Page 58 - 《广西植物》2022年第12期
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２ ０ ４ ８ 广 西 植 物 ４２ 卷
图 １ 茶树、葡萄、毛果杨和拟南芥的 ＴＩＦＹ 基因家族系统发育树及其分类(Ｂｏｏｔｓｔｒａｐ 重复数为 １ ０００ 次)
Ｆｉｇ. １ Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ＴＩＦＹ ｇｅｎｅ ｆａｍｉｌｙ ｆｒｏｍ Ｃａｍｅｌｌｉａ ｓｉｎｅｎｓｉｓꎬ Ｖｉｔｉｓ ｖｉｎｉｆｅｒａꎬ
Ｐｏｐｕｌｕｓ ｔｒｉｃｈｏｃａｒｐａꎬ Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ ｔｈａｌｉａｎａ (Ｂｏｏｔｓｔｒａｐ ｒｅｐｅａｔｓ １ ０００ ｔｉｍｅｓ)
次 命 名 为 ｍｏｔｉｆ １ ~ ｍｏｔｉｆ １０ꎬ 只 有 ＣｓＴＩＦＹ８ 包 含 的氨基酸数量从 １１５ 到 ３９９ 不等(表 １)ꎬ但聚集在
ｍｏｔｉｆ ２(图 ２:Ｂ)ꎬ说明 ＴＩＦＹ 基因家族在进化过程 一起的蛋白质往往包含相同数量的氨基酸ꎮ 氨基
中基序比较保守ꎮ 相反是外显子 / 内含子结构也 酸和保守结构域的类似分布ꎬ这与外显子 / 内含子
可用于提供其他证据来支持系统发育分组(Ｓｈｉｕ ＆ 结构分析一致ꎮ
Ｂｌｅｅｃｋｅｒꎬ ２００３)ꎬ因为这种类型的差异通常在基因 ２.４ 茶树 ＣｓＴＩＦＹ 基因染色体定位
家族的进化中起关键作用ꎮ 因此ꎬ了解茶树 ＴＩＦＹ １９ 个茶树 ＣｓＴＩＦＹｓ 基因分别分布在茶树的 ８ 条
基因的外显子 / 内含子结构( 图 ２:Ｃ)ꎬ以进一步了 染色体上ꎬ分别是染色体 ２、３、６、８、９、１２、１３ 和 １５ꎮ
解它们可能的基因结构进化ꎮ 我们的结果表明它 分析出 ＣｓＴＩＦＹ 基因同源基因簇 ４ 组ꎬ分别为位于 ３
们的系统发育与外显子 / 内含子之间有很强的相 号染色体上的 ＣｓＴＩＦＹ１２ 和 ＣｓＴＩＦＹ１９ꎬ位于 ９ 号染
关性结构ꎬ并且聚在一起的基因通常拥有一个类 色体上的 ＣｓＴＩＦＹ１３ 和 ＣｓＴＩＦＹ１７ꎬ位于 １２ 号染色体
似的基因结构ꎮ 实际上ꎬ３ 组基因( ＴＩＦＹ２ / ＴＩＦＹ３、 上的 ＣｓＴＩＦＹ２ 和 ＣｓＴＩＦＹ３ꎬ位于 １５ 号染色体上的
ＴＩＦＹ１２ 和 ＴＩＦＹ１４) 包含完全相同数量的外显子ꎬ ＣｓＴＩＦＹ９ 和 ＣｓＴＩＦＹ１０ꎬ 其 中 还 有 一 对 同 源 基 因
几乎完全相同的外显子长度( 图 ２:Ｃ)ꎬ表明这些 ＣｓＴＩＦＹ１４ 和 ＣｓＴＩＦＹ１５ 未定位到染色体上(图 ３)ꎮ
ＴＩＦＹ 基因可能是重复事件的产物ꎮ 为进一步证实 ２.５ 茶树 ＣｓＴＩＦＹ 基因启动子顺式作用元件
茶树 ＴＩＦＹ 基因之间的进化关系ꎬ可视化了其保守 从图 ４ 可以看出 ＭＹＢ 响应元件分布在每个
域的分布(图 ２:Ｄ)ꎮ 尽管茶树 ＴＩＦＹ 蛋白质序列 ＴＩＦＹ 基因中ꎬ ｃｉｒｃａｄｉａｎ 为光周期响应元件在 ＴＩＦＹ
