Page 46 - 《广西植物》2024年第2期
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plus、SD/ Trp、SD/ Leu、SD/ His/ Leu / Trp (TDO)、SD/ DH10B 感受态细胞中ꎮ 将电转化后的菌液ꎬ在摇
 ̄1
Ade / His/ Leu / Trp ( QDO)、Aureobasidin A、 X ̄α ̄Gal 床里 37 ℃ 、220 rmin 活化培养 1 hꎮ 培养结束
均 购 自 Clontech 公 司ꎻ FastPfu DNA Polymerase 后ꎬ取一部分菌液涂布平板进行初级文库容量、重
(AP221 ̄01)购于北京全式金生物技术股份有限公 组率和插入片段长度的鉴定ꎮ 剩余的菌液加入甘
司ꎻ冠菌素( coronatineꎬ COR)、DMSO、乙酰丁香酮 油ꎬ至终浓度 20%ꎬ于-80 ℃ 保存ꎬ即得到 COR 诱
(acetosyringone)、MES、MgCl 、PEG、TE、LiAc 等试剂 导橡胶树形成层组织的 cDNA 初级文库菌液ꎮ
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均购于 Sigma 公司ꎻ其他试剂均为国产分析纯ꎬ枪头 将上一步骤中验证合格的 cDNA 初级文库ꎬ使
®
和离心管均为 Axygen 公司产品ꎮ 用 PureLink HiPure Plasmid Filter Midiprep Kit
1.2 冠菌素(COR)处理植物材料 (Lifeꎬ K2100 ̄15) 提取文库质粒ꎮ 将得到的初级
选 取 一 年 生 橡 胶 树 萌 条 的 第 三 伸 长 单 位 文库质粒ꎬ稀释到 300 ngμL ꎬ使用 LR Clonase TM
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(EU3)ꎬ节间长且健壮的 树 干 作 为 实 验 材 料ꎬ在 Ⅱ Enzyme Mix 进行文库质粒重组ꎬ并提取重组产
EU3 树干中部ꎬ使用单面刀片刮去面积为 2 cm × 物后使用 BTX 指数衰减波电穿孔仪 ECM630 将重
4 cm的茎表皮及部分皮层ꎬ用面积略大的灭菌无 组产物转化到大肠杆菌 ElectroMAX DH10B 感受
 ̄1 态细胞中ꎬ然后进行培养ꎬ条件同上ꎮ 取转化后的
尘纸包裹处理部位ꎬ施加含有 6 μgmL 的 COR
溶液ꎬ用塑料封口膜缠绕并密封包裹ꎮ 处理时间 10 μL 菌液稀释 1 000 倍ꎬ再取 50 μL 稀释后的菌
分别为 0.5 h、1 h、2 h、4 h、8 h、1 d、2 d 和 3 dꎮ 然 液ꎬ涂布 LB 平板( 含链霉素抗性)ꎬ37 ℃ 培养过
后拆去塑料封口膜和无尘纸ꎬ切取处理部位的树 夜ꎮ 进行次级文库容量、重组率和插入片段长度
皮( 带部分木质部)ꎬ并立即分割成小块ꎬ置于 2 的鉴定ꎮ 剩余的菌液加入甘油ꎬ至终浓度 20%ꎬ于
mL 离心管中ꎬ液氮速冻ꎮ 每个时间点的形成层区 -80 ℃ 保存ꎬ即得到 COR 诱导橡胶树形成层组织
样品取自 5 株橡胶树萌条进行混合ꎬ并且每个时 的 cDNA 次 级 文 库 菌 液ꎮ 文 库 的 细 菌 菌 落 总 数
间点进行 3 组生物学重复ꎬ即每个时间点的共计 (CFU)计算方法如下:
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处理 15 株橡胶树萌条ꎮ CFU 浓度(CFUmL )= 平板上的克隆数 / 50
1.3 总 RNA 提取及 mRNA 的纯化 μL× 1 000 倍×1 000 μLꎻ
使用冰冻切片弦切的方法收集橡胶树树皮的 文库总 CFU=CFU 浓度×文库菌液总体积(mL)ꎮ
形成层区组织ꎬ使用 RNAprep Pure 多糖多酚植物 1.5 HbHDA6 诱饵质粒构建、鉴定及自激活检测
总 RNA 提取试剂盒( 天根ꎬDP441) 提取总 RNAꎮ HbHDA6 诱饵质粒构建时ꎬ先对含有目的基因
通过微量紫外分光光度计测定 RNA 浓度和纯度ꎬ HbHDA6 的载体进行 PCR 扩增后ꎬ进行 Sfi I 酶切ꎬ
使用 1%琼脂糖凝胶电泳检测 RNA 完整性后ꎬ合 获得目的基因 HbHDA6 的克隆片段ꎮ 使用 Sfi I 酶
格的总 RNA 样品于-80 ℃ 冰箱中保存备用ꎮ 将得 切ꎬ 获 得 线 性 化 的 酵 母 双 杂 交 诱 饵 载 体
到的不 同 时 间 段 COR 处 理 的 形 成 层 区 组 织 总 (pGBKT7)ꎬ再将目的基因 HbHDA6 的克隆片段连
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RNA 进行等量混合ꎬ利用磁珠法 FastTrack MAG 接到线性化的诱饵载体(pGBKT7)上ꎮ
mRNA isolation Kit ( Invitrogenꎬ K158096 ) 对 总 具体操作如下:根据 HbHDA6 基因的 cDNA 序
RNA 中的 mRNA 进行分离纯化ꎬ将 mRNA 进行等 列ꎬ设计引物时分别在其两端添加 Sfi I 的酶切位
量混合后ꎬ用于后续的酵母双杂交文库构建ꎮ 点序列ꎬ用于扩增 HbHDA6 基因的 cDNA 片段ꎮ 引
1.4 酵母双杂交文库的构建 物序列为 HbHDA6 ̄F(5′ ̄aaggccattacggccATGGGCG
TM
用 Gateway 重 组 技 术ꎬ 使 用 CloneMiner Ⅱ ACACAACCGGTGGT ̄3′)和 HbHDA6 ̄R(5′ ̄ccggccga
cDNA 文库构建试剂盒能够快速构建 cDNA 文库ꎮ ggcggccTCAAGAACGCGGATGCTCTTCTCTCT ̄3′)ꎮ
操作流程:将分离纯化并等量混合后的 mRNA 为 并按照 FastPfu DNA Polymerase ( AP221 ̄01) 高保
模板 进 行 反 转 录ꎬ 先 合 成 cDNA 第 一 链 后 合 成 真酶体系进行 PCR 扩增ꎬ使用 Sfi I 进行 HbHDA6
cDNA 双链ꎬ再将得到的双链 cDNA 进行分级分离 扩增片段的酶切和 pGBKT7 载体的线性化ꎮ 使用
TM Axygen 胶回收试剂盒进行酶切产物回收ꎮ 将回收
并收集ꎮ 使用 LR Clonase Ⅱ Enzyme Mix 进行 BP
重 组 反 应ꎻ 使 用 BTX 指 数 衰 减 波 电 穿 孔 仪 的酶切产物ꎬ连 接 转 化 到 大 肠 杆 菌 Top10 中ꎬ在
ECM630 进 行 电 转 化 到 大 肠 杆 菌 ElectroMAX 37 ℃ 条件下恒温培养过夜ꎮ 从上述连接体系转化