Page 27 - 《广西植物》2020年第1期

１ 期 王发明等: 探讨植物单染色体测序中的假阳性问题 ２ ３

体悬浮液后不经染色直接使用微细玻璃针(管) 吸 [Ｊ]. Ｇｅｎｏｍ Ｒｅｓꎬ １３(５): ９５４－９６４.
取分离ꎬ进行后续裂解和扩增反应ꎮ 本研究团队 ＨＵＡＮＧ Ｌꎬ ＭＡ Ｆꎬ ＣＨＡＰＭＡＮ Ａꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１５. Ｓｉｎｇｌｅ￣ｃｅｌｌ
ｗｈｏｌｅ￣ｇｅｎｏｍｅ ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ ａｎｄ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ: ｍｅｔｈｏｄｏｌｏｇｙ
在总结和深入解析单染色体测序失败原因的基础
ａｎｄ ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ [Ｊ]. Ａｎｎ Ｒｅｖ Ｇｅｎｏｍ Ｈｕｍ Ｇｅｎｅｔꎬ １６(１):
上ꎬ通过改进染色体悬浮液制备和分离方法ꎬ增加
７９－１０２.
蛋白酶 Ｋ 消化等步骤ꎬ目前已成功分离和体外扩 ＬＡＳＫＥＮ ＲＳꎬ ２００７. Ｓｉｎｇｌｅ￣ｃｅｌｌ ｇｅｎｏｍｉｃ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ｕｓｉｎｇ ｍｕｌｔｉ￣
增了小麦的单条植物染色体ꎬ并经过了 Ｓｏｕｔｈｅｒｎ 杂 ｐｌｅ ｄｉｓｐｌａｃｅｍｅｎｔ ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ [ Ｊ]. Ｃｕｒｒ Ｏｐｉｎ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌꎬ
交验证ꎬ但显示杂交信号不是很强ꎬ目前正在进行 １０(５):５１０－５１６.
ＬＩ Ｘꎬ ＬＩ Ｌꎬ ＹＡＮ Ｊꎬ ２０１５. Ｄｉｓｓｅｃｔｉｎｇ ｍｅｉｏｔｉｃ ｒｅｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎ
质量评估ꎬ相关研究结果将在后续文章中进行报道ꎮ
ｂａｓｅｄ ｏｎ ｔｅｔｒａｄ ａｎａｌｙｓｉｓ ｂｙ ｓｉｎｇｌｅ￣ｍｉｃｒｏｓｐｏｒｅ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ｉｎ
本研究针对使用单细胞测序技术进行单染色 ｍａｉｚｅ [Ｊ]. Ｎａｔ Ｃｏｍｍꎬ ６(１). ｄｏｉ:１０.１０３８/ ｎｃｏｍｍｓ７６４８
体体外扩增和测序过程中普遍遇到的扩增失败和 ＬＯＯＤ Ｒꎬ ＣＯＬＬＩＮ Ｍꎬ ２０１１. Ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎ ａｎｄ ｇｅｎｏｍｅ ｓｅ￣
假阳性问题ꎬ进行了具体地分析和探讨ꎬ并提出了 ｑｕｅｎｃｉｎｇ ｏｆ ｔｗｏ Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｃｎｅｓ ｐｈａｇｅｓ ｄｉｓｐｌａｙｉｎｇ
ｐｓｅｕｄｏｌｙｓｏｇｅｎｙ [Ｊ]. ＢＭＣ Ｇｅｎｏｍꎬ １２(１): １９８.
可行性建议ꎬ为进一步改进植物单染色体扩增技
ＬＵＯ Ｃꎬ ＨＥ ＸＨꎬ ＣＨＥＮ Ｈꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１１. Ｇｅｎｅｔｉｃ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ
术提供借鉴ꎮ ｍａｎｇｏ ｃｕｌｔｉｖａｒｓ ｅｓｔｉｍａｔｅｄ ｕｓｉｎｇ ＳＣｏＴ ａｎｄ ＩＳＳＲ ｍａｒｋｅｒｓ
[Ｊ]. Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｓｙｓｔｅｍ Ｅｃｏｌꎬ ３９: ６７６－６８４.
