Page 48 - 《广西植物》2024年第2期
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2 5 0                                  广  西  植  物                                         44 卷
            在 SD ̄TLHA+X ̄α ̄Gal 缺陷型培养基平板上生长并                     经 1%琼脂糖凝胶电泳检测ꎬ结果显示分化纯化的
            使菌落呈现蓝色ꎬ表明同时激活了 HIS3、ADE2 和                        mRNA 呈弥散的条带且均匀分布( 图 1:D)ꎬ表明
            MEL1 3 个报告基因ꎮ                                      分离纯化得到的 mRNA 质量较好ꎬ可用于后续的
                 为了鉴定筛选到的阳性克隆的基因信息ꎬ将                           实验ꎮ
            上述阳性克隆的菌株ꎬ分别接种于 SD ̄TL 缺陷型                          2.2 cDNA 初级文库和次级文库的构建和鉴定
            液体培养基中ꎬ在 30 ℃ 、220 rmin 条件下振荡                        将 COR 处理橡胶树形成层区组织的 cDNA 初
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            培养 16 hꎮ 使用酵母质粒提取试剂盒[ 天根生化                         级文库菌液涂板并培养后( 图 2:A)ꎬ进行 cDNA
            科技(北京)有限公司ꎬDP112] 提取并纯化出酵母                         初级文库容量、重组率和插入片段长度的鉴定ꎮ
            质粒ꎮ 将提取纯化好的酵母质粒转化到大肠杆菌                             结果表明ꎬcDNA 初级文库转化平板的容量( 平板

            Top10 感受态细胞中进行扩增ꎬ在 37 ℃ 、220 r                   稀释度为 1 ∶ 1 000) = 317 / 50 μL × 1 000 × 1 000
            min 条件下振荡培养 16 hꎬ使用大肠杆菌质粒小                         μL = 6.34×10 CFUmL ꎬ高于文库构建的实验要
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            提试 剂 盒 [ 天 根 生 化 科 技 ( 北 京 ) 有 限 公 司ꎬ              求 1×10 CFUmL ꎻ总克隆数为 6.34×10 CFU
            DP103]提取大肠杆菌质粒后并送样至生工生物工                           mL ×2 mL≈1.27 × 10 ꎬ也高于文库构建标准 1 ×
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            程(上海) 股份有限公司进行 DNA 测序ꎮ 将 DNA                       10 ꎮ 并对 cDNA 初级文库的菌斑进行检测ꎬ随机
            测序结果与 NCBI_GenBank 数据库中的序列进行                       调取 24 个菌斑进行 PCR 鉴定ꎬ发现插入效率为
            BLAST 比对分析ꎬ获得与 HbHDA6 发生相互作用                       100%ꎬ插入片段长度分布于 0.6 ~ 1.2 kb 之间ꎬ平
            的基因信息ꎮ                                             均插入片段长度为 1.1 kb(图 2:C)ꎮ
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            2  结果与分析                                           级文库菌液涂板并培养后(图 2:B)ꎬ进行 cDNA 次
                                                               级文库容量、重组率和插入片段长度的鉴定ꎮ 结
            2.1 橡胶树树皮的形成层区组织分离、总 RNA 提                         果表明ꎬcDNA 次级文库转化平板的容量( 平板稀
            取和 mRNA 分离纯化                                       释度 1 ∶ 1 000) = 386 / 50 μL× 1 000 × 1 000 μL =
                 使用冰冻切片弦切的方法分离 COR 处理的一                        7.72×10 CFUmL ꎬ高于文库构建的实验要求 1×
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            年生橡胶树萌条树皮形成层区组织( 图 1:A)ꎬ通                          10 CFUmL ꎻ总克隆数为 7.72×10 CFUmL ×
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            过光学显微镜观察ꎬ发现冰冻切片得到橡胶树树                              2 mL≈1.54×10 ꎬ也高于文库构建标准 1×10 ꎮ 并
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            皮的形成层组织没有杂质ꎬ并且绝大多数形成层                              cDNA 次级文库的菌斑进行检测ꎬ随机挑取 24 个
            区细胞呈长梭形且排列致密ꎬ几乎没有其他类型                              克隆进行菌落 PCR 鉴定ꎬ发现插入效率为 100%ꎬ
            的细胞(图 1:B)ꎮ                                        插入片段长度分布于 1.0 ~ 1.6 kb 之间ꎬ平均插入
                 利用 RNAprep Pure 多糖多酚植物总 RNA 提                 片段长度为 1.2 kb(图 2:D)ꎮ
            取试剂盒( DP441) 提取的形成层组织的总 RNAꎬ                           综上所述ꎬ本研究构建的 COR 处理橡胶树萌
            使用 Thermo NanoDrop2 000 微量紫外分光光度计                  条树皮形成层区组织的酵母双杂交 cDNA 文库质
            测定 RNA 浓度和纯度ꎬ发现总 RNA 的浓度较高ꎬ                        量较好ꎬ可用于后续的 HbHDA6 互作蛋白的筛选
            平均为 1 642.98 ngμL ꎬA260 / A280 的平均值              和鉴定实验ꎮ
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            为 2.11ꎬA260 / A230 的平均值为 2.13ꎻ经 1%琼脂               2.3 HbHDA6 诱饵质粒构建、鉴定及自激活检测

            糖凝胶电泳检测ꎬ结果显示 28S rRNA 和 18S rRNA                       将含有 HbHDA6 基因的载体进行 PCR 扩增ꎬ
            条带清晰ꎬ两个条带的亮度比值约为 2 ∶ 1ꎬ说明提                         获得了约 1.7 kb 的条带( 图 3:A)ꎬ经过与目的基
            取的总 RNA 没有降解( 图 1:C)ꎮ 本实验中提取                       因的 DNA 序列进行测序比对ꎬ显示为 HbHDA6 的
            的 COR 不同时间段处理橡胶树形成层组织的总                            编码框ꎮ 经过 Sfi I 酶切ꎬ获得该目的基因 HbHDA6

            RNA 质量较好ꎬ可用于后续的实验ꎮ                                 的克隆片段ꎬ并与 Sfi I 酶切的线性化酵母双杂交
                 将 8 个时间点的 COR 处理形成层区组织总                       诱饵载体质粒 pGBKT7 载体进行连接ꎬ获得酵母双
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            RNA 进 行 等 量 混 合 后ꎬ 利 用 磁 珠 法 FastTrack             杂交诱饵质粒 pGBKT7 ̄HbHDA6ꎮ 经过菌落 PCR
            MAG mRNA isolation Kit (Invitrogenꎬ K158096) 对     检测ꎬ发现条带大小均为 1.7 kb(图 3:B)ꎬ并且测
            总 RNA 中的 mRNA 进行分离纯化ꎬ得到的 mRNA                      序结果显示目的基因的 DNA 序列比对正确ꎬ可进
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