Page 48 - 《广西植物》2024年第2期
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在 SD ̄TLHA+X ̄α ̄Gal 缺陷型培养基平板上生长并 经 1%琼脂糖凝胶电泳检测ꎬ结果显示分化纯化的
使菌落呈现蓝色ꎬ表明同时激活了 HIS3、ADE2 和 mRNA 呈弥散的条带且均匀分布( 图 1:D)ꎬ表明
MEL1 3 个报告基因ꎮ 分离纯化得到的 mRNA 质量较好ꎬ可用于后续的
为了鉴定筛选到的阳性克隆的基因信息ꎬ将 实验ꎮ
上述阳性克隆的菌株ꎬ分别接种于 SD ̄TL 缺陷型 2.2 cDNA 初级文库和次级文库的构建和鉴定
液体培养基中ꎬ在 30 ℃ 、220 rmin 条件下振荡 将 COR 处理橡胶树形成层区组织的 cDNA 初
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培养 16 hꎮ 使用酵母质粒提取试剂盒[ 天根生化 级文库菌液涂板并培养后( 图 2:A)ꎬ进行 cDNA
科技(北京)有限公司ꎬDP112] 提取并纯化出酵母 初级文库容量、重组率和插入片段长度的鉴定ꎮ
质粒ꎮ 将提取纯化好的酵母质粒转化到大肠杆菌 结果表明ꎬcDNA 初级文库转化平板的容量( 平板
Top10 感受态细胞中进行扩增ꎬ在 37 ℃ 、220 r 稀释度为 1 ∶ 1 000) = 317 / 50 μL × 1 000 × 1 000
min 条件下振荡培养 16 hꎬ使用大肠杆菌质粒小 μL = 6.34×10 CFUmL ꎬ高于文库构建的实验要
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提试 剂 盒 [ 天 根 生 化 科 技 ( 北 京 ) 有 限 公 司ꎬ 求 1×10 CFUmL ꎻ总克隆数为 6.34×10 CFU
DP103]提取大肠杆菌质粒后并送样至生工生物工 mL ×2 mL≈1.27 × 10 ꎬ也高于文库构建标准 1 ×
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程(上海) 股份有限公司进行 DNA 测序ꎮ 将 DNA 10 ꎮ 并对 cDNA 初级文库的菌斑进行检测ꎬ随机
测序结果与 NCBI_GenBank 数据库中的序列进行 调取 24 个菌斑进行 PCR 鉴定ꎬ发现插入效率为
BLAST 比对分析ꎬ获得与 HbHDA6 发生相互作用 100%ꎬ插入片段长度分布于 0.6 ~ 1.2 kb 之间ꎬ平
的基因信息ꎮ 均插入片段长度为 1.1 kb(图 2:C)ꎮ
将 COR 处理橡胶树形成层区组织的 cDNA 次
2 结果与分析 级文库菌液涂板并培养后(图 2:B)ꎬ进行 cDNA 次
级文库容量、重组率和插入片段长度的鉴定ꎮ 结
2.1 橡胶树树皮的形成层区组织分离、总 RNA 提 果表明ꎬcDNA 次级文库转化平板的容量( 平板稀
取和 mRNA 分离纯化 释度 1 ∶ 1 000) = 386 / 50 μL× 1 000 × 1 000 μL =
使用冰冻切片弦切的方法分离 COR 处理的一 7.72×10 CFUmL ꎬ高于文库构建的实验要求 1×
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年生橡胶树萌条树皮形成层区组织( 图 1:A)ꎬ通 10 CFUmL ꎻ总克隆数为 7.72×10 CFUmL ×
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过光学显微镜观察ꎬ发现冰冻切片得到橡胶树树 2 mL≈1.54×10 ꎬ也高于文库构建标准 1×10 ꎮ 并
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皮的形成层组织没有杂质ꎬ并且绝大多数形成层 cDNA 次级文库的菌斑进行检测ꎬ随机挑取 24 个
区细胞呈长梭形且排列致密ꎬ几乎没有其他类型 克隆进行菌落 PCR 鉴定ꎬ发现插入效率为 100%ꎬ
的细胞(图 1:B)ꎮ 插入片段长度分布于 1.0 ~ 1.6 kb 之间ꎬ平均插入
利用 RNAprep Pure 多糖多酚植物总 RNA 提 片段长度为 1.2 kb(图 2:D)ꎮ
取试剂盒( DP441) 提取的形成层组织的总 RNAꎬ 综上所述ꎬ本研究构建的 COR 处理橡胶树萌
使用 Thermo NanoDrop2 000 微量紫外分光光度计 条树皮形成层区组织的酵母双杂交 cDNA 文库质
测定 RNA 浓度和纯度ꎬ发现总 RNA 的浓度较高ꎬ 量较好ꎬ可用于后续的 HbHDA6 互作蛋白的筛选
平均为 1 642.98 ngμL ꎬA260 / A280 的平均值 和鉴定实验ꎮ
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为 2.11ꎬA260 / A230 的平均值为 2.13ꎻ经 1%琼脂 2.3 HbHDA6 诱饵质粒构建、鉴定及自激活检测
糖凝胶电泳检测ꎬ结果显示 28S rRNA 和 18S rRNA 将含有 HbHDA6 基因的载体进行 PCR 扩增ꎬ
条带清晰ꎬ两个条带的亮度比值约为 2 ∶ 1ꎬ说明提 获得了约 1.7 kb 的条带( 图 3:A)ꎬ经过与目的基
取的总 RNA 没有降解( 图 1:C)ꎮ 本实验中提取 因的 DNA 序列进行测序比对ꎬ显示为 HbHDA6 的
的 COR 不同时间段处理橡胶树形成层组织的总 编码框ꎮ 经过 Sfi I 酶切ꎬ获得该目的基因 HbHDA6
RNA 质量较好ꎬ可用于后续的实验ꎮ 的克隆片段ꎬ并与 Sfi I 酶切的线性化酵母双杂交
将 8 个时间点的 COR 处理形成层区组织总 诱饵载体质粒 pGBKT7 载体进行连接ꎬ获得酵母双
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RNA 进 行 等 量 混 合 后ꎬ 利 用 磁 珠 法 FastTrack 杂交诱饵质粒 pGBKT7 ̄HbHDA6ꎮ 经过菌落 PCR
MAG mRNA isolation Kit (Invitrogenꎬ K158096) 对 检测ꎬ发现条带大小均为 1.7 kb(图 3:B)ꎬ并且测
总 RNA 中的 mRNA 进行分离纯化ꎬ得到的 mRNA 序结果显示目的基因的 DNA 序列比对正确ꎬ可进