Page 131 - 《广西植物》2022年第10期

１０ 期 陈丽琼等: 质体系统发育基因组解析旋花科系统发育关系 １ ７ ４ ９

ａｎｄ ｖｅｒｓａｔｉｌｅ ｔｏｏｌｋｉｔ ｆｏｒ ａｃｃｕｒａｔｅ ｄｅ ｎｏｖｏ ａｓｓｅｍｂｌｙ ｏｆ '
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ＫＡＬＹＡＡＮＡＭＯＯＲＴＨＹ Ｓꎬ ＭＩＮＨ ＢＱꎬ ＷＯＮＧ ＴＫＦꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ
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ＫＡＴＯＨ Ｋꎬ ＳＴＡＮＤＬＥＹ ＤＭꎬ ２０１３. ＭＡＦＦＴ ｍｕｌｔｉｐｌｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅ
ｍａｊｏｒ ｌｉｎｅａｇｅｓ ｂａｓｅｄ ｏｎ ＤＮＡ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ ｍｕｌｔｉｐｌｅ
ａｌｉｇｎｍｅｎｔ ｓｏｆｔｗａｒｅ ｖｅｒｓｉｏｎ ７: ｉｍｐｒｏｖｅｍｅｎｔｓ ｉｎ ｐｅｒｆｏｒｍａｎｃｅ
ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｌｏｃｉ [Ｊ]. Ａｍ Ｊ Ｂｏｔꎬ ８９(９): １５１０－１５２２.
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ＳＴＥＦＡＮＯＶＩＣ Ｓꎬ ＯＬＭＳＴＥＡＤ ＲＧꎬ ２００４. Ｔｅｓｔｉｎｇ ｔｈｅ
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ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｐｏｓｉｔｉｏｎ ｏｆ ａ ｐａｒａｓｉｔｉｃ ｐｌａｎｔ ( Ｃｕｓｃｕｔａꎬ
ｂａｓｉｃ: ａｎ ｉｎｔｅｇｒａｔｅｄ ａｎｄ ｅｘｔｅｎｄａｂｌｅ ｄｅｓｋｔｏｐ ｓｏｆｔｗａｒｅ ｐｌａｔｆｏｒｍ
Ｃｏｎｖｏｌｖｕｌａｃｅａｅꎬ ａｓｔｅｒｉｄａｅ ): ｂａｙｅｓｉａｎ ｉｎｆｅｒｅｎｃｅ ａｎｄ ｔｈｅ
ｆｏｒ ｔｈｅ ｏｒｇａｎｉｚａｔｉｏｎ ａｎｄ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｄａｔａ [ Ｊ].
ｐａｒａｍｅｔｒｉｃ ｂｏｏｔｓｔｒａｐ ｏｎ ｄａｔａ ｄｒａｗｎ ｆｒｏｍ ｔｈｒｅｅ ｇｅｎｏｍｅｓ
Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓꎬ ２８(１２): １６４７－１６４９.
[Ｊ]. Ｓｙｓｔ Ｂｉｏｌꎬ ５３(３): ３８４－３９９.
ＬＩ ＨＴꎬ ＹＩ ＴＳꎬ ＧＡＯ ＬＭꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１９. Ｏｒｉｇｉｎ ｏｆ ａｎｇｉｏｓｐｅｒｍｓ
ＳＵＤＨＩＲ Ｋꎬ ＧＬＥＮ Ｓꎬ ＭＩＣＨＡＥＬ Ｌꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１８. ＭＥＧＡ Ｘ:
ａｎｄ ｔｈｅ ｐｕｚｚｌｅ ｏｆ ｔｈｅ Ｊｕｒａｓｓｉｃ ｇａｐ [Ｊ]. Ｎａｔ Ｐｌａｎｔｓꎬ ５(５):
ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙ ｇｅｎｅｔｉｃｓ ａｎａｌｙｓｉｓ ａｃｒｏｓｓ ｃｏｍｐｕｔｉｎｇ
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ＷＡＮＧ Ｗꎬ ＬＩＵ Ｙꎬ ２０２０. Ｔｈｅ ｃｕｒｒｅｎｔ ｓｔａｔｕｓꎬ ｐｒｏｂｌｅｍｓꎬ ａｎｄ
ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎꎬ ａｎｄ ｕｓｅｓ ｏｆ ｐｌａｎｔｓꎬ ｉｌｌｕｓｔｒａｔｅｄ ｕｐｏｎ ｔｈｅ ｎａｔｕｒａｌ
ｐｏｌｉｃｙ ｓｕｇｇｅｓｔｉｏｎｓ ｆｏｒ ｒｅｃｏｎｓｔｒｕｃｔｉｎｇ ｔｈｅ ｐｌａｎｔ ｔｒｅｅ ｏｆ ｌｉｆｅ
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ｃｏｍｐｌｅｔｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ [ Ｊ]. Ｐｌａｎｔ Ｄｉｖｅｒｓ Ｒｅｓｏｕｒꎬ
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ＺＨＵ ＡＤꎬ ＧＵＯ ＷＨꎬ ＧＵＰＴＡ Ｓꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１６. Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙ
ＳＩＭÕＥＳ ＡＲꎬ ＣＵＬＨＡＭ Ａꎬ ＣＡＲＩＮＥ Ｍꎬ ２０１５. Ｒｅｓｏｌｖｉｎｇ ｔｈｅ
ｄｙｎａｍｉｃｓ ｏｆ ｔｈｅ ｐｌａｓｔｉｄ ｉｎｖｅｒｔｅｄ ｒｅｐｅａｔ: ｔｈｅ ｅｆｆｅｃｔｓ ｏｆ
ｕｎｒｅｓｏｌｖｅｄ ｔｒｉｂｅ: ａ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｆｒａｍｅｗｏｒｋ ｆｏｒ ｔｈｅ
ｅｘｐａｎｓｉｏｎꎬ ｃｏｎｔｒａｃｔｉｏｎꎬ ａｎｄ ｌｏｓｓ ｏｎ ｓｕｂｓｔｉｔｕｔｉｏｎ ｒａｔｅｓ
Ｍｅｒｒｅｍｉｅａｅ ( Ｃｏｎｖｏｌｖｕｌａｃｅａｅ ) [ Ｊ ]. Ｂｏｔ Ｊ Ｌｉｎｎ Ｓｏｃꎬ
[Ｊ]. Ｎｅｗ Ｐｈｙｔｏｌꎬ ２０９(４): １７４７－１７５６.
１７９(３): ３７４－３８７.
ＳＩＭÕＥＳ ＡＲꎬ ＳＴＡＰＬＥＳ Ｇꎬ ２０１７. Ｄｉｓｓｏｌｕｔｉｏｎ ｏｆ Ｃｏｎｖｏｌｖｕｌａｃｅａｅ
(责任编辑 蒋巧媛)
ｔｒｉｂｅ Ｍｅｒｒｅｍｉｅａｅ ａｎｄ ａ ｎｅｗ ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ｃｏｎｓｔｉｔｕｅｎｔ
ｇｅｎｅｒａ [Ｊ]. Ｂｏｔ Ｊ Ｌｉｎｎ Ｓｏｃꎬ １８３(４): ５６１－５８６.