Page 88 - 《广西植物》2022年第10期
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１ ７ ０ ６ 广 西 植 物 ４２ 卷
表 １ 天台鹅耳枥分布地的基本概况
Ｔａｂｌｅ １ Ｂａｓｉｃ ｃｏｎｄｉｔｉｏｎｓ ｏｆ ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ ｒｅｇｉｏｎｓ ｏｆ Ｃａｒｐｉｎｕｓ ｔｉｅｎｔａｉｅｎｓｉｓ
采集编号 样本量 分布地区 经纬度 海拔高度 样本编号
Ｃｏｌｌｅｃｔｉｎｇ ｎｕｍｂｅｒ Ｓａｍｐｌｅ ｓｉｚｅ Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ ｒｅｇｉｏｎ Ｌａｔｉｔｕｄｅ ａｎｄ ｌｏｎｇｉｔｕｄｅ Ａｌｔｉｔｕｄｅ (ｍ) Ｓａｍｐｌｅ ＩＤ
ＪＳＴ １０ 景宁县上山头 １１９°３７′ Ｅꎬ２７°４６′ Ｎ １ ５２０ ＪＳＴ＿１ ~ １０
Ｓｈａｎｇｓｈａｎｔｏｕꎬ Ｊｉｎｇｎｉｎｇ Ｃｏｕｎｔｙ
ＰＤＳ ３ 磐安县大盘山 １２０°３１′ Ｅꎬ２８°５８′ Ｎ １ １３０ ＰＤＳ＿１ ~ ３
Ｄａｐａｎ Ｍｏｕｎｔａｉｎꎬ Ｐａｎ’ａｎ Ｃｏｕｎｔｙ
ＰＧＳ １ 磐安县高姥山 １２０°３２′ Ｅꎬ ２８°５４′ Ｎ １ １４０ ＰＧＳ＿１
Ｇａｏｍｕ Ｍｏｕｎｔａｉｎꎬ Ｐａｎ’ａｎ Ｃｏｕｎｔｙ
ＰＱＪ １ 磐安县青明尖 １２０°２８′ Ｅꎬ２８°４９′ Ｎ １ ２００ ＰＱＪ＿１
Ｑｉｎｇｍｉｎｇｊｉａｎꎬ Ｐａｎ’ａｎ Ｃｏｕｎｔｙ
ＱＹＨ １ 青田县仰天湖 １１９°５９′ Ｅꎬ２８°１２′ Ｎ １ ２４６ ＱＹＨ＿１
Ｙａｎｇｔｉａｎｈｕꎬ Ｑｉｎｇｔｉａｎ Ｃｏｕｎｔｙ
ＴＨＳ １０ 天台县华顶山 １２１°０５′ Ｅꎬ２９°１５′ Ｎ ８９０ ~ １ ０００ ＴＨＳ＿１ ~ １０
Ｈｕａｄｉｎｇ Ｍｏｕｎｔａｉｎꎬ Ｔｉａｎｔａｉ Ｃｏｕｎｔｙ
整的 ｃｐＤＮＡꎮ 天台鹅耳枥完整 ｃｐＤＮＡ 由四部分 表 ２ 天台鹅耳枥 ｃｐＤＮＡ 特征
组成ꎬ与鹅耳枥属( Ｃａｒｐｉｎｕｓ) 其他植物相似( 杨霄 Ｔａｂｌｅ ２ Ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ ｏｆ ｃｐＤＮＡ ｏｆ Ｃａｒｐｉｎｕｓ ｔｉｅｎｔａｉｅｎｓｉｓ
月ꎬ２０１９ꎻ 赵 儒 楠 等ꎬ ２０２１ )ꎮ 长 度 为 １５９ ２８１ ~ 基因组特征 值
Ｇｅｎｏｍｅ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃ Ｖａｌｕｅ
１５９ ８４１ ｂｐꎬ平均为 １５９ ６１６.２ ｂｐꎬ每个 ｃｐＤＮＡ 由 １
个大单拷贝区( ＬＳＣ) (８８ ３６０ ~ ８８ ７１１ ｂｐꎬ平均为 基因组大小 Ｇｅｎｏｍｅ ｓｉｚｅ (ｂｐ) １５９ ６１６.２
８８ ５２２.３５ ｂｐ)和 １ 个小单拷贝区( ＳＳＣ) (１８ ４２０ ~ 大单拷贝区长度 ＬＳＣ ｌｅｎｇｔｈ (ｂｐ) ８８ ５２２.３５
