Page 45 - 《广西植物》2021年第8期
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ऐ 期                 尹  彦  棚  等  ᧥ 基于 ۪ᑕዹᤦᔽᆍ 第三代测序技术的厚朴基因组测序分析                             ϟ ԰ ጢ ँ
                                                 表 ᇺই 基因家族分类统计
                                          ఋᑕᤦ᤟ᔀ ሕজ ᥈ᔀႿᔀ ஦ᑕቝᔽ᤟ᢃ ዹ᤟ᑕ༁༁ᔽ஦ᔽዹᑕᡷᔽᆍႿ ༁ᡷᑕᡷᔽ༁ᡷᔽዹ༁
                                                             聚类家族分类          总基因家族数目          特有基因家族数目
             物种名                             总基因数目             基因数目
             ୩ᡱᔀዹᔽᔀ༁ Ⴟᑕቝᔀ                  ఋᆍᡷᑕ᤟ ੫ᔀႿᔀ Ⴟࣼቝᤦᔀʢ                   ఋᆍᡷᑕ᤟ ஦ᑕቝᔽ᤟ᢃ     ВႿᔽीࣼᔀ ੫ᔀႿᔀ
                                                            ऊ᤟ࣼ༁ᡷᔀʢ ੫ᔀႿᔀ Ⴟࣼቝᤦᔀʢ  Ⴟࣼቝᤦᔀʢ         ஦ᑕቝᔽ᤟ᢃ Ⴟࣼቝᤦᔀʢ
             无油樟 ዛቂᤇᅳʗᓣᤀᤀᐹ ᡙʗᔠዞ၊ᅳᡓᅳʐᐹ          ϟᤃ ँऐᤃ           ϟጢ ሕ࿗ሕ           ϟϟ ᤃጢϟ            ԰ँԡ
             银杏 ᤩᔠႥҧ੖ᅳ ᤇᔠᤀᅳᤇᐹ                  ሕጢ ँԡጢ           ԰ሕ ࿗ԡጢ           ϟԡ ϟጢሕ           ϟ ऐᎮԡ
             茶树 ࣷᐹቂᓣᤀᤀᔠᐹ ໧ᔠႥᓣႥ໧ᔠ໧              ሕᤃ ँጢϟ           ԰ሕ ԡ࿗ँ           ϟ԰ ᤃᤃϟ           ϟ ԡँϟ
             杨树 ۗᅳᡓࣩᤀࣩ໧ ᡙʗᔠዞ၊ᅳዞᐹʗᡓᐹ            ࿗ϟ ሕሕጢ           ሕሕ ሕ԰࿗           ϟ࿗ ጢሕԡ           ϟ ࿗ԡԡ
             牛樟 ࣷᔠႥႥᐹቂᅳቂࣩቂ ҧᐹႥᓣ၊ᔠʗᐹᓣ           ԰ᤃ ጢሕϟ           ԰԰ ԰࿗԰           ϟ԰ ԰ऐ࿗            ᤃሕᤃ
             水稻 ᧣ʗᡥऊᐹ ໧ᐹᡙᔠצᐹ                   ሕऐ ऐጢ԰           ԰ጢ ጢ࿗ጢ           ϟ԰ Ꭾᤃᤃ           ԰ ϟᎮ԰
             厚朴 ᤹ᐹ੖Ⴅᅳᤀᔠᐹ ᅳஏஏᔠዞᔠႥᐹᤀᔠ໧           ԰ሕ ࿗԰࿗           ԰ԡ ऐԡϟ           ϟ԰ ϟ԰ँ            ጢϟጢ
             拟南芥 ዛʗᐹᤇᔠʐᅳᡓ໧ᔠ໧ ᡙ၊ᐹᤀᔠᐹႥᐹ          ԰Ꭾ ሕᤃँ           ԰ሕ ϟ԰Ꭾ           ϟ԰ ऐԡ࿗            ँँᎮ
             葡萄 Ⴌᔠᡙᔠ໧ צᔠႥᔠஏᓣʗᐹ                 ԰ᤃ ሕ࿗ᤃ           ϟँ ԰Ꭾϟ           ϟ԰ Ꭾ԰ᤃ            Ꭾᤃԡ
























                                                                            图 ᤃজ 物种间进化关系
                                                                    èᔽ੫঎ ᤃজ ጶ׹ᆍ᤟ࣼᡷᔽᆍႿ ʢᔀ᤟ᑕᡷᔽᆍႿ༁ၤᔽᡱ ᑕቝᆍႿ੫ ༁ᡱᔀዹᔽᔀ༁

