Page 182 - 《广西植物》2022年第8期
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ऐ 期                         郭松等᧥ 紫九牛叶绿体基因组密码子偏好性分析                                        ϟ ࿗ ሕ ϟ
                                         表 ጇই 紫九牛叶绿体基因组最优密码子分析
                                        ఋᑕᤦ᤟ᔀ ጢজ ዶႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁ ᆍ஦ ᆍᡱᡷᔽቝᑕ᤟ ዹᆍʛᆍႿ༁ ᔽႿ ዹၤ᤟ᆍʢᆍᡱ᤟ᑕ༁ᡷ
                                                ੫ᔀႿᆍቝᔀ༁ ᆍ஦ ႬᓣႥᡙᔠᤀᐹ੖ᅳ ᤀᓣᔠᅳዞᐹʗᡓᐹ
                            高表达基因         低表达基因                              高表达基因         低表达基因
             氨基酸           ̀ᔽ੫ၤ ᔀ଴ᡱʢᔀ༁༁ᔀʛ  ᓂᆍऔ ᔀ଴ᡱʢᔀ༁༁ᔀʛ      氨基酸           ̀ᔽ੫ၤ ᔀ଴ᡱʢᔀ༁༁ᔀʛ  ᓂᆍऔ ᔀ଴ᡱʢᔀ༁༁ᔀʛ
                    密码子        ੫ᔀႿᔀ          ੫ᔀႿᔀ                    密码子       ੫ᔀႿᔀ           ੫ᔀႿᔀ
              ዶቝᔽႿᆍ                                   σ኏୩ऊВ   ዶቝᔽႿᆍ                                    σ኏୩ऊВ
                     ऊᆍʛᆍႿ                                           ऊᆍʛᆍႿ
              ᑕዹᔽʛ                                             ᑕዹᔽʛ
                            数目           数目                                 数目            数目
                                  ኏୩ऊВ          ኏୩ऊВ                              ኏୩ऊВ           ኏୩ऊВ
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              ۪ၤᔀ    ВВВ    ϟᎮ     ԡ঎ऐጢ   ԰ሕ    ϟ঎࿗ऐ   ͱԡ঎ᤃሕ   ዶ᤟ᑕ  ᥈ऊВ      ሕሕ    ԰঎࿗࿗    ԰ऐ    ϟ঎ሕ԰   ϟ঎ϟ԰
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               ᓂᔀࣼ   ВВዶ    ϟँ     ϟ঎ᤃጢ   ԰ᤃ    ϟ঎Ꭾጢ   ͱԡ  ঎  ϟ  ԡ    ᥈  ऊ  ዶ  ϟ  ሕ  ԡ  ঎  ँ  ࿗  ԰  ࿗  ϟ  ঎  ϟ  ሕ  ͱԡ঎ϟँ