１８ ７９４ ｂｐꎬ平均为１８ ６３４.９２ ｂｐ)组成ꎬ并由 １ 对反 小单拷贝区长度 ＳＳＣ ｌｅｎｇｔｈ (ｂｐ) １８ ６３４.９２
向重复 序 列 ( ＩＲ) 隔 开 ( 每 个 ＩＲ ２６ ０６７ ~ ２６ ４５１ 反向重复序列长度 ＩＲ ｌｅｎｇｔｈ (ｂｐ) ５２ ４５８.９２
蛋白质编码基因数量 ８６
ｂｐꎬ平均为２６ ２２９.４６ ｂｐ)(表 ２ꎬ图 １)ꎮ
Ｐｒｏｔｅｉｎ￣ｃｏｄｉｎｇ ｇｅｎｅ ｎｕｍｂｅｒ
经过数 据 过 滤 后ꎬ Ｑ２０ 质 量 评 分 ( ９６. ４６％ ~
ｔＲＮＡ 基因数量 ｔＲＮＡ ｇｅｎｅ ｎｕｍｂｅｒ ３７
９７.２１％) 平均 ９６. ９８％ꎬ Ｑ３０ 质 量 评 分 ( ９０. ８１％ ~
ｒＲＮＡ 基因数量 ｒＲＮＡ ｇｅｎｅ ｎｕｍｂｅｒ ８
９２.４６％)平均 ９１. ９４％ꎮ 基于叶绿体的统计ꎬ总体
基因数 Ｇｅｎｅ ｎｕｍｂｅｒ １３１
ＧＣ 含量平均为 ３６.４１％ꎬＬＳＣ、ＳＳＣ、ＩＲ 对应值分别为
ＧＣ 含量 ＧＣ ｃｏｎｔｅｎｔ (％) ３６.４１
３４.２０％、３０.０９％、４２.３７％ꎬＩＲ 区域的 ＧＣ 含量高于
ＬＳＣ、ＳＳＣ 区域ꎮ ｃｐＤＮＡ 的 １３１ 个基因中ꎬ包含 ８６
个蛋白编码基因、３７ 个 ｔＲＮＡ 基因和 ８ 个 ｒＲＮＡ 基 中检测到正向重复平均 ３２ 个、回文重复 ２５ 个、反
因ꎮ 其中:ＬＳＣ 区域包含 ６０ 个蛋白质编码和 ２２ 个 转重复 ２２ 个(图 ２)ꎬ这些重复中的大多数表现出
ｔＲＮＡ 基因ꎻ ＳＳＣ 区域包含 １２ 个蛋白质编码和 １ 个 １０ 到 ３８ ｂｐ 之间的长度ꎮ 简单重复序列( ＳＳＲ) 广
ｔＲＮＡ 基因ꎻＩＲ 区域有 ７ 个蛋白质编码ꎬ７ 个 ｔＲＮＡ 泛分布于 ｃｐＤＮＡ 中ꎬ包含长度为 １ ~ ６ ｂｐ 重复序列
和所有 ４ 个 ｒＲＮＡ 基因重复(表 ２ꎬ图 １)ꎮ 的短串联重复ꎬｃｐＤＮＡ 中的这种短串联重复是从
２.２ ｃｐＤＮＡ 的重复序列分析 单亲遗传过来的ꎬＳＳＲ 在基因组重组和重排中发
滑动链的不匹配和重复序列的不适当重组可 挥重要作用ꎬ在群体遗传和进化研究中ꎬ常被用作
能 导 致 序 列 变 异 和 ＤＮＡ 重 排 ( Ｗｉｃｋｅ ｅｔ ａｌ.ꎬ 有效的分子标记(Ｚｈｏｕ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１８)ꎮ 基于 ＳＳＲ 位
２０１１)ꎮ 重复序列是重要的遗传标记ꎬ和物种的起 于叶绿体区段类型的数量统计ꎬ天台鹅耳枥蛋白
源进化息息相关ꎮ 重复序列一般可分为散在重复 编码基因平均为 ４８ 个基因、ｔＲＮＡ 为 ３ 个基因、非
和简单重复ꎮ 编码区为 ４１ 个基因ꎮ 其中ꎬ蛋白编码基因中 ６ 个
散在重复使用 Ｒｅｐｕｔｅｒ 软件分析ꎬ这里我们用
基因( ｍａｔＫ、ａｔｐＡ、ｒｐｏＢ、ａｔｐＢ、ｃｅｍＡ、ｒｐｌ２) 具有 １ 个
ｃｐＬＴＲ 长末端重复序列表示ꎮ 在天台鹅耳枥ｃｐＤＮＡ
串联重复ꎬ１ 个 ｒｐｏＣ２ 基因具有 ４ 个串联重复ꎬ１ 个
