Page 28 - 《广西植物》2021年第8期

ϟ ԰ ࿗ ԰ 广জ 西জ 植জ 物 ࿗ϟ 卷

জ
ዛ঎ 四种鉴定方法得到的红苞凤梨 ᤟Ⴟዹ኏શዶ 数量ଫ ଧ঎ 红苞凤梨 ᤟Ⴟዹ኏શዶ 不同类型的分布ᤥ
ዛ঎ શࣼቝᤦᔀʢ ᆍ஦ ᤟Ⴟዹ኏શዶ ᆍ஦ ዛႥᐹႥᐹ໧ ዞᅳቂᅳ໧ࣩ໧ ׹ᑕʢ঎ ᤇʗᐹዞᡙᓣᐹᡙࣩ໧ ᆍᤦᡷᑕᔽႿᔀʛ ᤦᢃ ஦ᆍࣼʢ ᔽʛᔀႿᡷᔽ஦ᔽዹᑕᡷᔽᆍႿ ቝᔀᡷၤᆍʛ༁ଫ ଧ঎ ᧕ᔽ༁ᡷʢᔽᤦࣼᡷᔽᆍႿ ᆍ஦ ʛᔽ஦஦ᔀʢᔀႿᡷ ᡷᢃᡱᔀ༁ ᆍ஦ ᤟Ⴟዹ኏શዶ ᆍ஦
ዛႥᐹႥᐹ໧ ዞᅳቂᅳ໧ࣩ໧ ׹ᑕʢ঎ ᤇʗᐹዞᡙᓣᐹᡙࣩ໧ॹ
图 ԰জ ᤟Ⴟዹ኏શዶ 的鉴定及类型分布
èᔽ੫঎ ԰জ ᧧ʛᔀႿᡷᔽ஦ᔽዹᑕᡷᔽᆍႿ ᑕႿʛ ᡷᢃᡱᔀ ʛᔽ༁ᡷʢᔽᤦࣼᡷᔽᆍႿ ᆍ஦ ᤟Ⴟዹ኏શዶ

᤟Ⴟዹ኏શዶ 可能是红苞凤梨嵌合性状形成的关键调控 因ᖔ经过分析预测ᖔጢ ࿗࿗ϟ个 ᤟Ⴟዹ኏શዶ 通过 ዹᔽ༁ 作用
因子ᤥ 方式 预测到靶 基 因ଫᡷʢᑕႿ༁ 作用是指 ᤟Ⴟዹ኏શዶ 与
同一发育时期的全绿和全白叶片差异表达的 ቝ኏શዶ 由于碱基互补配对而产生作用ᖔᓂႿዹఋᑕʢྉ ᓂᔽ
᤟Ⴟዹ኏શዶ 数量和 ቝ኏શዶ 数量见图 ࿗᧥ାᤥ 在未展叶 ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ԰ԡϟጢɯ正是利用 ᤟Ⴟዹ኏શዶ 和 ቝ኏શዶ 之间存在
期ᖔ差异表达 ᤟Ⴟዹ኏શዶ 共 ࿗Ꭾᤃ 个ᖔ其中在全白叶片 的互补配对关系进行预测ᖔ通过计算配对位点自
中上调表达的 ᤟Ⴟዹ኏શዶ ϟँ԰ 个ᖔ占比约 ࿗ԡᠮଫ差异 由能和标准化自由能ᖔ标准化自由能阈值以下的

表达的 ቝ኏શዶ 共ሕ ँϟϟ个ᖔ其中上调表达的 ቝ኏શዶ 则认为是 ᤟Ⴟዹ኏શዶ 的靶基因ᤥ ϟ ጢ࿗࿗个 ᤟Ⴟዹ኏શዶ 通
԰ ϟጢ԰个ᖔ 占比 ጢጢᠮᤥ 在 ࿗ጲጢ 叶期ᖔ 差异表达 过 ᡷʢᑕႿ༁ 方式预测到靶基因ᤥ 靶基因的预测可以帮