                    ВВ᥈     ϟऐ     ϟ঎ጢᎮ   ϟጢ    ϟ঎ԡϟ   ԡ঎ጢᤃ           ᥈ऊ᥈     ࿗    ԡ঎ሕԡ    ϟጢ    ԡ঎Ꭾϟ  ͱԡ঎࿗ϟ
                     ऊ  В  В  ϟ  ᤃ  ϟ  ঎  ሕ  ँ  ԰  ࿗  ϟ  ঎  ᤃ  ԰  ͱԡ঎԰ሕ  ఋᢃʢ  ВዶВ  ϟँ  ϟ঎ጢऐ  ሕሕ  ϟ঎ᤃϟ  ͱԡ঎ԡሕ
                     ऊВऊ     ԡ      ԡ     ᤃ     ԡ঎࿗ԡ   ͱԡ঎࿗ԡ          Вዶऊ     ጢ    ԡ঎࿗԰    ऐ     ԡ঎ሕँ   ԡ঎ԡሕ
                    ऊВዶ     ϟሕ     ϟ঎ϟሕ   Ꭾ     ԡ঎࿗Ꭾ   ԡ঎ᤃᤃ    ̀ᔽ༁    ऊዶВ    ϟϟ    ϟ঎԰԰    ϟሕ    ϟ঎࿗࿗  ͱԡ঎԰԰
                     ऊВ᥈     ሕ     ԡ঎԰ᤃ   ϟϟ    ԡ঎Ꭾ࿗   ͱԡ঎࿗ऐ         ऊዶऊ      Ꭾ    ԡ  ঎  Ꭾ  ऐ  ጢ  ԡ  ঎  ጢ  ᤃ  ԡ  ঎  ԰  ԰
               ᧧᤟ᔀ  ዶВВ     ሕँ     ϟ঎ጢᤃ   ࿗԰    ϟ঎԰ᤃ   ԡ঎ሕԡ    ᥈᤟Ⴟ   ऊዶዶ     ϟᎮ    ϟ঎Ꭾԡ    ԰ँ    ϟ঎ሕ԰   ԡ঎ሕऐ
                     ዶ  В  ऊ  ϟ  ሕ  ԡ  ঎  ጢ  ԰  ԰  ԰  ԡ  ঎  ᤃ  ᤃ  ͱԡ঎ϟ࿗  ऊዶ᥈  ሕ    ԡ঎ሕԡ    ϟጢ    ԡ঎ᤃऐ  ͱԡ঎ሕऐ
                     ዶ  В  ዶ  ԰  ሕ  ԡ  ঎  ँ  ԰  ሕ  ᤃ  ϟ  ঎  ԡ  ऐ  ͱԡ঎ϟᤃ  ዶ༁Ⴟ  ዶዶВ  ԰ᤃ  ϟ঎԰ϟ  ࿗ሕ  ϟ঎࿗ऐ  ͱԡ঎԰Ꭾ
               ჆ᑕ᤟  ᥈ВВ     ϟँ     ϟ঎ँጢ   ԰ऐ    ϟ঎ጢᤃ   ԡ঎ሕँ          ዶዶऊ     ϟᎮ    ԡ঎Ꭾँ    ϟጢ    ԡ঎ጢ԰   ԡ঎԰Ꭾ
                     ᥈Вऊ     ሕ     ԡ঎ሕϟ   ᤃ     ԡ঎ሕሕ   ͱԡ঎ԡ԰   ᓂᢃ༁   ዶዶዶ     ሕ࿗    ϟ঎Ꭾԡ    ࿗࿗    ϟ঎࿗Ꭾ   ԡ঎԰ሕ
                    ᥈Вዶ     ϟᤃ     ϟ঎ᤃ࿗   ԰Ꭾ    ϟ঎ጢԡ   ԡ঎ϟ࿗           ዶዶ᥈     ᤃ    ԡ঎ሕԡ    ϟᤃ    ԡ঎ጢሕ  ͱԡ঎԰ሕ
                     ᥈В᥈     ϟ     ԡ঎ϟԡ   ϟϟ    ԡ঎ᤃϟ   ͱԡ঎ጢϟ   ዶ༁ᡱ    ᥈ዶВ    ϟԡ    ϟ঎ϟϟ    ሕጢ    ϟ঎ጢᤃ  ͱԡ঎࿗ጢ
               ୩ᔀʢ  ВऊВ     ԰ϟ     ϟ঎ऐऐ   ϟ԰    ϟ঎԰ᤃ   ԡ঎ᤃ԰          ᥈ዶऊ      ऐ    ԡ঎ऐँ    ϟԡ    ԡ঎࿗࿗   ԡ঎࿗ጢ
                     Вऊऊ    ϟԡ     ԡ঎ँԡ   ँ     ԡ঎ँጢ   ͱԡ঎ԡጢ   ᥈᤟ࣼ   ᥈ዶዶ     ሕሕ    ϟ঎ጢሕ    ࿗ጢ    ϟ঎ሕԡ   ԡ঎԰ሕ
