Page 113 - 《广西植物》2023年第2期

２ 期 陈博雯等: 基于转录组的八角挥发油合成相关基因挖掘与分析 ３ ０ ７

表 ２ 测序数据质量评估 ３８ ２４１ ( ４５. ４３％)、 ４０ ３８８ ( ４７. ９８％)、 ４３ １３６
Ｔａｂｌｅ ２ Ｑｕａｌｉｔｙ ｓｔａｔｉｓｔｉｃｓ ｏｆ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ｄａｔａ (５１.２４％)、４３ １７６ ( ５１. ２９％)、４３ ０９７ ( ５１. ２０％)、
数据量 碱基数 ＧＣ 含量 Ｑ３０ 质量值 ４３ ０３０ ( ５１. １２％) 个 基 因 在 ＮＲ、 ＮＴ、 Ｓｗｉｓｓ￣Ｐｒｏｔ、
样本编号
Ｒｅａｄｓ Ｂａｓｅ ＧＣ Ｑ３０
Ｓａｍｐｌｅ ＫＥＧＧ、ＫＯＧ、Ｐｆａｍ、ＧＯ 数据库中获得了注释ꎮ
ｎｕｍｂｅｒ ｎｕｍｂｅｒ ｃｏｎｔｅｎｔ ｖａｌｕｅ
ｎｕｍｂｅｒ ２.３ 差异表达基因的筛选及分析
(Ｍ) (Ｇｂ) (％) (％)
样本相关分析结果显示ꎬ同组样本基因表达
桂角 ６９ 号＿１ ４２.３１ ６.３５ ４５.７１ ９０.１２
模式趋于一致且相关系数均在 ０.９９ 以上ꎬ两个品
Ｇｕｉｊｉａｏ ６９＿１
桂角 ６９ 号＿２ ４２.２１ ６.３３ ４５.７３ ９０.３８ 种之间的相关系数约为 ０.８０( 图 ３:Ａ)ꎬ主成分分
Ｇｕｉｊｉａｏ ６９＿２
析结果表明两组样品之间相互独立(图 ３:Ｂ)ꎮ
桂角 ６９ 号＿３ ４２.４４ ６.３７ ４５.７８ ９０.０５
Ｇｕｉｊｉａｏ ６９＿３ ２.４ 差异基因 ＧＯ 功能注释及富集分析
两个品种样本中共筛选获得 ３０ ５７２ 个差异基
砧 ０１ 号＿１ ４２.１０ ６.３２ ４５.８９ ９０.３３
Ｚｈｅｎ ０１＿１ 因(ＤＥＧｓ)ꎬ其中上调 ＤＥＧｓ １５ ０２５ 个ꎬ下调 ＤＥＧｓ
砧 ０１ 号＿２ ４３.２８ ６.４９ ４５.９８ ９０.６２ １５ ５４７个ꎮ 对 ＤＥＧｓ 进行 ＧＯ 功能注释和分析ꎬ确
Ｚｈｅｎ ０１＿２
定其重要的生物学功能ꎮ 本研究结果表明ꎬ共有
砧 ０１ 号＿３ ４２.１４ ６.３２ ４５.９７ ９０.７９ ２０ ２８７ 个 ＤＥＧｓ 获得注释ꎬ并划分为 ３ 大类、 ５４ 小
Ｚｈｅｎ ０１＿３

Ａ. 样品相关性分析ꎻ Ｂ. 样品主成分分析ꎮ
Ａ. Ｓａｍｐｌｅ ｃｏｒｒｅｌａｔｉｏｎ ａｎａｌｙｓｉｓꎻ Ｂ. Ｐｒｉｎｃｉｐａｌ ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｓａｍｐｌｅｓ.
图 ３ 样品相关性和主成分分析
Ｆｉｇ. ３ Ｓａｍｐｌｅ ｃｏｒｒｅｌａｔｉｏｎ ａｎｄ ｐｒｉｎｃｉｐａｌ ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ ａｎａｌｙｓｉｓ

类(图 ４)ꎮ 生物学过程类别主要涉及细胞过程、代 ｔｏ ｓｔａｒｖａｔｉｏｎꎻ ＧＯ: ００３１６６７ꎬ ｒｅｓｐｏｎｓｅ ｔｏ ｎｕｔｒｉｅｎｔ
谢过程、单一机体过程ꎻ细胞组分类别主要涉及细 ｌｅｖｅｌｓ)ꎮ 在分子功能方面ꎬ翻译起始因子活性(ＧＯ:
胞、细胞部件、细胞膜、细胞膜部件、细胞器 ５ 种细胞 ０００３７４３ꎬ ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎ ｉｎｉｔｉａｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒ ａｃｔｉｖｉｔｙ) 和 ＲＮＡ
组分ꎻ分子功能类别主要涉及结合和催化活性 ２ 种 结合翻译因子活性(ＧＯ:０００８１３５ꎬ ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒ
分子功能ꎮ ＤＥＧｓ 富集分析结果显示ꎬ差异显著的 ａｃｔｉｖｉｔｙꎬ ＲＮＡ ｂｉｎｄｉｎｇ)为最显著富集 ＧＯ 条目ꎮ
只有生物学过程和分子功能(图 ５)ꎮ 生物学过程中 ２.５ 差异基因 ＫＥＧＧ 功能注释及富集分析
基因表达(ＧＯ:００１０４６７ꎬ ｇｅｎｅ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ) 富集基因 将 ３０ ５７２ 个 ＤＥＧｓ 与 ＫＥＧＧ 数 据 库 进 行 比
较多ꎬ与砧 ０１ 号相比ꎬ桂角 ６９ 号中有 １ ３２７ 个基因 对ꎬ结果共有 ２１ ６００ 个 ＤＥＧｓ 注释在 １３３ 条通路
上调ꎬ１ ２９２ 个基因下调ꎮ 差异最显著的 ２ 个 ＧＯ 条 上(图 ６:Ａ)ꎮ ＫＥＧＧ 生化代谢通路共分成 ５ 个生
目分别与饥饿和营养相关( ＧＯ:００４２５９４ꎬ ｒｅｓｐｏｎｓｅ 物过程ꎬ包括代谢、遗传信息过程、环境信息过程、