᤟Ⴟዹ኏શዶ 共 ሕँᎮ 个ᖔ其中在全白叶片中上调表达的 助理解 ᤟Ⴟዹ኏શዶ 的功能ᖔ揭示 ᤟Ⴟዹ኏શዶ 在红苞凤梨
᤟Ⴟዹ኏શዶ ԰ϟᤃ 个ᖔ占比约 ጢ࿗ᠮଫ差异表达的 ቝ኏શዶ 共 生长发育过程中的调控作用ᤥ
԰ ሕԡԡ个ᖔ其中上调表达的ϟԡሕᤃ个ᖔ占比 ࿗ጢᠮᤥ 在 ԣॹᣤ 红苞凤梨差异表达 ᤀႥዞቴટዛ 靶基因功能注释和
ϟԡ ጲ ϟ԰ 叶期ᖔ差异表达 ᤟Ⴟዹ኏શዶ 共 ጢँ࿗ 个ᖔ其中在 富集分析
全白叶片中上调表达的 ᤟Ⴟዹ኏શዶ ࿗ጢ԰ 个ᖔ 占比约 ԰঎ᤃ঎ϟ 差异表达 ᤟Ⴟዹ኏શዶ 顺式靶基因功能注释和富
Ꭾᤃᠮଫ差异表达的 ቝ኏શዶ 共԰ ϟԡԡ个ᖔ其中上调表达 集分析জ 对差异表达 ᤟Ⴟዹ኏શዶ 的顺式靶基因进行
的 ऐጢᤃ 个ᖔ占比约 ࿗ϟᠮᤥ 可以看出ᖔ随着植株的生 了 ऊᨃ᥈ܦ᥈ᨃܦ᣽ጶ᥈᥈ܦ᣽ᨃ᥈ܦશ኏ 和 ୩औᔽ༁༁᥋۪ʢᆍᡷ 功能富
长ᖔ᤟Ⴟዹ኏શዶ 在全绿植株与全白植株间的差异表达 集分析ᖔ富集分析结果如表 ԰ 所示ᤥ

越发显著ᖔ在全白植株中上调表达的 ᤟Ⴟዹ኏શዶ 显著 ᥈ᨃ 数据库是一个结构化的标准生物学注释
增加ᖔ᤟Ⴟዹ኏શዶ 的差异表达可能在绿ܦ白叶色的差 系统ᖔ在 ᥈ᨃ 分析中ᖔ基因注释在三个层次上ᖔ即生
异形成过程中起着重要的调控作用ᤥ 而这个过程 物过 程 ྉ ᤦᔽᆍ᤟ᆍ੫ᔽዹᑕ᤟ ᡱʢᆍዹᔀ༁༁ɯܦ 分子功能 ྉ ቝᆍ᤟ᔀዹࣼ᤟ᑕʢ
中ᖔ差异表达的 ቝ኏શዶ 数量在减少ᖔ上调表达的基 ஦ࣼႿዹᡷᔽᆍႿɯ和细胞组分ྉ ዹᔀ᤟᤟ࣼ᤟ᑕʢ ዹᆍቝᡱᆍႿᔀႿᡷɯ ྉ 图 ጢɯᤥ
因占比也在减少ᤥ 在未展叶期ᖔ差异表达 ᤟Ⴟዹ኏શዶ 的靶基因主要富集
ԣॹጇ 红苞凤梨 ᤀႥዞቴટዛ 靶基因预测 在生物过程中的生物相ܦ节律过程和移动ᖔ细胞组

᤟Ⴟዹ኏શዶ 调控其靶基因的方式有两种ᖔ分为 ዹᔽ༁ 分方面的细胞外基质和类核ᖔ分子功能方面的营
作用和 ᡷʢᑕႿ༁ 作用ᤥ 根据 ዹᔽ༁ 作用ᖔ我们将 ᤟Ⴟዹ኏શዶ 养库活性ܦ蛋白质结合转录因子活性ܦ鸟苷酸交换
ϟԡԡ Ҵᤦ 范围内的邻近蛋白质编码基因为其靶基 因子活性ᤥ 在 ࿗ጲጢ 叶期ᖔ差异表达 ᤟Ⴟዹ኏શዶ 的靶基