁ᔀ༁
类似ᖔ 如可可 ྉ ௴၊ᓣᅳᤇʗᅳቂᐹ ዞᐹዞᐹᅳ ɯܦ 葡萄 ྉ Ⴌᔠᡙᔠ໧ 注释到所有数据库 ԰ሕሕऐ ԰঎ँᎮ
ዶႿႿᆍᡷᑕᡷᔀʛ ᔽႿ ᑕ᤟᤟ ʛᑕᡷᑕᤦᑕ༁ᔀ
צᔠႥᔠஏᓣʗᐹɯܦ 麻疯树 ྉ ȣᐹᡙʗᅳᡓ၊ᐹ ዞࣩʗዞᐹ໧ɯܦ 蓖麻 ྉ ቴᔠዞᔠႥࣩ໧ ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ 总数 Ꭾऐ ᤃ࿗ϟ ϟԡԡ
ዞᅳቂቂࣩႥᔠ໧ɯܦ 枣ྉԮᔠऊᔠᡓ၊ࣩ໧ ᢝࣩᢝࣩᤇᐹɯܦ 毛果杨 ྉۗᅳᡓࣩᤀࣩ໧ ఋᆍᡷᑕ᤟ ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ༁