Page 43 - 《广西植物》2021年第8期
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ऐ 期                 尹  彦  棚  等  ᧥ 基于 ۪ᑕዹᤦᔽᆍ 第三代测序技术的厚朴基因组测序分析                             ϟ ԰ ጢ Ꭾ

































             ዛϟͱІሕ঎ ᥈ᨃ 功能分类ᤥ ዛϟ঎ 胞外区ଫ ଧϟ঎ 细胞ଫ ࣷϟ঎ 拟核ଫ ᦵϟ঎ 细胞膜ଫ ጛϟ঎ 病毒粒子ଫ Þϟ঎ 细胞连接点ଫ ᤩϟ঎ 膜封闭腔ଫ ̵ϟ঎ 高
             分子复合物ଫ ᧇϟ঎ 细胞器ଫ ȣϟ঎ 胞外区部位ଫ ᣞϟ঎ 细胞器部位ଫ ᒦϟ঎ 病毒粒子组成ଫ ᤹ϟ঎ 细胞膜部位ଫ ટϟ঎ 细胞部位ଫ ᧣ϟ঎ 超分子
             复合物ଫ ዛ԰঎ 转录因子活性ᖔ蛋白结合ଫ ଧ԰঎ 核酸结合转录因子活性ଫ ࣷ԰঎ 催化活性ଫ ᦵ԰঎ 信号转导活性ଫ ጛ԰঎ 结构分子活动ଫ
             Þ԰঎ 转运活性ଫ ᤩ԰঎ 结合ଫ ̵԰঎ 电子载体活动ଫ ᧇ԰঎ 抗氧化活性ଫ ȣ԰঎ 金属伴侣蛋白活性ଫ ᣞ԰঎ 蛋白标志物ଫ ᒦ԰঎ 翻译调治活性ଫ
             ᤹԰঎ 营养库活动ଫ ટ԰঎ 分子传感器活动ଫ ᧣԰঎ 分子功能调节器ଫ ዛሕ঎ 生殖ଫ ଧሕ঎ 细胞杀伤ଫ ࣷሕ঎ 免疫系统过程ଫ ᦵሕ঎ 代谢过程ଫ
             ጛሕ঎ 细胞过程ଫ Þሕ঎ 生殖过程ଫ ᤩሕ঎ 生物附着ଫ ̵ሕ঎ 信号转导ଫ ᧇሕ঎ 多细胞生物过程ଫ ȣሕ঎ 发育过程ଫ ᣞሕ঎ 生长ଫ ᒦሕ঎ 运动ଫ ᤹ሕ঎ 单
             一生物过程ଫ ટሕ঎ 生物相ଫ ᧣ሕ঎ 节律过程ଫ ۗሕ঎ 胁迫应答ଫ ͅሕ঎ 定位ଫ ቴሕ঎ 多生物过程ଫ ୒ሕ঎ 生物调控ଫ ௴ሕ঎ 细胞组分或生物合成ଫ
             Іሕ঎ 解毒ᤥ
             ዛϟͱІሕ঎ ᥈ᨃ ஦ࣼႿዹᡷᔽᆍႿ ዹ᤟ᑕ༁༁ᔽ஦ᢃ঎ ዛϟ঎ ጶ଴ᡷʢᑕዹᔀ᤟᤟ࣼ᤟ᑕʢ ʢᔀ੫ᔽᆍႿଫ ଧϟ঎ ऊᔀ᤟᤟ଫ ࣷϟ঎ શࣼዹ᤟ᔀᆍᔽʛଫ ᦵϟ঎ ᥘᔀቝᤦʢᑕႿᔀଫ ጛϟ঎ ჆ᔽʢᔽᆍႿଫ Þϟ঎ ऊᔀ᤟᤟ ᢼࣼႿዹᡷᔽᆍႿଫ ᤩϟ঎
