Page 21 - 《广西植物》2021年第4期
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夏铭泽ᖔ 张雨ᖔ 余静雅ᖔ 等 多裂骆驼蓬叶片转录组分析 ЏȮ 广西植物ᖔ ԡϟᖔ ࿗ϟྉ࿗ɯ᧥ ጢԡሕͱጢϟሕ
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多裂骆驼蓬叶片转录组分析
夏铭泽 ϟᕷ ᕷ 张জ 雨 ϟᕷ ᕷ 余静雅 ϟᕷ ᕷ 张发起 ϟ᥍
ྉϟ 中国科学院西北高原生物研究所 高原生物适应与进化重点实验室ᖔ 西宁 ऐϟԡԡԡϟଫ
中国科学院大学 生命科学学院ᖔ 北京 ϟԡԡԡ࿗ँ ɯ
摘জ 要ᧅ 多裂骆驼蓬为西北荒漠地区常见植物ᖔ具有抗风固沙ܦ防止水土流失ܦ抑菌杀虫和抗肿瘤等功效ᤥ
为了增加骆驼蓬属植物开发利用的强度ᖔ弥补其基因功能ܦ代谢通路等分子生物学研究层面的空缺ᖔ该文利
用 ᧧ࣼቝᔽႿᑕ 高通量测序平台对多裂骆驼蓬叶片进行转录组测序ᖔ根据测序结果进行转录组数据拼接ܦ功能注
释ܦ序列水平和表达水平等分析ᤥ 结果表明᧥共获得 Ꭾ Ꭾሕ ᤃጢሕ ँԡԡ ᤦᡱ 核苷酸序列信息ᖔ拼接组装得到
Ꭾऐ ᤃ࿗ϟ条 ВႿᔽ੫ᔀႿᔀᖔ预测出 ጢጢ ጢሕጢ 条 ऊ᧕୩ 序列ᤥ 与多个数据库对比后ᖔ获得 ሕሕ ϟऐ࿗ 个 શ 数据库注释信息ଫ
ሕϟ ऐሕጢ个 ᥈ᨃ 数据库注释信息ଫϟᎮ ԡᤃ 个 ᨃ᥈ 数据库 ВႿᔽ੫ᔀႿᔀ 功能分类信息ଫᎮ ᤃϟᎮ 个 ጶ᥈᥈ 数据库代谢通
路注释信息ᤥ 对单核苷酸多态性位点和微卫星信息进行检测分析ᖔ共发现 ऐᤃ ϟϟሕ 个 ୩શ۪ 位点ᖔᤃ ँऐᎮ 个 ୩୩
信息ᤥ 该研究首次获得并分析了多裂骆驼蓬的转录组数据ᖔ通过基因比对ܦऊ᧕୩ 预测ܦ通路注释ܦ୩શ۪ 检测
和 ୩୩ 检测等方法ᖔ对该植物的基因ܦ通路以及分子标记等方面有了初步的认识ᖔ为本种植物后续研究及资
源的开发利用奠定了基础ᤥ
关键词ᧅ 多裂骆驼蓬ᖔ 转录组分析ᖔ 基因注释ᖔ୩શ۪ᖔ୩୩
中图分类号ᧅ ͐ँ࿗ሕজ জ 文献标识码ᧅ ዶজ জ 文章编号ᧅ ϟԡԡԡ᥋ሕϟ࿗ྉԡϟɯԡ࿗᥋ԡጢԡሕ᥋ϟϟ
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收稿日期ᧅ ԡԡͱԡͱԡᤃ
基金项目ᧅ 国家自然科学基金ྉሕϟϟϟԡϟԡሕँϟϟɯଫ青海省应用基础研究计划项目ྉԡϟँ᥋ԻȮ᥋Ꭾԡ࿗ɯ Џ ୩ࣼᡱᡱᆍʢᡷᔀʛ ᤦᢃ ᡷၤᔀ શᑕᡷᔽᆍႿᑕ શᑕᡷࣼʢᑕ
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作者简介ᧅ 夏铭泽ྉϟँँ࿗ͱɯᖔ博士研究生ᖔ主要从事植物系统与进化研究ᖔྉጶ᥋ቝᑕᔽɯᔽᑕቝᔽႿ੫झᔀϟᤃ݀ ቝᑕᔽ༁ࣼዹᑕ༁ᑕዹዹႿᤥ
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通信作者ᧅ 张发起ᖔ博士ᖔ副研究员ᖔ主要从事植物多样性研究ᖔྉጶ᥋ቝᑕᔽɯीझၤᑕႿ੫݀ Ⴟऔᔽᡱᤦዹᑕ༁ዹႿᤥ