Page 42 - 《广西植物》2021年第8期
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ϟ ጢ ᤃ 广জ 西জ 植জ 物 ࿗ϟ 卷
表 ԣই 厚朴基因预测结果
ఋᑕᤦᔀ জ ୩ᡷᑕᡷᔽ༁ᡷᔽዹ༁ ᆍ ᤹ᐹႥᅳᤀᔠᐹ ᅳஏஏᔠዞᔠႥᐹᤀᔠ
੫ᔀႿᔀ ᡱʢᔀʛᔽዹᡷᔽᆍႿ ʢᔀ༁ࣼᡷ༁
方法 软件 物种 基因数目
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ዛᤇ ᔠႥᔠᡙᔠᅳ ᥈ᔀႿ༁ዹᑕႿ 厚朴 ᤹ॹ ᅳஏஏᔠዞᔠႥᐹᤀᔠ ሕᤃ ँ࿗
ዶࣼ੫ࣼ༁ᡷࣼ༁ 厚朴 ᤹ॹ ᅳஏஏᔠዞᔠႥᐹᤀᔠ ࿗ሕ ऐϟ࿗
᥈ᔽቝቝᔀʢ̀ᥘᥘ 厚朴 ᤹ॹ ᅳஏஏᔠዞᔠႥᐹᤀᔠ ࿗ ᤃሕँ
᥈ᔀႿᔀ᧧᧕ 厚朴 ᤹ॹ ᅳஏஏᔠዞᔠႥᐹᤀᔠ Ꭾऐ Ꭾᤃँ
୩શዶ۪ 厚朴 ᤹ॹ ᅳஏஏᔠዞᔠႥᐹᤀᔠ ሕ ԡ࿗
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水稻 ᧣ʗᡥऊᐹ ᐹᡙᔠצᐹ ጢ ϟ
向日葵 ̵ᓣᤀᔠᐹႥᡙ၊ࣩ ᐹႥႥࣩࣩ ሕᎮ ሕᎮᤃ
莲 ટᓣᤀࣩቂᤇᅳ Ⴅࣩዞᔠஏᓣʗᐹ Ꭾ ԡϟϟ
ዛͱԮ 不同的字母和颜色代表基因不同的 ᨃ᥈ 功能ᤥ
᧧Ⴟᡷᔀ੫ʢᑕᡷᔽᆍႿ ጶᥘ 厚朴 ᤹ᐹႥᅳᤀᔠᐹ ᅳஏஏᔠዞᔠႥᐹᤀᔠ ሕ ࿗࿗
ዛ શዶ 加工和修饰ଫ ଧ 染色质结构和动力学ଫ ࣷ 能量生
产和转 换ଫ ᦵ 细胞周期调控ᖔ 细胞分裂ᖔ 染色体分配ଫ
ጛ 氨基酸转运和代谢ଫ Þ 核苷酸转运和代谢ଫ ᤩ 碳水化
合物转运和代谢ଫ ̵ 辅酶转运和代谢ଫ ᧇ 脂质转运和代
জজ 通过厚朴基因组 ᥈ᨃ 注释ྉ图 ሕɯᖔ共有 ϟሕ ࿗ሕऐ
谢ଫ ȣ 翻译ᖔ核糖体结构和生物合成ଫ ᣞ 转录ଫ ᒦ 复制ᖔ
个基因具有 ᥈ᨃ 注释功能ᖔ占预测到的总基因数的 重组和 修 复ଫ ᤹ 细胞壁 ᣑ 细胞膜 ᣑ 胞外被膜生物 合 成ଫ
ટ 细胞运动ଫ ᧣ 翻译后修饰ᖔ蛋白质转换ᖔ伴侣ଫ ۗ 无机
ጢᎮ ሕᎮᠮᤥ 功能分布在 ᥥ 细胞 ɼ ྉ ዹᔀɯܦ ᥥ 结合 ɼ