                     Вऊዶ     ࿗     ԡ঎ሕᤃ   ᤃ     ԡ঎ᤃሕ   ͱԡ  ঎  ԰  Ꭾ    ᥈  ዶ  ᥈  ϟ  ԡ  ԡ  ঎  ࿗  Ꭾ  ԰  ࿗  ԡ  ঎  Ꭾ  ԡ  ͱԡ঎԰ሕ
                     ዶ  ᥈  В  ϟ  ሕ  ϟ  ঎  ϟ  ᤃ  ϟ  ࿗  ϟ  ঎  ࿗  Ꭾ  ͱԡ঎ሕϟ  ऊᢃ༁  В᥈В    ጢ  ϟ  ঎  ᤃ  Ꭾ  ᤃ  ϟ  ঎  ሕ  ሕ  ԡ  ঎  ሕ  ࿗
                     ዶ᥈ऊ    ϟԡ     ԡ঎ँԡ   ᤃ     ԡ঎ᤃሕ   ԡ঎԰Ꭾ           В᥈ऊ     ϟ    ԡ঎ሕሕ    ሕ     ԡ঎ᤃᎮ  ͱԡ঎ሕ࿗
                     Вऊ᥈     ँ     ԡ঎ऐϟ   ϟԡ    ϟ঎ԡጢ   ͱԡ঎԰࿗   ዶʢ੫   ऊ᥈В     ϟँ    ϟ঎ሕँ    ϟሕ    ϟ঎ԡ࿗   ԡ঎ሕጢ
               ۪ʢᆍ   ऊऊВ    ϟᤃ     ϟ঎Ꭾऐ   ԰࿗    ϟ঎ጢᎮ   ԡ঎԰ϟ           ऊ᥈ऊ     Ꭾ    ԡ঎ጢϟ    ᤃ     ԡ঎࿗ऐ   ԡ঎ԡሕ
                     ऊऊऊ     ऐ     ԡ঎ऐँ   ϟऐ    ϟ঎ϟऐ   ͱԡ  ঎  ԰  ँ    ऊ  ᥈  ዶ  ԰  ԡ  ϟ  ঎  ࿗  ᤃ  ϟ  ँ  ϟ  ঎  ጢ  ԰  ͱԡ঎ԡᤃ
                     ऊऊዶ     Ꭾ     ԡ঎Ꭾऐ   ϟᤃ    ϟ঎ԡጢ   ͱԡ঎԰Ꭾ          ऊ᥈᥈     ጢ    ԡ঎ሕᎮ    ᤃ     ԡ঎࿗ऐ  ͱԡ঎ϟϟ
                    ऊऊ᥈      ጢ     ԡ঎ጢᤃ   ሕ     ԡ঎԰ԡ   ԡ঎ሕᤃ           ዶ᥈ዶ    ԰࿗    ϟ঎Ꭾᤃ    ԰ሕ    ϟ঎ऐ࿗  ͱԡ঎ԡऐ
               ఋၤʢ  ዶऊВ     ϟᤃ     ϟ঎࿗ँ   ϟ࿗    ϟ঎ϟ԰   ԡ঎ሕᎮ           ዶ᥈᥈     Ꭾ    ԡ঎ጢϟ    ऐ     ԡ঎ᤃ࿗  ͱԡ঎ϟሕ
                     ዶ  ऊ  ऊ  ϟ  ሕ  ϟ  ঎  ԰  ϟ  ϟ  Ꭾ  ϟ  ঎  ሕ  ᤃ  ͱԡ঎ϟጢ  ᥈᤟ᢃ  ᥈᥈В   ሕᤃ  ԰঎԰ጢ  ሕԡ  ϟ঎ሕԡ  ԡ঎ँጢ
                     ዶऊዶ    ϟ࿗     ϟ঎ሕԡ   ϟ࿗    ϟ঎ϟ԰   ԡ঎ϟऐ           ᥈᥈ऊ     ࿗    ԡ঎԰ጢ    ϟ԰    ԡ঎ጢ԰  ͱԡ঎԰Ꭾ
                     ዶऊ᥈     ԡ      ԡ     ጢ     ԡ঎࿗ԡ   ͱԡ  ঎  ࿗  ԡ    ᥈  ᥈  ዶ  ԰  ԡ  ϟ  ঎  ԰  ጢ  ሕ  ሕ  ϟ  ঎  ࿗  ሕ  ͱԡ঎ϟऐ
                                                                      ᥈᥈᥈     ࿗    ԡ঎԰ጢ    ϟᎮ    ԡ঎Ꭾ࿗  ͱԡ঎࿗ँ
            জ 注᧥   表示σ኏୩ऊВᤠԡ঎ԡऐଫ    表示σ኏୩ऊВᤠԡ঎ሕଫ     表示σ኏୩ऊВᤠԡ঎ጢᤥ
            জશᆍᡷᔀ᧥  ቝᔀᑕႿ༁ σ኏୩ऊВᤠԡ঎ԡऐଫ   ቝᔀᑕႿ༁ σ኏୩ऊВᤠԡ঎ሕଫ    ቝᔀᑕႿ༁ σ኏୩ऊВᤠԡ঎ጢ঎

