Page 57 - 《广西植物》2022年第12期

１２ 期 姚新转等: 茶树 ＴＩＦＹ 基因家族鉴定及非生物胁迫下表达分析 ２ ０ ４ ７

表 １ ＴＩＦＹ 基因 ＲＴ￣ｑＰＣＲ 引物序列
Ｔａｂｌｅ １ Ｐｒｉｍｅｒ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ ＴＩＦＹ ｇｅｎｅｓ ｆｏｒ ＲＴ￣ｑＰＣＲ
基因名称 上游引物 (５′￣３′) 下游引物 (５′￣３′)
Ｇｅｎｅ ｎａｍｅ Ｆｏｒｗａｒｄ ｐｒｉｍｅｒ (５′￣３′) Ｒｅｖｅｒｓｅ ｐｒｉｍｅｒ (５′￣３′)
ＣｓＴＩＦＹ１ ＣＡＡＣＣＣＡＴＴＧＣＴＡＣＣＧＡＴＣＴＡＣ ＧＡＧＧＡＧＡＡＧＴＴＧＡＧＣＴＧＣＴＴＡＴＴ
ＣｓＴＩＦＹ２ ＧＴＣＴＧＡＴＣＣＣＴＴＴＧＣＴＴＣＴＴＣＴ ＧＡＧＴＧＣＣＡＣＣＴＴＧＴＣＣＡＴＴＡＴ
ＣｓＴＩＦＹ１８ ＣＣＡＧＡＴＣＧＡＡＧＡＣＧＡＡＧＡＡＧＡＣ ＣＡＡＡＧＣＡＴＧＣＧＧＡＴＧＡＡＣＡＣ
ＣｓＴＩＦＹ６ ＧＡＧＡＣＣＣＧＡＡＡＣＣＡＣＡＡＧＡＡ ＴＧＣＴＧＡＧＧＡＡＡＧＡＧＡＴＣＣＡＴＡＡＧ
ＣｓＴＩＦＹ１１ ＴＧＣＡＣＴＣＴＣＴＴＣＡＡＣＣＧＡＴＡＡＧ ＴＣＣＡＴＡＡＧＧＣＧＡＣＡＣＧＡＡＡＧ
ＣｓＴＩＦＹ１５ ＣＴＴＧＧＧＡＧＧＧＣＧＡＧＡＡＡＴＡＣ ＡＣＴＴＧＡＧＧＣＡＣＣＡＣＣＴＡＡＡＣ
ＣｓＴＩＦＹ８ ＣＧＡＡＣＡＡＧＧＣＡＧＡＴＧＴＧＡＴＡＡＴＧ ＣＴＣＣＡＣＴＣＧＧＴＡＴＧＴＡＧＣＴＴＴＣ
ＧＡＰＤＨ ＴＴＧＧＣＡＴＣＧＴＴＧＡＧＧＧＴＣＴ ＣＡＧＴＧＧＧＡＡＣＡＣＧＧＡＡＡＧＣ

表 ２ 茶树 ＴＩＦＹ 基因家族基本信息
Ｔａｂｌｅ ２ Ｂａｓｉｃ ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ ｏｆ ＴＩＦＹ ｇｅｎｅ ｆａｍｉｌｙ ｉｎ Ｃａｍｅｌｌｉａ ｓｉｎｅｎｓｉｓ