离子转运和代谢ଫ ͅ 次级代谢产物的生物合成ᖔ转运和代
ྉᤦᔽႿʛᔽႿ੫ɯܦᥥ 催化活性ɼ ྉ ዹᑕᡷᑕᢃᡷᔽዹ ᑕዹᡷᔽᔽᡷᢃɯܦᥥ 细胞 谢ଫ ቴ 一般功能预测ଫ 功能未知ଫ ௴ 信号转导机制ଫ
І 胞内运输ᖔ分泌和囊泡运输ଫ Ⴌ 防御机制ଫ ۩ 胞外结
过程ɼ ྉ ዹᔀࣼᑕʢ ᡱʢᆍዹᔀ༁༁ɯܦ ᥥ 代谢过程ɼ ྉ ቝᔀᡷᑕᤦᆍᔽዹ
构ଫ ɔ 细胞核结构ଫ Ԯ 细胞骨架ᤥ
ᡱʢᆍዹᔀ༁༁ɯ等功能的基因占据优势地位ᖔ而在整个分 ዛ ͱ Ԯ ᧕ᔽᔀʢᔀႿᡷ ᔀᡷᡷᔀʢ༁ ᑕႿʛ ዹᆍᆍʢ༁ ʢᔀᡱʢᔀ༁ᔀႿᡷ ʛᔽᔀʢᔀႿᡷ ᨃ᥈
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类中细胞组分占 ሕሕᠮᖔ分子功能占 ϟᠮᖔ生物学过 ऊၤʢᆍቝᑕᡷᔽႿ ༁ᡷʢࣼዹᡷࣼʢᔀ ᑕႿʛ ʛᢃႿᑕቝᔽዹ༁ଫ ࣷ ጶႿᔀʢ੫ᢃ ᡱʢᆍʛࣼዹᡷᔽᆍႿ ᑕႿʛ
ዹᆍႿᔀʢ༁ᔽᆍႿଫ ᦵ ऊᔀ ዹᢃዹᔀ ዹᆍႿᡷʢᆍᖔ ዹᔀ ʛᔽᔽ༁ᔽᆍႿᖔ ዹၤʢᆍቝᆍ༁ᆍቝᔀ
程占 ࿗ጢᠮᤥ 由此可见ᖔ初探到厚朴的基因主要富
ᡱᑕʢᡷᔽᡷᔽᆍႿᔽႿ੫ଫ ጛ ዶቝᔽႿᆍ ᑕዹᔽʛ ᡷʢᑕႿ༁ᡱᆍʢᡷ ᑕႿʛ ቝᔀᡷᑕᤦᆍᔽ༁ቝଫ Þ
集在生物学过程中的代谢过程ᤥ શࣼዹᔀᆍᡷᔽʛᔀ ᡷʢᑕႿ༁ᡱᆍʢᡷ ᑕႿʛ ቝᔀᡷᑕᤦᆍᔽ༁ቝଫ ᤩ ऊᑕʢᤦᆍၤᢃʛʢᑕᡷᔀ ᡷʢᑕႿ༁ᡱᆍʢᡷ
ᑕႿʛ ቝᔀᡷᑕᤦᆍᔽ༁ቝଫ ̵ ऊᆍᔀႿझᢃቝᔀ ᡷʢᑕႿ༁ᡱᆍʢᡷ ᑕႿʛ ቝᔀᡷᑕᤦᆍᔽ༁ቝଫ ᧇ ᓂᔽᡱᔽʛ
通过 ጶ᥈᥈ 通路注释ྉ 图 ࿗ɯᖔ对厚朴的 ऐ ጢሕ ᡷʢᑕႿ༁ᡱᆍʢᡷ ᑕႿʛ ቝᔀᡷᑕᤦᆍᔽ༁ቝଫ ȣ ఋʢᑕႿ༁ᑕᡷᔽᆍႿᖔ ʢᔽᤦᆍ༁ᆍቝᑕ ༁ᡷʢࣼዹᡷࣼʢᔀ ᑕႿʛ
个基因进行了通路注释ᖔ占预测到的总基因数的 ᤦᔽᆍ੫ᔀႿᔀ༁ᔽ༁ଫ ᣞ ఋʢᑕႿ༁ዹʢᔽᡱᡷᔽᆍႿଫ ᒦ ᔀᡱᔽዹᑕᡷᔽᆍႿᖔ ʢᔀዹᆍቝᤦᔽႿᑕᡷᔽᆍႿ ᑕႿʛ