              ᐹͱᔠ঎ 不同物种জ ᐹ঎ 无油樟ଫ ᤇ঎ 银杏ଫ ዞ঎ 茶树ଫ ʐ঎ 杨树ଫ
              ᓣ঎ 牛樟ଫ ஏ঎ 水稻ଫ ੖঎ 厚朴ଫ ၊঎ 拟南芥ଫ ᔠ঎ 葡萄ᤥ ዛͱጛ঎ 不同
              基因分 类 জ ዛ঎ 未被聚类的基因ଫ ଧ঎ 其他所有的基因ଫ
              ࣷ঎ 特异基因家族中的基因ଫ ᦵ঎ 多拷贝同源基因ଫ ጛॹ 单拷
              贝同源基因ᤥ
              ᐹ ͱ ᔠॹ ᧕ᔽ஦஦ᔀʢᔀႿᡷ ༁ᡱᔀዹᔽᔀ༁ জ  ᐹ঎ ዛቂᤇᅳʗᓣᤀᤀᐹ ᡙʗᔠዞ၊ᅳᡓᅳʐᐹଫ ᤇ঎ ᤩᔠႥҧ੖ᅳ
              ᤇᔠᤀᅳᤇᐹଫ ዞ঎ ࣷᐹቂᓣᤀᤀᔠᐹ ໧ᔠႥᓣႥ໧ᔠ໧ଫ ʐ঎ ۗᅳᡓࣩᤀࣩ໧ ᡙʗᔠዞ၊ᅳዞᐹʗᡓᐹଫ ᓣ঎
              ࣷᔠႥႥᐹቂᅳቂࣩቂ ҧᐹႥᓣ၊ᔠʗᐹᓣଫ ஏॹ ᧣ʗᡥऊᐹ ໧ᐹᡙᔠצᐹଫ ੖঎ ᤹ᐹ੖Ⴅᅳᤀᔠᐹ ᅳஏஏᔠዞᔠႥᐹᤀᔠ໧ଫ
              ၊঎ ዛʗᐹᤇᔠʐᅳᡓ໧ᔠ໧ ᡙ၊ᐹᤀᔠᐹႥᐹଫ ᔠ঎ Ⴌᔠᡙᔠ໧ צᔠႥᔠஏᓣʗᐹ঎ ዛ ͱ ጛ঎ ᧕ᔽ஦஦ᔀʢᔀႿᡷ ੫ᔀႿᔀ
              ዹ᤟ᑕ༁༁ᔽ஦ᔽዹᑕᡷᔽᆍႿজ ዛ঎ ВႿዹ᤟ࣼ༁ᡷᔀʢႿࣼቝ ੫ᔀႿᔀଫ ଧ঎ ᨃᡷၤᔀʢ ੫ᔀႿᔀଫ ࣷ঎ ୩ᡱᔀዹᔽᑕ᤟
              ੫ᔀႿᔀଫ ᦵ঎ ᥘࣼ᤟ᡷዹᆍᡱᢃ ੫ᔀႿᔀଫ ጛॹ ᨃႿᔀዹᆍᡱᢃ ੫ᔀႿᔀ঎
                        图 ጢজ 家族聚类统计直方图
                  èᔽ੫঎ ጢজ èᑕቝᔽ᤟ᢃ ዹ᤟ࣼ༁ᡷᔀʢᔽႿ੫ ༁ᡷᑕᡷᔽ༁ᡷᔽዹᑕ᤟ ၤᔽ༁ᡷᆍ੫ʢᑕቝ

            有利于厚朴的功能基因的进一步发掘和分析ᤥ
                                                                            图 Ꭾজ 物种间分化时间
                 目前ᖔ关于厚朴等药用植物研究较多还是其
                                                                       èᔽ੫঎ Ꭾজ ఋᔽቝᔀ ᆍ஦ ༁ᡱᔀዹᔽᔀ༁ ʛᔽ஦஦ᔀʢᔀႿᡷᔽᑕᡷᔽᆍႿ
            叶绿体基因组ᤥ 由于核基因组包含丰富的遗传信
            息ᖔ所以基因组很大ᖔ组成结构复杂ᖔ且多倍性与                             勇等ᖔ԰ԡϟ࿗ɯᤥ 本研究获得的厚朴全基因组序列是
            高度的重复序列片段也给测序带来很大困难ྉ 陈                             较高质量的序列ᖔ这也是木兰属物种中首个核 ᧕શዶ
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