Page 23 - 《广西植物》2021年第8期

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胡豪ᖔ 蔺珍ᖔ 薛彦斌ᖔ 等঎ 基于联合测序分析技术挖掘红苞凤梨 ᤟Ⴟዹ኏શዶ 信息 ЏȮ૒঎ 广西植物ᖔ ԰ԡ԰ϟᖔ ࿗ϟྉऐɯ᧥ ϟ԰ሕᎮͱϟ԰ጢԡ঎
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基于联合测序分析技术挖掘红苞凤梨 ᤀႥዞቴટዛ 信息

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胡জ 豪 ᕷ 蔺জ 珍 ᕷ 薛彦斌 ᕷ 毛美琴 ᕷ 向奕璇 ᕷ
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刘加文 ᕷ 周徐子鑫 ᕷ 马জ 均 ϟᕷ԰᥍
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ྉϟ঎ 四川农业大学 风景园林学院ᖔ 成都 ᤃϟϟϟሕԡଫ ԰঎ 四川农业大学 园林研究所ᖔ 成都 ᤃϟϟϟሕԡ ɯ
摘জ 要ᧅ 为了揭示 ᤟Ⴟዹ኏શዶ 在红苞凤梨嵌合叶片形成和生长发育过程中的调控作用机制ᖔ该文以金边红苞
凤梨为材料ᖔ采用 ̀ᔽ༁ᔀी԰ጢԡԡ 测序和 ୩ᥘ኏ఋ 三代全长转录组测序联合测序分析技术ᖔ分析挖掘红苞凤梨

᤟Ⴟዹ኏શዶ 信息ᤥ 结果表明᧥ྉϟɯ鉴定得到ᤃ ԡϟऐ条 ᤟Ⴟዹ኏શዶᖔ包含 ሕ԰ँऐ 个基因间 ᤟Ⴟዹ኏શዶᖔऐᎮԡ 个反义 ᤟Ⴟዹ኏શዶᖔ
ᎮϟᎮ 个内含子 ᤟Ⴟዹ኏શዶ 和 ϟ ϟԡँ 个正义 ᤟Ⴟዹ኏શዶᖔ数据量较二代测序有了极大的提高ᤥྉ԰ɯ 结构分析表明ᖔ红

苞凤梨 ᤟Ⴟዹ኏શዶ 的总体表达丰度低于 ቝ኏શዶଫ序列长度在 ࿗ԡԡጲ ϟ ԰ԡԡ Ⴟᡷ 区间比例高于 ቝ኏શዶᖔ而在ᢦϟ ᤃԡԡ Ⴟᡷ
区间ᖔ᤟Ⴟዹ኏શዶ 分布的比例显著小于 ቝ኏શዶଫ᤟Ⴟዹ኏શዶ 中的外显子数量总体少于 ቝ኏શዶᖔ开放阅读框长度总体
上也短于 ቝ኏શዶᤥ ྉሕɯ差异表达分析表明ᖔ在全绿ܦ全白叶片发育过程中鉴定到ϟ Ꭾϟԡ个差异表达 ᤟Ⴟዹ኏શዶᤥ
ྉ࿗ɯ靶基因预测结果表明ᖔጢ ࿗࿗ϟ个 ᤟Ⴟዹ኏શዶ 通过 ዹᔽ༁ 作用方式预测到靶基因ᖔϟ ጢ࿗࿗个 ᤟Ⴟዹ኏શዶ 通过 ᡷʢᑕႿ༁ 方式
预测到靶基因ᤥྉጢɯ靶基因的功能注释和富集分析显示ᖔ差异表达 ᤟Ⴟዹ኏શዶ 的靶基因主要作为酶蛋白参与
调节叶片代谢活动和信号转导等方面ᖔ与叶片的颜色形成ܦ光合作用和生长发育密切相关ᤥ 该文鉴定出的
᤟Ⴟዹ኏શዶ 信息以及对其结构和功能的分析ᖔ为红苞凤梨以及凤梨科其他植物的 ᤟Ⴟዹ኏શዶ 表观遗传调控机理研
究提供了数据基础ᖔ筛选出的差异表达 ᤟Ⴟዹ኏શዶ 在金边红苞凤梨叶片嵌合性状的形成和生长发育中具有重

要的调控作用ᤥ
关键词ᧅ 红苞凤梨ᖔ ̀ᔽ༁ᔀी԰ጢԡԡ 测序ᖔ୩ᥘ኏ఋ 全长转录组测序ᖔ ᤟Ⴟዹ኏શዶ 鉴定

中图分类号ᧅ ͐ँ࿗ሕজ জ 文献标识码ᧅ ዶজ জ 文章编号ᧅ ϟԡԡԡ᥋ሕϟ࿗԰ྉ԰ԡ԰ϟɯԡऐ᥋ϟ԰ሕᎮ᥋ϟ࿗

ᤀႥዞቴટዛ ᔠʐᓣႥᡙᔠஏᔠዞᐹᡙᔠᅳႥ ᅳஏ ዛႥᐹႥᐹ໧ ዞᅳቂᅳ໧ࣩ໧

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收稿日期ᧅ ԰ԡ԰ԡͱԡϟͱ԰Ꭾ
基金项目ᧅ 国家自然科学基金ྉሕϟᎮᎮԡᎮ࿗ሕᖔሕϟጢᎮԡᤃँऐɯ Џ ୩ࣼᡱᡱᆍʢᡷᔀʛ ᤦᢃ ᡷၤᔀ શᑕᡷᔽᆍႿᑕ᤟ શᑕᡷࣼʢᑕ᤟ ୩ዹᔽᔀႿዹᔀ èᆍࣼႿʛᑕᡷᔽᆍႿ ᆍ஦ ऊၤᔽႿᑕྉሕϟᎮᎮԡᎮ࿗ሕᖔ
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作者简介ᧅ 胡豪ྉϟँँᤃͱ ɯᖔ硕士研究生ᖔ研究方向为园林植物培育与遗传育种ᖔྉጶ᥋ቝᑕᔽ᤟ɯϟԡँጢϟ࿗԰ᤃ࿗࿗݀ ीी঎ዹᆍቝᤥ
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通信作者ᧅ 马均ᖔ博士ᖔ教授ᖔ研究方向为园林植物培育与遗传育种ᖔྉጶ᥋ቝᑕᔽ᤟ɯᢼࣼႿቝᑕሕᤃጢ݀ ၤᆍᡷቝᑕᔽ᤟঎ዹᆍቝᤥ