Page 132 - 《广西植物》2022年第10期
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Ｇｕｉｈａｉａ Ｏｃｔ. ２０２２ꎬ ４２(１０): １７５０－１７６１
ＤＯＩ: １０.１１９３１/ ｇｕｉｈａｉａ.ｇｘｚｗ２０２１０６０５７
张倩ꎬ 张德全. 白花刺续断野生居群的叶绿体全基因组特征解析 [Ｊ]. 广西植物ꎬ ２０２２ꎬ ４２(１０): １７５０－１７６１.
ＺＨＡＮＧ Ｑꎬ ＺＨＡＮＧ ＤＱ. Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｃｏｍｐｌｅｔｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ ｆｒｏｍ ｗｉｌｄ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓ ｏｆ Ａｃａｎｔｈｏｃａｌｙｘ ａｌｂａ [Ｊ].
Ｇｕｉｈａｉａꎬ ２０２２ꎬ ４２(１０): １７５０－１７６１.
白花刺续断野生居群的叶绿体全基因组特征解析
张 倩 ꎬ 张德全 １ꎬ２∗
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( １.大理大学 药学院ꎬ 云南 大理 ６７１０００ꎻ ２. 云南省滇西抗病原植物资源筛选研究重点实验室ꎬ 云南 大理 ６７１０００ )
摘 要: 白花刺续断在中国西藏是一种常用的药用植物ꎬ但其叶绿体全基因组的相关研究较少ꎮ 为揭示该物
种叶绿体全基因组的基本特征并探讨其谱系遗传结构ꎬ该研究利用 Ｉｌｌｕｍｉｎａ 测序平台对来自 ５ 个野生居群的
１０ 个白花刺续断个体进行二代测序ꎬ经组装、注释ꎬ得到 １０ 条完整的叶绿体全基因组序列ꎬ并对它们的基因组
特征和居群间的谱系进化关系进行了初步研究ꎮ 结果表明:(１) 白花刺续断的叶绿体全基因组大小为
１５５ ３３５~１５６ ２６６ ｂｐꎬ共注释 １１３ 个基因ꎬ包括 ７２ 个蛋白编码基因、３０ 个 ｔＲＮＡ 基因和 ４ 个 ｒＲＮＡ 基因ꎬ其叶绿
体基因组的大小、结构、ＧＣ 含量及基因组成等方面在种内高度保守ꎮ (２)基因组比较分析表明ꎬ白花刺续断
变异较大的片段均位于单拷贝区ꎬ且 ＩＲ 边界未出现明显的扩张和收缩ꎮ (３)群体遗传分析发现ꎬ白花刺续断
的野生居群具有明显的地理遗传结构ꎬ不同居群间在遗传距离与地理距离上具有一定的相关性ꎮ 研究认为ꎬ
白花刺续断叶绿体基因组在种内居群水平上比较保守ꎬ且叶绿体基因组可在居群水平上揭示物种的地理遗传
结构ꎮ 这为后续开展刺续断属物种群体遗传学和系统发育基因组学研究奠定了基础ꎮ
关键词: 白花刺续断ꎬ 叶绿体全基因组ꎬ 药用植物ꎬ 基因ꎬ 系统发育基因组学
中图分类号: Ｑ９４３ 文献标识码: Ａ 文章编号: １０００￣３１４２(２０２２)１０￣１７５０￣１２
Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｃｏｍｐｌｅｔｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ
ｆｒｏｍ ｗｉｌｄ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓ ｏｆ Ａｃａｎｔｈｏｃａｌｙｘ ａｌｂａ
１ １ꎬ２∗
ＺＨＡＮＧ Ｑｉａｎ ꎬ ＺＨＡＮＧ Ｄｅｑｕａｎ
( １. Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｙꎬ Ｄａｌｉ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬ Ｄａｌｉ ６７１０００ꎬ Ｙｕｎｎａｎꎬ Ｃｈｉｎａꎻ ２. Ｙｕｎｎａｎ Ｋｅｙ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｏｆ Ｓｃｒｅｅｎｉｎｇ ａｎｄ
Ｒｅｓｅａｒｃｈ ｏｎ Ａｎｔｉ￣ｐａｔｈｏｇｅｎｉｃ Ｐｌａｎｔ Ｒｅｓｏｕｒｃｅｓ ｆｒｏｍ Ｗｅｓｔｅｒｎ Ｙｕｎｎａｎꎬ Ｄａｌｉ ６７１０００ꎬ Ｙｕｎｎａｎꎬ Ｃｈｉｎａ )
Ａｂｓｔｒａｃｔ: Ａｃａｎｔｈｏｃａｌｙｘ ａｌｂａ ｉｓ ａ ｃｏｍｍｏｎ ｍｅｄｉｃｉｎａｌ ｐｌａｎｔ ｉｎ Ｔｉｂｅｔａｎ ｏｆ Ｃｈｉｎａꎬ ａｎｄ ｔｈｅｒｅ ａｒｅ ｆｅｗ ｒｅｐｏｒｔｓ ｏｎ ｉｔｓ ｗｈｏｌｅ
ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｎｏｗ. Ｉｎ ｏｒｄｅｒ ｔｏ ｒｅｖｅａｌ ｂａｓｉｃ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ ｏｆ ｔｈｅ ｗｈｏｌｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｏｆ Ａ. ａｌｂａ ａｎｄ ｅｘｐｌｏｒｅ ｉｔｓ
收稿日期: ２０２１－０９－２０
基金项目: 国家自然科学基金(３２０６００９１)ꎻ云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目(２０２１０５ＡＣ１６００６３)ꎻ大理大学中药资
源与民族药创新团队项目( ＺＫＬＸ２０１９３１８)ꎻ云南省李剑专家工作站( ２０２００５ＡＦ１５００１３) [ Ｓｕｐｐｏｒｔｅｄ ｂｙ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｎａｔｕｒａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ
Ｆｏｕｎｄａｔｉｏｎ ｏｆ Ｃｈｉｎａ (３２０６００９１)ꎻ Ｒｅｓｅｒｖｅ Ｔａｌｅｎｔｓ Ｐｒｏｊｅｃｔ ｆｏｒ Ｙｏｕｎｇ ａｎｄ Ｍｉｄｄｌｅ Ａｇｅｄ Ａｃａｄｅｍｉｃ (２０２１０５ＡＣ１６００６３)ꎻ Ｄａｌｉ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ
Ｃｈｉｎｅｓｅ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ Ｒｅｓｏｕｒｃｅｓ ａｎｄ Ｅｔｈｎｉｃ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ Ｉｎｎｏｖａｔｉｏｎ Ｔｅａｍ Ｐｒｏｊｅｃｔ ( ＺＫＬＸ２０１９３１８)ꎻ Ｌｉ Ｊｉａｎ Ｅｘｐｅｒｔ Ｗｏｒｋｓｔａｔｉｏｎ ｏｆ Ｙｕｎｎａｎ
Ｐｒｏｖｉｎｃｅ (２０２００５ＡＦ１５００１３)]ꎮ
第一作者: 张倩(１９９６－)ꎬ硕士研究生ꎬ主要从事药用植物基因组学研究ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ)１３４９３６２９９４＠ ｑｑ.ｃｏｍꎮ
∗
通信作者: 张德全ꎬ教授ꎬ硕士研究生导师ꎬ主要从事药用植物的分类和生药的分子鉴定研究ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ)ｚｈａｎｇｄｅｑ２００８＠ １２６.ｃｏｍꎮ
