Page 136 - 《广西植物》2022年第10期
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１ ７ ５ ４ 广 西 植 物 ４２ 卷
圆圈外的基因是顺时针转录ꎬ圆圈内的基因是逆时针ꎮ 图中颜色表示功能基因ꎮ 内部的深灰色对应于 ＧＣ 含量ꎬ浅灰色对应于
ＡＴ 含量ꎮ
Ｔｈｅ ｇｅｎｅｓ ｏｕｔｓｉｄｅ ｔｈｅ ｃｉｒｃｌｅ ａｒｅ ｔｒａｎｓｃｒｉｂｅｄ ｃｌｏｃｋｗｉｓｅꎬ ｗｈｉｌｅ ｔｈｅ ｇｅｎｅｓ ｉｎｓｉｄｅ ｔｈｅ ｃｉｒｃｌｅ ａｒｅ ｔｒａｎｓｃｒｉｂｅｄ ｃｏｕｎｔｅｒｃｌｏｃｋｗｉｓｅ. Ｔｈｅ ｃｏｌｏｒｓ ｈｅｒｅ
ｒｅｐｒｅｓｅｎｔ ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ ｇｅｎｅｓ. Ｔｈｅ ｉｎｎｅｒ ｄａｒｋ ｇｒａｙ ｃｏｒｒｅｓｐｏｎｄｓ ｔｏ ｔｈｅ ＧＣ ｃｏｎｔｅｎｔ ａｎｄ ｔｈｅ ｌｉｇｈｔ ｇｒａｙ ｃｏｒｒｅｓｐｏｎｄｓ ｔｏ ｔｈｅ ＡＴ ｃｏｎｔｅｎｔ.
图 １ 白花刺续断叶绿体全基因组图谱
Ｆｉｇ. １ Ｇｅｎｅ ｍａｐ ｏｆ ｃｏｍｐｌｅｔｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｉｎ Ａｃａｎｔｈｏｃａｌｙｘ ａｌｂａ
异值越大(表 ４)ꎮ 系统发育分析结果显示ꎬ３ 种方 含量最高ꎮ 白花刺续断叶绿体基因组中共含有 ７ 个
法构建的进化树所反映的不同野生居群之间的进 假基因ꎬ其中 ５ 个假基因是川续断科植物所共有的
化关系相似( 图 ６)ꎬ也与遗传距离分析的结果相 (ｃｌｐＰ、ａｃｃＤ、ｙｃｆ２、ｙｃｆ１、ｒｐｓ１８)ꎬ故推测可能普遍存在
吻合ꎮ 在系统发育树中ꎬ康定( ＫＤ) 和道孚( ＤＦ) 川续断科植物假基因现象(Ｗａｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２０)ꎮ 叶
的 ４ 个个体最早分化出来ꎬ其次是亚丁(ＹＤ) 和桑 绿体 ＳＳＲ 位点是一种高效的分子标记ꎮ 本研究中ꎬ
堆(ＳＤ)ꎬ最后是理塘( ＬＴ) 的 ２ 个个体ꎮ 但亚丁 白花刺续断叶绿体全基因组序列的 ＳＳＲｓ 主要以 Ａ/
(ＹＤ)和桑堆(ＳＤ)的 ４ 个个体不能明显分开ꎮ Ｔ 碱基为主ꎬ这与其他被子植物中的情况相似(Ｇｕｏ
ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１７ꎻＮａ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１８ꎻＣｈｅｎ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１９)ꎮ 同
３ 讨论与结论 时ꎬ这也进一步证实了叶绿体 ＳＳＲｓ 主要是由 ｐｏｌｙＡ
和 ｐｏｌｙＴ 重复所构成ꎬ而较少含有 Ｃ 或 Ｇ 串联重复
本研究报道了白花刺续断的叶绿体全基因组 的观点(Ｋｕａｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１１)ꎮ 此外ꎬ这些 ＳＳＲｓ 主要
序列特征ꎬ并在居群水平上揭示了其地理遗传结 分布在 ２ 个单拷贝区ꎬ故推测这些高 Ａ / Ｔ 含量的
构ꎮ 不同野生居群的叶绿体基因组所编码的基因 ＳＳＲｓ 和分布于 ＩＲ 区的 ｒＲＮＡ 序列可能是导致叶
类别、数量及排列顺序高度一致ꎮ 同时个体间具有 绿体基因组中 ＧＣ 含量偏低以及各区域碱基含量
高度相似的 ＧＣ 含量ꎬ单个序列中 ＩＲｓ 区序列的 ＧＣ 差异的潜在原因(张明英等ꎬ２０２０)ꎮ
