Page 139 - 《广西植物》2022年第10期
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１０ 期 张倩等: 白花刺续断野生居群的叶绿体全基因组特征解析 １ ７ ５ ７
Ａ. ＳＤ０１ 叶绿体基因组中不同重复类型 ＳＳＲ 出现频率ꎻ Ｂ. １０ 个基因组中不同 ＳＳＲ 类型的数目ꎻ Ｃ. 在 ＬＳＣ、ＳＳＣ 和 ＩＲ 区域中出
现 ＳＳＲ 的频率ꎻ Ｄ. 在 ＩＧＳ、ＣＤＳ 和内含子中出现 ＳＳＲ 的频率ꎮ
Ａ. Ｆｒｅｑｕｅｎｃｙ ｏｆ ＳＳＲ ｍｏｔｉｆｓ ｉｎ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｒｅｐｅａｔ ｔｙｐｅｓ ｏｆ ＳＤ０１ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅꎻ Ｂ. Ｎｕｍｂｅｒ ｏｆ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ＳＳＲｓ ｔｙｐｅ ｄｅｔｅｃｔｅｄ ｉｎ ｔｅｎ ｇｅｎｏｍｅｓꎻ
Ｃ. Ｆｒｅｑｕｅｎｃｙ ｏｆ ｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄ ＳＳＲ ｉｎ ＬＳＣꎬ ＳＳＣ ａｎｄ ＩＲ ｒｅｇｉｏｎｓꎻ Ｄ. Ｆｒｅｑｕｅｎｃｙ ｏｆ ｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄ ＳＳＲ ｉｎ ＩＧＳꎬ ＣＤＳ ａｎｄ ｉｎｔｒｏｎ.
图 ３ 白花刺续断 １０ 条叶绿体基因组的 ＳＳＲ 分析
Ｆｉｇ. ３ Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｓｉｍｐｌｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｒｅｐｅａｔ (ＳＳＲ) ｏｎ ｔｅｎ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ ｉｎ Ａｃａｎｔｈｏｃａｌｙｘ ａｌｂａ
窗口长度为 ６００ ｂｐꎬ 步长为 ２００ ｂｐꎮ Ｘ 轴. 窗口中点的位置ꎻ Ｙ 轴. 每个窗口的核苷酸多样性ꎮ
Ｗｉｎｄｏｗ ｌｅｎｇｔｈ ｉｓ ６００ ｂｐꎬ ｓｔｅｐ ｓｉｚｅ ｉｓ ２００ ｂｐ. Ｘ￣ａｘｉｓ. Ｐｏｓｉｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ｍｉｄｐｏｉｎｔ ｏｆ ａ ｗｉｎｄｏｗꎻ Ｙ￣ａｘｉｓ. Ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ ｅａｃｈ ｗｉｎｄｏｗ.
图 ４ 白花刺续断 １０ 条叶绿体全基因组的滑动窗口分析
Ｆｉｇ. ４ Ｓｌｉｄｉｎｇ ｗｉｎｄｏｗ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｔｅｎ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ ｉｎ Ａｃａｎｔｈｏｃａｌｙｘ ａｌｂａ