蛋白长度 分子量
基因名称 基因编号 染色体 外显子数目 等电点
Ｐｒｏｔｅｉｎ ｌｅｎｇｔｈ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｗｅｉｇｈｔ
Ｇｅｎｅ ｎａｍｅ Ｇｅｎｅ ｎｕｍｂｅｒ Ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ Ｎｕｍｂｅｒ ｏｆ ｅｘｏｎｓ Ｉｓｏｅｌｅｃｔｒｉｃ ｐｏｉｎｔ
(ａａ) (Ｄａ)
ＣｓＴＩＦＹ１ ＣＳＳ００３１９０５.１ Ｃｈｒ２ ５ ２９５ ３１ ５３１.１ １０.０８
ＣｓＴＩＦＹ２ ＣＳＳ００２２０５３.１ Ｃｈｒ１２ ７ ３９９ ４１ ５０１.３ ８.２５
ＣｓＴＩＦＹ３ ＣＳＳ００１２５１４.３ Ｃｈｒ１２ ７ ３９９ ４１ ５００.３ ８.４９
ＣｓＴＩＦＹ４ ＣＳＳ００３１６２０.２ Ｃｈｒ１３ ９ ３３６ ３７ ３３４.７ ８.８４
ＣｓＴＩＦＹ５ ＣＳＳ００１１０１９.１ Ｃｈｒ３ ５ ２６２ ２９ ２６６.８ ９.１１
ＣｓＴＩＦＹ６ ＣＳＳ００１０５１０.１ Ｃｈｒ１５ ５ ２３４ ２５ ５０６.６ １０.２３
ＣｓＴＩＦＹ７ ＣＳＳ００２８１８８.１ Ｃｈｒ８ ３ １３７ １５ ６０４.９ １０.４５
ＣｓＴＩＦＹ８ ＣＳＳ００００５６８.１ Ｃｏｎｔｉｇ６０５ ３ １３０ １３ ９１４.２ ４.４５
ＣｓＴＩＦＹ９ ＣＳＳ００５０４４９.１ Ｃｈｒ１５ ７ ３０４ ３３ ４９６.６ ６.６７
ＣｓＴＩＦＹ１０ ＣＳＳ００３７１００.１ Ｃｈｒ１５ ７ ３０４ ３３ ４８３.６ ６.６７
ＣｓＴＩＦＹ１１ ＣＳＳ００３４４３０.１ Ｃｈｒ６ ６ ２１８ ２４ ０３９.８ ９.６２
ＣｓＴＩＦＹ１２ ＣＳＳ００１７５０５.２ Ｃｈｒ３ ７ ３２４ ３４ ４６９ ４.９８
ＣｓＴＩＦＹ１３ ＣＳＳ０００３０４７.１ Ｃｈｒ９ ７ ２８２ ３０ ９６４.１ ６.０４
ＣｓＴＩＦＹ１４ ＣＳＳ０００４２６１.１ Ｃｏｎｔｉｇ５０９ ７ ３２６ ３４ ６５７.２ ４.９８
ＣｓＴＩＦＹ１５ ＣＳＳ００４５０６１.１ Ｃｏｎｔｉｇ５０９ １１ ３６３ ３９ ３２５.５ ４.６７
ＣｓＴＩＦＹ１６ ＣＳＳ００５０４２７.１ Ｃｏｎｔｉｇ９６９ １０ ３６４ ３９ ４６６.１ ４.４８
ＣｓＴＩＦＹ１７ ＣＳＳ００１６８０２.１ Ｃｈｒ９ １１ ３７７ ４１ ２２３.３ ４.５６
ＣｓＴＩＦＹ１８ ＣＳＳ００１７１８４.１ Ｃｈｒ１３ ２ １１６ １２ ２６１.３ ３.７５
ＣｓＴＩＦＹ１９ ＣＳＳ００３６２４５.１ Ｃｈｒ３ ２ １１５ １２ ０９５.４ ３.７９

与拟南芥 ＡｔＴＩＦＹ４ａ 亲缘关系较远ꎻＴＩＦＹ 亚蛋白家 ２.３ 茶树 ＴＩＦＹ 基因的功能结构域及结构序列分析
族包含 ＣｓＴＩＦＹ１５ 和 ＣｓＴＩＦＹ１９ꎻＺＭＬ 亚家族由 ４ 个 使用氨基酸进行了系统发育分析这里鉴定出
物种构成ꎬ共计 ２０ 个成员ꎻ剩余其他蛋白序列分 １９ 个茶树 ＴＩＦＹ 基因序列( 图 ２)ꎮ 使用来自 ４ 种

属 ＪＡＺ 亚蛋白家族ꎬ可分为以下 ５ 个类群( ＪＡＺⅠ、 植物的 ＴＩＦＹ 序列构建系统发育树( 图 １)ꎬ同一个
ＪＡＺⅡ、ＪＡＺⅢ、ＪＡＺ ＩＶ、ＪＡＺ Ｖ)ꎬ其中 ＪＡＺⅠ 含有最 家族的 ＴＩＦＹ 蛋 白 倾 向 于 聚 类ꎬ２ 个 例 外 是 蛋 白
多的 ＴＩＦＹ 序 列ꎬ 占 比 为 １６ / ３７ꎬ ＪＡＺ ＩＶ 仅 包 含 ＣｓＴＩＦＹ４ 和 ＣｓＴＩＦＹ８ 单独聚为一枝( 图 ２:Ａ)ꎮ 利
ＡｔＴＩＦＹ 与 ＣｓＴＩＦＹ 序列ꎬ共计 ３ 个ꎻＪＡＺ Ｖ 不包含 用 ＭＥＭＥ 软件对茶树 ＴＩＦＹ 保守基序组成和保守

ＣｓＴＩＦＹ(图 １)ꎮ 基序数目进行分析ꎬ共鉴别到 １０ 个保守基序ꎬ依