ＭＡＲＣＹ Ｙꎬ ＩＳＨＯＥＹ Ｔꎬ ＬＡＳＫＥＮ ＲＳꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２００７. Ｎａｎｏｌｉｔｅｒ
参考文献: ｒｅａｃｔｏｒｓ ｉｍｐｒｏｖｅ ｍｕｌｔｉｐｌｅ ｄｉｓｐｌａｃｅｍｅｎｔ ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ
ｇｅｎｏｍｅｓ ｆｒｏｍ ｓｉｎｇｌｅ ｃｅｌｌｓ [ Ｊ ]. ＰＬｏＳ Ｇｅｎｅｔꎬ ３ ( ９ ):
ＡＰＰＥＬＳꎬ ＲＵＤＩ Ｅꎬ ＫＥＬＬＹＥ Ｓꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１８. Ｓｈｉｆｔｉｎｇ ｔｈｅ １７０２－１７０８.
ｌｉｍｉｔｓ ｉｎ ｗｈｅａｔ ｒｅｓｅａｒｃｈ ａｎｄ ｂｒｅｅｄｉｎｇ ｕｓｉｎｇ ａ ｆｕｌｌｙ ａｎｎｏｔａｔｅｄ ＮＡＶＩＮ Ｎꎬ ＫＥＭＤＡＬＬ Ｊꎬ ＴＲＯＧＥ Ｊꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１１. Ｔｕｍｏｕｒ ｅｖｏ￣
ｒｅｆｅｒｅｎｃｅ ｇｅｎｏｍｅ [Ｊ]. Ｓｃｉｅｎｃｅꎬ ３６１(６４０３): ａａｒ７１９１. ＤＯＩ: ｌｕｔｉｏｎ ｉｎｆｅｒｒｅｄ ｂｙ ｓｉｎｇｌｅ￣ｃｅｌｌ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ [ Ｊ ]. Ｎａｔｕｒｅꎬ
１０.１１２６/ ｓｃｉｅｎｃｅ.ａａｒ７１９１ ４７２(７３４１): ９０－９４.
ＢＲＩＧＩＴＴＥ Ｄꎬ ＰＥＣＡＳＴＡＩＮＧＳ Ｓꎬ ＳＴＥＰＨＡＮＥ Ｃꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ＴＥＬＥＮＩＵＳ Ｈꎬ ＣＡＲＴＥＲ ＮＰꎬ ＢＥＢＢ ＣＥꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ １９９２. Ｄｅｇｅ￣
２０１８. Ｃｕｔｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｃｎｅｓ ( Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｃｎｅｓ) ａｎｄ ｎｅｒａｔｅ ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ￣ｐｒｉｍｅｄ ＰＣＲ: Ｇｅｎｅｒａｌ ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ
ａｃｎｅ ｖｕｌｇａｒｉｓ: Ａ ｂｒｉｅｆ ｌｏｏｋ ａｔ ｔｈｅ ｌａｔｅｓｔ ｕｐｄａｔｅｓ [Ｊ]. Ｊ Ｅｕｒ ｔａｒｇｅｔ ＤＮＡ ｂｙ ａ ｓｉｎｇｌｅ ｄｅｇｅｎｅｒａｔｅ ｐｒｉｍｅｒ [ Ｊ]. Ｇｅｎｏｍꎬ
Ａｃａｄ Ｄｅｒｍａｔｏｌꎬ ３２(Ｓｕｐｐｌ. １):５－１４. １３(３): ７１８－７２５.