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ሕጢሕᠮᤥ 其注释结果分别为 ጢ࿗ԡᠮ的ᥥ细胞过程ɼ ቝᆍᡷᔽᔽᡷᢃଫ ᧣ ۪ᆍ༁ᡷᡷʢᑕႿ༁ᑕᡷᔽᆍႿᑕ ቝᆍʛᔽᔽዹᑕᡷᔽᆍႿᖔ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ ᡷࣼʢႿᆍᔀʢᖔ
ዹၤᑕᡱᔀʢᆍႿᔀ༁ଫ ۗ ᧧Ⴟᆍʢ੫ᑕႿᔽዹ ᔽᆍႿ ᡷʢᑕႿ༁ᡱᆍʢᡷ ᑕႿʛ ቝᔀᡷᑕᤦᆍᔽ༁ቝଫ ͅ
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ྉᔀႿᔽʢᆍႿቝᔀႿᡷᑕ ᔽႿᆍʢቝᑕᡷᔽᆍႿ ᡱʢᆍዹᔀ༁༁ᔽႿ੫ɯܦ ँ ऐጢᠮ 的 ቴ ᥈ᔀႿᔀʢᑕ ࣼႿዹᡷᔽᆍႿ ᡱʢᔀʛᔽዹᡷᔽᆍႿ ᆍႿᢃଫ èࣼႿዹᡷᔽᆍႿ ࣼႿҴႿᆍऔႿଫ
௴ ୩ᔽ੫Ⴟᑕ ᡷʢᑕႿ༁ʛࣼዹᡷᔽᆍႿ ቝᔀዹၤᑕႿᔽ༁ቝ༁ଫ І ᧧Ⴟᡷʢᑕዹᔀࣼᑕʢ ᡷʢᑕᔽዹҴᔽႿ੫ᖔ
ᥥ遗传信息处理ɼ ྉ ੫ᔀႿᔀᡷᔽዹ ᔽႿᆍʢቝᑕᡷᔽᆍႿ ᡱʢᆍዹᔀ༁༁ᔽႿ੫ɯܦ ༁ᔀዹʢᔀᡷᔽᆍႿᖔ ᑕႿʛ ᔀ༁ᔽዹࣼᑕʢ ᡷʢᑕႿ༁ᡱᆍʢᡷଫ Ⴌ ᧕ᔀᔀႿ༁ᔀ ቝᔀዹၤᑕႿᔽ༁ቝ༁ଫ
ጢጢԡँᠮ的ᥥ代谢ɼ ྉ ቝᔀᡷᑕᤦᆍᔽ༁ቝɯܦጢϟᤃᠮ的ᥥ 机体系 ۩ ጶᡷʢᑕዹᔀࣼᑕʢ ༁ᡷʢࣼዹᡷࣼʢᔀ༁ଫ ɔ શࣼዹᔀᑕʢ ༁ᡷʢࣼዹᡷࣼʢᔀଫ Ԯ
ऊᢃᡷᆍ༁ҴᔀᔀᡷᆍႿ
统ɼྉᆍʢ੫ᑕႿᔽ༁ቝᑕ ༁ᢃ༁ᡷᔀቝ༁ɯᤥ 通过 ጶ᥈᥈ 的通路注释
图 জ ᨃ᥈ 功能注释分类统计图
进一步了解厚朴基因在生物学过程上的功能ᖔ其
èᔽ੫ জ ᨃ᥈ ࣼႿዹᡷᔽᆍႿ ᑕႿႿᆍᡷᑕᡷᔽᆍႿ ዹᑕ༁༁ᔽᔽዹᑕᡷᔽᆍႿ ዹၤᑕʢᡷ
中参与代谢通路上的基因占主要地位ᖔ淀粉和蔗
糖代谢ྉҴᆍԡԡጢԡԡɯܦ氨基酸的生物合成ྉ Ҵᆍԡϟሕԡɯ 预测得到的 ሕ ࿗࿗ 个基因中有 ԡ ऐԡϟ 个基因可
及碳代谢ྉҴᆍԡϟԡԡɯ为主要的代谢通路ᤥ 以分类到 ϟ ϟँ 个家族ᖔ其中有 ጢϟጢ 个基因家族
ԣॹጇ 比较基因组学分析 是厚朴所特有的ᖔ 蛋白预测分类结果见图 ጢ 和
通过对厚朴与葡萄ܦ拟南芥ܦ 水稻ܦ 杨树ܦ 银
表 ሕᤥ
杏ܦ无油樟ܦ茶树及牛樟的蛋白序列比对ᖔ发现在 为进一步确定厚朴的种属关系ᖔ 以单拷贝蛋
