Page 137 - 《广西植物》2022年第10期

１０ 期 张倩等: 白花刺续断野生居群的叶绿体全基因组特征解析 １ ７ ５ ５

表 ２ 白花刺续断 １０ 条叶绿体全基因组序列特征的比较
Ｔａｂｌｅ ２ Ｇｅｎｅ ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎ ｏｎ ｔｅｎ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｃｏｍｐｌｅｔｅ ｇｅｎｏｍｅｓ ｉｎ Ａｃａｎｔｈｏｃａｌｙｘ ａｌｂａ
大单 小单 ＧｅｎＢａｎｋ
总长 反向重复区 ＧＣ 含量 基因总数 蛋白编码
编号 拷贝区 拷贝区 登录号
Ｔｏｔａｌ ｌｅｎｇｔｈ ＩＲｓ ＧＣ ｃｏｎｔｅｎｔ Ｔｏｔａｌ 基因 ｔＲＮＡ ｒＲＮＡ
Ｃｏｄｅ ＬＳＣ ＳＳＣ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ
(ｂｐ) (ｂｐ) (％) ｇｅｎｅｓ ＣＤＳ
(ｂｐ) (ｂｐ) ｎｕｍｂｅｒ
ＳＤ０１ １５６ ０８２ ８９ ０３０ １７ ７４０ ２４ ６５６ ３８.１ １１３ ７２ ３０ ４ ＭＷ０５３６８８
ＳＤ０２ １５５ ３３５ ８９ ０３５ １７ ７９４ ２４ ２５３ ３８.２ １１３ ７２ ３０ ４ ＭＷ０５３６８９
ＹＤ０１ １５６ １１０ ８９ ０３６ １７ ８４２ ２４ ６１６ ３８.１ １１３ ７２ ３０ ４ ＭＷ０５３６９０
ＹＤ０２ １５６ ０５３ ８９ ０３６ １７ ７０５ ２４ ６５６ ３８.１ １１３ ７２ ３０ ４ ＭＷ０５３６８７
ＤＦ０１ １５６ ２６６ ８９ ０２７ １７ ７１３ ２４ ７６３ ３８.１ １１３ ７２ ３０ ４ ＭＷ０５３６８６
ＤＦ０２ １５６ ２６６ ８９ ０２７ １７ ７１３ ２４ ７６３ ３８.１ １１３ ７２ ３０ ４ ＭＷ０５３６８５
ＬＴ０１ １５６ ０５４ ８９ ０３２ １７ ７９０ ２４ ６１６ ３８.１ １１３ ７２ ３０ ４ ＭＷ０１８７０１
ＬＴ０２ １５６ ０５４ ８９ ０３２ １７ ７９０ ２４ ６１６ ３８.１ １１３ ７２ ３０ ４ ＭＷ０１８７０２
ＫＤ０１ １５６ ０９７ ８９ ０７６ １７ ６８９ ２４ ６６６ ３８.１ １１３ ７２ ３０ ４ ＭＷ０１８７０３
ＫＤ０２ １５６ ０９７ ８９ ０７６ １７ ６８９ ２４ ６６６ ３８.１ １１３ ７２ ３０ ４ ＭＷ０１８７０４

表 ３ 白花刺续断叶绿体全基因组基因组成
Ｔａｂｌｅ ３ Ｃｏｍｐｏｓｉｔｉｏｎ ｏｆ ｃｏｍｐｌｅｔｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｏｆ Ａｃａｎｔｈｏｃａｌｙｘ ａｌｂａ