ＣＨＥＮ Ｑꎬ ＡＲＭＳＴＲＯＮＧ ＫＣꎬ １９９５. Ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎ ｏｆ ａ ＷＡＮＧ ＦＭꎬ ＷＡＮＧ Ｐꎬ ＴＡＮＧ Ｑꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１０. Ｃｏｎｔｒｏｌ ｏｆ ｅｘｏ￣
ｌｉｂｒａｒｙ ｆｒｏｍ ａ ｓｉｎｇｌｅ ｍｉｃｒｏｄｉｓｓｅｃｔｅｄ ｏａｔ ( Ａｖｅｎａ ｓａｔｉｖａ Ｌ.) ｇｅｎｏｕｓ ｃｏｎｔａｍｉｎａｔｉｏｎｓ ｉｎ ｐｏｍｅｌｏ ( Ｃｉｔｒｕｓ ｇｒａｎｄｉｓ Ｏｓｂｅｃｋ)
ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ [Ｊ]. Ｇｅｎｏｍｅꎬ ３８(４): ７０６－７１４. ｓｉｎｇｌｅ ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ ＬＡ￣ＰＣＲ￣ＡＦＬＰ [Ｊ]. Ｃｈｉｎ Ｊ Ｔｒｏｐ Ｃｒｏｐꎬ ３１
ＣＯＬＬＡＲＤ ＣＹꎬ ＭＡＣＫＩＬＬ ＤＪꎬ ２００９. Ｓｔａｒｔ ｃｏｄｏｎ ｔａｒｇｅｔｅｄ (１２): ２１３５－２１４. [王发明ꎬ 王平ꎬ 唐琦ꎬ 等ꎬ ２０１０. 柚(Ｃｉｔｒｕｓ
(ＳＣｏＴ) ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ: Ａ ｓｉｍｐｌｅꎬ ｎｏｖｅｌ ＤＮＡ ｍａｒｋｅｒ ｔｅｃｈ￣ ｇｒａｎｄｉｓ Ｏｓｂｅｃｋ)单染色体 ＬＡ￣ＰＣＲ￣ＡＦＬＰ 技术体系中外源
ｎｉｑｕｅ ｆｏｒ ｇｅｎｅｒａｔｉｎｇ ｇｅｎｅ￣ｔａｒｇｅｔｅｄ ｍａｒｋｅｒｓ ｉｎ ｐｌａｎｔｓ [ Ｊ]. 污染的防控 [Ｊ]. 热带作物学报ꎬ ３１(１２):２１３５－２１４１.]
Ｐｌａｎｔ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ Ｒｅｐꎬ ２７(１): ８６－９３. ＹＩＬＭＡＺ Ｓꎬ ＡＬＬＧＡＩＥＲ Ｍꎬ ＨＵＧＥＮＨＬＴＺ Ｐꎬ ２０１０. Ｍｕｌｔｉｐｌｅ
ＤＵ Ｑꎬ ＷＡＮＧ ＨＢꎬ ＬＩＵ ＫＹꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１５. Ｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅ ｓｔｕｄｙ ｏｆ ｄｉｓｐｌａｃｅｍｅｎｔ ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｃｏｍｐｒｏｍｉｓｅｓ ｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅ ａｎａｌｙｓｉｓ
ａｅｒｏｓｏｌ ｒｉｓｋ ａｒｉｓｉｎｇ ｆｒｏｍ ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔｓ ｏｆ ｐａｔｈｏｇｅｎｉｃ ｏｆ ｍｅｔａｇｅｎｏｍｅｓ [Ｊ]. Ｎａｔ Ｍｅｔｈｏｄｓꎬ ７(１２): ９４３－９４４.
ｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍｓ [Ｊ]. Ｍｉｌ Ｍｅｄ Ｓｃｉꎬ ３９(１２): ９２６－９２８. [杜 ＺＯＮＧ Ｃꎬ ＬＵ Ｓꎬ ＣＨＡＰＭＡＮ ＡＲꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１２. Ｇｅｎｏｍｅ￣ｗｉｄｅ
茜ꎬ 王洪宝ꎬ 刘克洋ꎬ 等ꎬ ２０１５. 病原微生物实验室实验 ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ ｏｆ ｓｉｎｇｌｅ￣ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ａｎｄ ｃｏｐｙ￣ｎｕｍｂｅｒ ｖａｒｉａｔｉｏｎｓ ｏｆ
操作产生气溶胶风险定量研究 [Ｊ]. 军事医学ꎬ ３９(１２): ａ ｓｉｎｇｌｅ ｈｕｍａｎ ｃｅｌｌ [Ｊ]. Ｓｃｉｅｎｃｅꎬ ３３８(６１１４): １６２２－１６２６.
９２６－９２８.]
ＨＯＳＯＮＯ Ｓꎬ ＦＦＡＲＱＩ ＡＦꎬ ＤＥＡＮ ＦＢꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２００３. Ｕｎｂｉａｓｅｄ (责任编辑 蒋巧媛)
ｗｈｏｌｅ￣ｇｅｎｏｍｅ ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｄｉｒｅｃｔｌｙ ｆｒｏｍ ｃｌｉｎｉｃａｌ ｓａｍｐｌｅｓ