            明密码子偏好性还受到突变作用的影响ᖔ与蒺藜苜                             过基因工程来改良紫九牛的性状提供了科学的依

            蓿ྉ᤹ᓣʐᔠዞᐹ੖ᅳ ᡙʗࣩႥዞᐹᡙࣩᤀᐹɯྉ杨国锋等ᖔ԰ԡϟጢɯ相类似ᤥ              据ᤥ 同时ᖔ对于物种的进化ᖔ以及提高外源基因表
                 我们此次将 ኏୩ऊВᢦ ϟ 且σ኏୩ऊВᤠԡ঎ԡऐ 的密                  达水平具有重大意义ᤥ
            码子确定为最优密码子ᖔ得到 ϟጢ 个最优密码子为
            ᥈ዶዶܦ ВВ᥈ܦ ዶВВܦ ᥈ВВܦ ऊዶዶܦ ዶዶऊܦ ᥈ऊВܦ ВऊВܦ
                                                               参考文献ᧅ
            ऊऊВܦዶऊВܦዶऊዶܦВ᥈Вܦ᥈Вዶܦऊ᥈В 和 ᥈᥈Вᤥ 其中ᖔ
            以 ዶᣰ В 结尾有 ϟ࿗ 个ᖔ这与上述中的紫九牛叶绿体
                                                               ̀В ᣮᣮᖔ ̀Вዶશ᥈ Իèᖔ ᓂВ ᥈୩ᖔ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡ԰ԡ঎ ᧧ႿᡷᔀʢᑕዹᡷᔽᆍႿ ᆍ஦
            基因组密码子偏好以 ዶᣰ В 结尾的结论一致ᤥ
                                                                  ᔀቝᆍʛᔽႿ ᑕႿʛ ᔽᡷ༁ ʛᔀʢᔽ׹ᑕᡷᔽ׹ᔀ ஦ʢᑕႿ੫ࣼ᤟ᔽႿ᥋ᑕ औᔽᡷၤ ᤦᆍ׹ᔽႿᔀ ༁ᔀʢࣼቝ
                 在紫九牛叶绿体基因工程的外源基因载体设                              ᑕ᤟ᤦࣼቝᔽႿ ᑕႿʛ ዹᑕ᤟஦ ᡷၤᢃቝࣼ༁ ᧕Ⴟᑕ ЏȮ૒঎ Ȯ ዶᡱᡱ᤟ ୩ᡱᔀዹᡷʢᆍ༁ዹᖔ ऐᎮ
            计时选用以 ዶᣰ В 结尾的最优密码子可以提高外源                             ྉϟɯ᧥ ࿗ᤃͱጢሕ঎
                                                               ̀В ᣮɟᖔ ᣮВ ɟ͐ᖔ ̀ዶશ ɟԻᖔ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡϟँ঎ ऊᆍʛᆍႿ ࣼ༁ᑕ੫ᔀ ᤦᔽᑕ༁
            基因的表达效率ᤥ 紫九牛叶绿体基因组偏好性的
                                                                  ᑕႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁ ᆍ஦ ᡷၤᔀ ዹၤ᤟ᆍʢᆍᡱ᤟ᑕ༁ᡷ ੫ᔀႿᆍቝᔀ ᆍ஦ Ԯᔠऊᔠᡓ၊ࣩ໧ ᢝࣩᢝࣩᤇᐹ
            研究以及最优密码子的确立ᖔ为优化目标基因ᖔ通                                ׹ᑕʢ঎ ໧ᡓᔠႥᅳ໧ᐹ ЏȮ૒঎ Ȯ èᆍʢ ጶႿ׹ᔽʢᆍႿ ୩ᔽዹᖔ ሕँྉᤃɯ᧥ ᤃ԰ϟͱᤃ԰ऐ঎ Џ胡
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