Page 177 - 《广西植物》2022年第8期
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郭松ᖔ 梁湘兰ᖔ 黄青青ᖔ 等 紫九牛叶绿体基因组密码子偏好性分析 ЏȮ 广西植物ᖔ ԡᖔ ࿗ྉऐɯ᧥ ϟ࿗ᤃͱϟ࿗ሕ
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紫九牛叶绿体基因组密码子偏好性分析
郭জ 松 ᕷ 梁湘兰 ᕷ 黄青青 ᕷ 卢জ 祥 ᕷ 严其伟 ᕷ 张জ 鹏 ᕷ 覃逸明 ϟᕷ᥍
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ྉϟ 广西科技师范学院 食品与生化工程学院ᖔ 广西 来宾 ጢ࿗ᤃϟँँଫ 广西科技师范学院
特色瑶药资源研究与开发重点实验室ᖔ 广西 来宾 ጢ࿗ᤃϟँँ ɯ
摘জ 要ᧅ 为确定瑶药紫九牛叶绿体基因组密码子的使用模式及其成因ᖔ该研究以紫九牛叶绿体基因组 ጢԡ 条蛋
白质编码序列为研究对象ᖔ利用 ऊᆍʛᆍႿ ۼ ϟ࿗ 和在线软件 ऊВ୩۪ 和 ऊၤᔽᡱ༁ 分析其密码子偏好性ᤥ 结果表明᧥ྉϟɯ
୩ऊВᢦϟ 的密码子有 ँ 个ᖔ其中有 ऐ 个以 ዶᣰ В 结尾ᖔ说明叶绿体基因组的同义密码子中偏好以 ዶᣰ В 结尾ᤥ
ྉɯ紫九牛叶绿体基因组密码子的 ᥈ऊ 含量 ᥈ऊ ྉ࿗Ꭾሕऐᠮɯᢦ᥈ऊ ྉሕँऐϟᠮɯᢦ᥈ऊ ྉँᤃԡᠮɯᖔጶશऊ 值大于 ࿗ጢ 的有 ࿗ԡ
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个ᖔ说明紫九牛叶绿体基因组存在较弱的偏性ᤥྉሕɯ中性绘图分析和 ጶશऊ᥋ᡱᆍᡷ 分析说明了紫九牛叶绿体基因组
密码子的偏好性既受到选择的作用ᖔ又受到突变因素的影响ᤥྉ࿗ɯ通过构建的高低基因表达库最终确定了 ϟጢ 个
最优密码子ᖔ分别为 ВВ᥈ܦዶВВܦ᥈ВВܦ᥈ВዶܦВऊВܦ ऊऊВܦዶऊВܦዶऊዶܦ᥈ऊВܦऊዶዶܦዶዶऊܦ᥈ዶዶܦВ᥈Вܦऊ᥈В 和 ᥈᥈Вᤥ
该研究为紫九牛叶绿体基因组的确定以及遗传多样性分析提供了依据ᤥ
关键词ᧅ 紫九牛ᖔ 叶绿体基因组ᖔ 密码子ᖔ 偏好性分析ᖔ 最优密码子
中图分类号ᧅ ͐Ꭾጢজ জ 文献标识码ᧅ ዶজ জ 文章编号ᧅ ϟԡԡԡ᥋ሕϟ࿗ྉԡɯԡऐ᥋ϟ࿗ᤃ᥋ԡᎮ
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收稿日期ᧅ ԡԡͱԡͱᎮ
基金项目ᧅ 广西科技师范学院高层次人才启动经费ྉ᥈ᣮ୩ԡԡ᥈ɟԡԡँɯଫ广西科技师范学院特色瑶药资源研究与开发校级重点实验室
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第一作者ᧅ 郭松ྉϟँऐᎮͱɯᖔ博士ᖔ助理研究员ᖔ研究方向为分子生药学ᖔྉጶ᥋ቝᑕᔽɯ੫ࣼᆍ༁ᆍႿ੫ԡऐԡ࿗݀ ϟᤃሕዹᆍቝᤥ
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通信作者ᧅ 覃逸明ᖔ博士ᖔ教授ᖔ研究方向为民族医药资源开发ᖔྉጶ᥋ቝᑕᔽɯጢϟԡԡᎮँ࿗Ꭾሕ݀ ीीዹᆍቝᤥ