             ᥘᔀቝᤦʢᑕႿᔀ᥋ᔀႿዹ᤟ᆍ༁ᔀʛ ᤟ࣼቝᔀႿଫ ̵ϟ঎ ᥘᑕዹʢᆍቝᆍ᤟ᔀዹࣼ᤟ᑕʢ ዹᆍቝᡱ᤟ᔀ଴ଫ ᧇϟ঎ ᨃʢ੫ᑕႿᔀ᤟᤟ᔀଫ ȣϟ঎ ጶ଴ᡷʢᑕዹᔀ᤟᤟ࣼ᤟ᑕʢ ʢᔀ੫ᔽᆍႿ ᡱᑕʢᡷଫ ᣞϟ঎ ᨃʢ੫ᑕႿᔀ᤟᤟ᔀ ᡱᑕʢᡷଫ ᒦϟ঎ ჆ᔽʢᔽᆍႿ ᡱᑕʢᡷଫ
             ᤹ϟ঎ ᥘᔀቝᤦʢᑕႿᔀ ᡱᑕʢᡷଫ ટϟ঎ ऊᔀ᤟᤟ ᡱᑕʢᡷଫ ᧣ϟ঎ ୩ࣼᡱʢᑕቝᆍ᤟ᔀዹࣼ᤟ᑕʢ ዹᆍቝᡱ᤟ᔀ଴ଫ ዛ԰঎ ఋʢᑕႿ༁ዹʢᔽᡱᡷᔽᆍႿ ஦ᑕዹᡷᆍʢ ᑕዹᡷᔽ׹ᔽᡷᢃᖔ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ ᤦᔽႿʛᔽႿ੫ଫ ଧ԰঎ શࣼዹ᤟ᔀᔽዹ ᑕዹᔽʛ ᤦᔽႿʛᔽႿ੫
             ᡷʢᑕႿ༁ዹʢᔽᡱᡷᔽᆍႿ ஦ᑕዹᡷᆍʢ ᑕዹᡷᔽ׹ᔽᡷᢃଫ ࣷ԰঎ ऊᑕᡷᑕ᤟ᢃᡷᔽዹ ᑕዹᡷᔽ׹ᔽᡷᢃଫ ᦵ԰঎ ୩ᔽ੫Ⴟᑕ᤟ ᡷʢᑕႿ༁ʛࣼዹᔀʢ ᑕዹᡷᔽ׹ᔽᡷᢃଫ ጛ԰঎ ୩ᡷʢࣼዹᡷࣼʢᑕ᤟ ቝᆍ᤟ᔀዹࣼ᤟ᔀ ᑕዹᡷᔽ׹ᔽᡷᢃଫ Þ԰঎ ఋʢᑕႿ༁ᡱᆍʢᡷᔀʢ ᑕዹᡷᔽ׹ᔽᡷᢃଫ
             ᤩ԰঎ ାᔽႿʛᔽႿ੫ଫ ̵԰঎ ጶ᤟ᔀዹᡷʢᆍႿ ዹᑕʢʢᔽᔀʢ ᑕዹᡷᔽ׹ᔽᡷᢃଫ ᧇ԰঎ ዶႿᡷᔽᆍ଴ᔽʛᑕႿᡷ ᑕዹᡷᔽ׹ᔽᡷᢃଫ ȣ԰঎ ᥘᔀᡷᑕ᤟᤟ᆍዹၤᑕᡱᔀʢᆍႿᔀ ᑕዹᡷᔽ׹ᔽᡷᢃଫ ᣞ԰঎ ۪ʢᆍᡷᔀᔽႿ ᡷᑕ੫ଫ ᒦ԰঎ ఋʢᑕႿ༁᤟ᑕᡷᔽᆍႿ ʢᔀ੫ࣼ᤟ᑕᡷᆍʢ
             ᑕዹᡷᔽ׹ᔽᡷᢃଫ ᤹԰঎ શࣼᡷʢᔽᔀႿᡷ ʢᔀ༁ᔀʢ׹ᆍᔽʢ ᑕዹᡷᔽ׹ᔽᡷᢃଫ ટ԰঎ ᥘᆍ᤟ᔀዹࣼ᤟ᑕʢ ᡷʢᑕႿ༁ʛࣼዹᔀʢ ᑕዹᡷᔽ׹ᔽᡷᢃଫ ᧣԰঎ ᥘᆍ᤟ᔀዹࣼ᤟ᑕʢ ஦ࣼႿዹᡷᔽᆍႿ ʢᔀ੫ࣼ᤟ᑕᡷᆍʢଫ ዛሕ঎ ኏ᔀᡱʢᆍʛࣼዹᡷᔽᆍႿଫ ଧሕ঎ ऊᔀ᤟᤟
             Ҵᔽ᤟᤟ᔽႿ੫ଫ ࣷሕ঎ ᧧ቝቝࣼႿᔀ ༁ᢃ༁ᡷᔀቝ ᡱʢᆍዹᔀ༁༁ଫ ᦵሕ঎ ᥘᔀᡷᑕᤦᆍ᤟ᔽዹ ᡱʢᆍዹᔀ༁༁ଫ ጛሕ঎ ऊᔀ᤟᤟ࣼᑕʢ ᡱʢᆍዹᔀ༁༁ଫ Þሕ঎ ኏ᔀᡱʢᆍʛࣼዹᡷᔽ׹ᔀ ᡱʢᆍዹᔀ༁༁ଫ ᤩሕ঎ ାᔽᆍ᤟ᆍ੫ᔽዹᑕ᤟ ᑕʛၤᔀ༁ᔽᆍႿଫ
             ̵ሕ঎ ୩ᔽ੫Ⴟᑕ᤟ᔽႿ੫ଫ ᧇሕ঎ ᥘࣼ᤟ᡷᔽዹᔀ᤟᤟ࣼ᤟ᑕʢ ᆍʢ੫ᑕႿᔽ༁ቝᑕ᤟ ᡱʢᆍዹᔀ༁༁ଫ ȣሕ঎ ᧕ᔀ׹ᔀ᤟ᆍᡱቝᔀႿᡷᑕ᤟ ᡱʢᆍዹᔀ༁༁ଫ ᣞሕ঎ ᥈ʢᆍऔᡷၤଫ ᒦሕ঎ ᓂᆍዹᆍႿᆍᡷᔽᆍႿଫ ᤹ሕ঎ ୩ᔽႿ੫᤟ᔀ᥋ᆍʢ੫ᑕႿᔽ༁ቝ ᡱʢᆍዹᔀ༁༁ଫ