基因类别 基因功能 基因名称
Ｇｅｎｅ ｇｒｏｕｐ Ｇｅｎｅ ｆｕｎｃｔｉｏｎ Ｇｅｎｅ ｎａｍｅ
自我复制 核糖体大亚基 ｒｐｌ２ꎬｒｐｌ１２ ꎬｒｐｌ３２ꎬｒｐｌ２２ꎬｒｐｌ１６ ꎬｒｐｌ１４ꎬｒｐｌ３６ꎬｒｐｌ２０ꎬｒｐｌ３３
Ｉ
Ｌａｒｇｅ ｓｕｂｕｎｉｔ ｏｆ ｒｉｂｏｓｏｎｅ
Ｉ
＃
＃
Ｉ
Ｓｅｌｆ￣ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎ 核糖体小亚基 ｒｐｓ７ ꎬｒｐｓ１５ꎬｒｐｓ１９ꎬｒｐｓ３ ꎬｒｐｓ８ꎬｒｐｓ１１ꎬｒｐｓ１２ ꎬｒｐｓ１８ ꎬｒｐｓ４ꎬｒｐｓ１４ꎬｒｐｓ２ꎬｒｐｓ１６
Ｓｍａｌｌ ｓｕｂｕｎｉｔ ｏｆ ｒｉｂｏｓｏｎｅ
ＲＮＡ 聚合酶 ＲＮＡ ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ ｒｐｏＡꎬｒｐｏＢꎬｒｐｏＣ１ ꎬｒｐｏＣ２
Ｉ
Ｉ
Ｉ
ｒＲＮＡ ｒｒｎ１６ ꎬｒｒｎ２３ ꎬｒｒｎ４.５ ꎬｒｒｎ５ Ｉ
Ｉ
Ｉ
Ｉ
Ｉ
Ｉ
Ｉ
ｔＲＮＡ ｔｒｎＩ￣ＣＡＵ ꎬｔｒｎＬ￣ＣＡＡ ꎬ ｔｒｎＶ￣ＧＡＣ ꎬ ｔｒｎＩ￣ＧＡＵ ꎬ ｔｒｎＡ￣ＵＧＣ ꎬ ｔｒｎＲ￣ＡＣＧ ꎬ ｔｒｎＮ￣
Ｉ
ＧＵＵ ꎬ ｔｒｎＬ￣ＵＡＧꎬ ｔｒｎＰ￣ＵＧＧꎬ ｔｒｎＷ￣ＣＣＡꎬ ｔｒｎＭ￣ＣＡＵꎬ ｔｒｎＶ￣ＵＡＣ ꎬ ｔｒｎＦ￣ＧＡＡꎬ
ｔｒｎＬ￣ＵＡＡ ꎬｔｒｎＴ￣ＵＧＵꎬｔｒｎＳ￣ＧＧＡꎬｔｒｎｆＭ￣ＣＡＵꎬｔｒｎＧ￣ＵＣＣꎬｔｒｎＳ￣ＵＧＡꎬｔｒｎＴ￣ＧＧＵꎬ
ｔｒｎＥ￣ＵＵＣꎬｔｒｎＹ￣ＧＵＡꎬｔｒｎＤ￣ＧＵＣꎬｔｒｎＣ￣ＧＣＡꎬｔｒｎＲ￣ＵＣＵꎬｔｒｎＧ￣ＧＣＣ ꎬｔｒｎＳ￣ＧＣＵꎬ
ｔｒｎＱ￣ＵＵＧꎬｔｒｎＫ￣ＵＵＵ ꎬｔｒｎＨ￣ＧＵＧ
光合作用 光学系统Ⅰ Ｐｈｏｔｏｓｙｓｔｅｍ Ⅰ ｐｓａＣꎬｐｓａＪꎬｐｓａＩꎬｐｓａＡꎬｐｓａＢ
Ｐｈｏｔｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ 光学系统Ⅱ Ｐｈｏｔｏｓｙｓｔｅｍ Ⅱ ｐｓｂＨꎬ ｐｓｂＮꎬ ｐｓｂＴꎬ ｐｓｂＢꎬ ｐｓｂＥꎬ ｐｓｂＦꎬ ｐｓｂＬꎬ ｐｓｂＪꎬ ｐｓｂＺꎬ ｐｓｂＣꎬ ｐｓｂＤꎬ ｐｓｂＭꎬ ｐｓｂＩꎬ
ｐｓｂＫꎬｐｓｂＡ
ＮＡＤＨ￣脱氢酶 ｎｄｈＢ ꎬｎｄｈＨꎬｎｄｈＡ ꎬｎｄｈＩꎬｎｄｈＧꎬｎｄｈＥꎬｎｄｈＤꎬｎｄｈＦꎬｎｄｈＣꎬｎｄｈＫꎬｎｄｈＪ
Ｉ
ＮＡＤＨ ｄｅｈｙｄｒｏｇｅｎａｓｅ ｐｅｔＤ ꎬｐｅｔＢ ꎬｐｅｔＧꎬｐｅｔＬꎬｐｅｔＡꎬｐｅｔＮ
细胞色素复合物
Ｃｙｔｏｃｈｒｏｍｅ ｂ / ｆ ｃｏｍｐｌｅｘ ａｔｐＢꎬａｔｐＥꎬａｔｐＩꎬａｔｐＨꎬａｔｐＦ ꎬａｔｐＡ
ＡＴＰ 合酶 ＡＴＰ ｓｙｎｔｈａｓｅ ｒｂｃＬ
二磷酸核酮糖羧化酶大亚基基因
Ｌａｒｇｅ ｓｕｂｕｎｉｔ ｏｆ ｒｕｂｉｓｃｏ
其他基因 翻译起始因子 ｉｎｆＡ
Ｏｔｈｅｒ ｇｅｎｅｓ Ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎａｌ ｉｎｉｔａｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒ
成熟酶基因 Ｍａｔｕｒａｓｅ ｍａｔＫ
蛋白酶基因 Ｐｒｏｔｅａｓｅ ｃｌｐＰ ＃
包膜蛋白基因 ｃｅｍＡ
Ｅｎｖｅｌｏｐｅ ｍｅｍｂｒａｎｅ ｐｒｏｔｅｉｎ
乙酰 ＣｏＡ 羧化酶的亚基 ａｃｃＤ ＃
Ｓｕｂｕｎｉｔ ｏｆ Ａｃｅｔｙｌ￣ｃａｒｂｏｘｙｌａｓｅ
Ｃ 型细胞色素合成 ｃｃｓＡ
Ｃ￣ｔｙｐｅ ｃｙｔｏｃｈｒｏｍｅ ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ
开放阅读框 ｙｃｆ２ ꎬｙｃｆ１ ꎬｙｃｆ４ꎬｙｃｆ３ ＃
Ｉ＃
＃
Ｏｐｅｎ ｒｅａｄｉｎｇ ｆｒａｍｅｓ
＃
注: Ｉ 表示该基因位于 ＩＲ 区ꎬ 表示该基因含有内含子ꎬ 代表假基因ꎮ
＃
Ｎｏｔｅ: Ｉ ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ｔｈａｔ ｔｈｅ ｇｅｎｅ ｉｓ ｌｏｃａｔｅｄ ｉｎ ｔｈｅ ＩＲ ｒｅｇｉｏｎꎬ ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ｔｈａｔ ｔｈｅ ｇｅｎｅ ｃｏｎｔａｉｎｓ ｉｎｔｒｏｎｓꎬ ａｎｄ ｒｅｐｒｅｓｅｎｔｓ ａ ｐｓｅｕｄｏｇｅｎｅ.