             ટሕ঎ ାᔽᆍ᤟ᆍ੫ᔽዹᑕ᤟ ᡱၤᑕ༁ᔀଫ ᧣ሕ঎ ኏ၤᢃᡷၤቝᔽዹ ᡱʢᆍዹᔀ༁༁ଫ ۗሕ঎ ኏ᔀ༁ᡱᆍႿ༁ᔀ ᡷᆍ ༁ᡷᔽቝࣼ᤟ࣼ༁ଫ ͅሕ঎ ᓂᆍዹᑕ᤟ᔽझᑕᡷᔽᆍႿଫ ቴሕ঎ ᥘࣼ᤟ᡷᔽ᥋ᆍʢ੫ᑕႿᔽ༁ቝ ᡱʢᆍዹᔀ༁༁ଫ ୒ሕ঎ ାᔽᆍ᤟ᆍ੫ᔽዹᑕ᤟
             ʢᔀ੫ࣼ᤟ᑕᡷᔽᆍႿଫ ௴ሕ঎ ऊᔀ᤟᤟ࣼ᤟ᑕʢ ዹᆍቝᡱᆍႿᔀႿᡷ ᆍʢ੫ᑕႿᔽझᑕᡷᔽᆍႿ ᆍʢ ᤦᔽᆍ੫ᔀႿᔀ༁ᔽ༁ଫ Іሕ঎ ᧕ᔀᡷᆍ଴ᔽ஦ᔽዹᑕᡷᔽᆍႿ঎
                                             图 ሕজ ᥈ᨃ 二级节点注释分类统计图
                                      èᔽ੫঎ ሕজ ᥈ᨃ ༁ᔀዹᆍႿʛᑕʢᢃ Ⴟᆍʛᔀ ᑕႿႿᆍᡷᑕᡷᔽᆍႿ ዹ᤟ᑕ༁༁ᔽ஦ᔽዹᑕᡷᔽᆍႿ ዹၤᑕʢᡷ


            白序列进行比较分析ᖔ选择上述 ऐ 个已知基因组                            图中看出两者基因组片段能比对上的片段较少ᖔ
            信息的物种ᖔ构建出遗传进化树ྉ 图 ᤃɯᖔ结果表明                          发现两者基因组存在较大差异ᤥ
            厚朴与牛樟聚为一支ᖔ两者间物种亲缘关系较近ᤥ
            根据物种分化时间分析ྉ 图 Ꭾɯᖔ两者分化时间约                           ሕজ 讨论与结论
            在 ϟ԰԰঎ጢ 百万年前ྉቝᢃᑕɯᤥ 通过绘制出的共线性
            图ྉ图 ऐɯᖔ比较厚朴与牛樟基因组的同源性ᤥ 比                               基因组测序技术和生物信息学技术的进一步
            对结果的共线性图中的每一条线代表同源基因之                              发展ܦ测序成本的降低和分析方法的完善极大地
            间的连线ᖔ没有线条的空白区域代表没有比对上                              推动了厚朴这种非模式药用植物的基因组测序研
            的序列ᖔ代表物种之间存在差别的基因区域ᤥ 从                             究ᤥ 目前常用的测定基因组大小的方法有流式细
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